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Name : secD (KUI_1355) Accession : YP_006503014.1 Strain : Taylorella equigenitalis ATCC 35865 Genome accession: NC_018108 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein-export membrane protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1466459 - 1468348 bp Length : 1890 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATCGATACCCTCTCTGGAAATATTTAATTGTCTTAGTTGCTTTAATTTTTGGCTTGACTTATACATTGCCAAATAT ATTTGGGCAAACGGTTGCTGTACAGATTTCAAGCTTAAACGTAACCAAAAAAGTTGATGCGAATCTTCTTAGTTTTGCTG AGCAAACATTAAAACAAGCCAACATACCATTTGAAAATTCTCAAATTCAAGCTAATGGTCCTAATAACACTATTAGGATT AGGTTTAATAGTCCAAATGAGCAAATTCAAGCTAGGGGCATTCTTGAGAGGGCTCTTAATCCCAATCCAGAAGAACCAAA TTATGTTGTTGCTCTAAATTTACTTTCTGCGACTCCAAGTTGGTTGCAATCTTTAGGTGCTAATCCTATGGCTTTAGGTT TGGACCTCCGTGGGGGTGTACACTTCCTTCTTCAAGTTGATATGAAGGGTGCACTAAAATCAAGATACAACTCTTTAAAT ACCGAACTAAGGACTTTGTTTAGGGATAGTAAAATCACCGCTGAATCCATTCAATTAGAGGGTTCTACGATTACTGCTCT TTTCTCTAACGAAAAAGATGCAAACAAGGCAAAAGATGTTATTCGTCAAAGGCTTCCTGAGTTAACTACGCAATATGCAG AACAAAATGGCAAGCATGTTTTAACCAGTACCATTGCTCCAAACGAAGTTTCACGCGTTCAAGACACGGCTTTAAAACAA AATATAGTCACACTTCATAATAGGATTAATGAATTAGGTGTGGCAGAACCCATCATTCAACAACAAGGTAATGATAGGAT AGTAGTTCAATTACCAGGCGTACAGGATATTGCAAAGGCAAAAGACATTTTAGGTAGGACAGCTACACTTGAATTACGAT TAGTAGATGATAGTCCTACTGCATTAGCTTCTTTGGCTTCTGGTGTGGTTCCCTTTGGACTTGAAAAATTCAAGGGTACT GATGGACGTGACATTTTATTAAGAAGACAAGTCATTCTAACTGGTGAGAATCTTGAAGATGCTCAAGCTGGTCTTGATCC AAATGACAACTCACCTGCAGTTAATTTATCTCTTGATAGCAAGGGTTCGCGTATATTTAGAGATGTGACTCGCGATAATA TTAATAAAAGAATGGCTATTGTTCTTTTTGAAAAAGGTAAAGGACAAGTAGTTACATCACCAACTATTAGATCCGAAATC CCCAACGGTCAAGTTATGATTTCAGGTCATATGACTTCTACTGAAGCTGCCGATATTGCATTGCTATTACGTGCAGGTTC TTTAGCTGCTCCAATGAGTATCATTGAAGAGCGTACTATCGGCCCTAGCCTAGGCGAAGATAATATTAAAAAAGGATTCA GATCAACATGGGTAGGATTTGTATTAATCGCCCTGTTTATGATTTTGTATTACCGTTTGATAGGCGTATTTTCCACTCTA GGACTAGCATTTAACGTATTACTACTGTTAGCAGTTTTATCACTAATTCAAGCAACCTTAACATTGCCAGGTATCGCGGC TATTGCTTTAACTCTGGGTATGGCTATTGACGCTAATGTACTTATTAATGAGCGCATACGCGAAGAATTACGCGAAGGTG TTAACCCACAACAGGCTATAAATATAGGTTTTGAAAAAGCATGGGCAACTATTTTTGACTCTAACATAACCTCATTAATT GTTGGTATTGCACTTTTAGCATTTAGTGGACCTGGACCTATACGTGGATTTGCTGTAGTTCACGTTTTAGGAATTTTGAC TTCGATGTTCTCTGCAGTTGTTGGGGTTAGAGCTTTAGTTAATCTGTGGTATGGACGTAAGAAAAAACTTAAAAACATTT CCATCGGTACTGTATGGAAACCTAAAACTTCAAAAGAACTAAAAGCTTAG Protein sequence : MNRYPLWKYLIVLVALIFGLTYTLPNIFGQTVAVQISSLNVTKKVDANLLSFAEQTLKQANIPFENSQIQANGPNNTIRI RFNSPNEQIQARGILERALNPNPEEPNYVVALNLLSATPSWLQSLGANPMALGLDLRGGVHFLLQVDMKGALKSRYNSLN TELRTLFRDSKITAESIQLEGSTITALFSNEKDANKAKDVIRQRLPELTTQYAEQNGKHVLTSTIAPNEVSRVQDTALKQ NIVTLHNRINELGVAEPIIQQQGNDRIVVQLPGVQDIAKAKDILGRTATLELRLVDDSPTALASLASGVVPFGLEKFKGT DGRDILLRRQVILTGENLEDAQAGLDPNDNSPAVNLSLDSKGSRIFRDVTRDNINKRMAIVLFEKGKGQVVTSPTIRSEI PNGQVMISGHMTSTEAADIALLLRAGSLAAPMSIIEERTIGPSLGEDNIKKGFRSTWVGFVLIALFMILYYRLIGVFSTL GLAFNVLLLLAVLSLIQATLTLPGIAAIALTLGMAIDANVLINERIREELREGVNPQQAINIGFEKAWATIFDSNITSLI VGIALLAFSGPGPIRGFAVVHVLGILTSMFSAVVGVRALVNLWYGRKKKLKNISIGTVWKPKTSKELKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 4e-90 | 41 |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-90 | 41 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-90 | 41 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-90 | 41 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-90 | 41 |