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Name : RM11_0379 (RM11_0379) Accession : YP_006664832.1 Strain : Bartonella quintana RM-11 Genome accession: NC_018533 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein cycK Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 485572 - 487560 bp Length : 1989 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGCTTGTTGAACTGGGTCATATTTTTTTAGCCGCAGCATTTGCAGTGAGTTTAATGCAGGCATTTTTACCTGCTTTGGG TGTTTGGTGGGAGGATCATTCATTGATGCGAACAGCAGTTCCCTTCACCTATATTACTTTTACATTATTGCTCTTATCTT TTTTGATTATTGTTCATGCCCATATGGTATCTGATTTTTCTGTTTTAAATGTTGTTGAGAATAGCCATTCTGAAAAACCA ATGCTTTATAAGATTACTGGTGTTTGGGGAAATCACGAAGGATCCATGTTGTTATGGGTTTTAAGTCTTGCTTTTTTCAG TACATTGATGGCATTATTTAGCCAACATTTACCAGAACAGTTTAAGACATTAATTTTAGTTTGCCAAAGTTGGATTATAA GTGCCTTTCTTGTATTTGTTCTTTTTTTATCGAATCCATTTTTACGTATTAATCCACCGGCATTGCAGGGAAATGATCTC AATCCTCTTTTGCAAGATATCGCTTTAGCAATTCATCCACCACTTCTTTATTTAGGCTCTGTCGGTTTTTCTCTTTGTTT TTCTTTTGCAGTAGCTGCATTGGTTATGGGACATATCGATGGACGTTGGGCGCATTGGGTTCGTCCTTGGCTTCTTCTTG CTTGGTGTTTTTTGACACTAGGCATTATGGTTGGGTCCTATTGGGCTTATTATGAGTTAGGATGGGGTGGTTATTGGTTT TGGGATCCAGTTGAAAATGCTTCGTTTATGCCCTGGCTTTCAGGAACAGCTTTTTTGCATTCTGCTCTTGTTCTGGAAAA GCGGGAAACATTAAAAAGTTGGACTTTATTTTTGGCACTTCTTACTTTTTCTCTTTCTCTTATGGGAACTTTTCTTGTTC GTTCAGGTCTTTTAGTATCTGTTCACAGTTTTGCCATTGATCCAGCACGTGGGCGGGCAATTCTTGCACTTTTATTCTTT TTCACCGGAGGAGCTTTTTTTCTCTTTGCTTTGCGCGTACCCATTTTAAAAGCAGGTAGATTATTTCGGCCAATTTCACG TGAAGGTTTTATTGTTTTAAATAATCTCTTGCTTACAACAATAACAGCGACAGTATTGATTGGTACGCTCTATCCTTATT TTATTGAGGCATTGACTGGAAAAAAAATTTCTGTAGGTGCCGCTTTTTTTAACATTACCTGTGGTCCTTTAATGATATTA TTGTTGTTGTTGGTTCCGTTTGGATCAATGATGGTATGGAAAAGCGGTGATTTTCTTGCGGTTTTTGAACGGTTGTGGGT TGTTTGCGTATTAGCCTGTGTAGCCTGTTTTATAACGTTTTATGCAACATCTTTGCGTGATATTTTTGCAGCTTTAGGAA TAGGACTTTCAGTTTTTGTTTTTTTAGGCAGTTTAGCTGATCTTTGGAAGAAAAGTGGACATCACAAGTTAGCTTTGTCG GTGCGGTTTAAGAGATTTATTGGATTGCCATGGTCAGTTTTTGGTGCAGCAATGGCACATATGGGATTAGCTGTTACATT GTTTGGTATTGTCTGTGTTGCGACTTTTGCTCAAGAGCGTATTTTAACCATGCACATAGGAGATAGGGTTACAATAGCGG GTAAAACTATTTGCTTTGACAAAGTGCATGAAAGCGCCGGTCCGAATTATTCTGCAATGGAGTTTAATTTTACAGTCTAT GAAAACAAACATGCAGTCCGCAACGTAATAGCATCAAAACGTTTCTATTCAAGCCAGAACATATCAACAACAGAAGTTGG TATTCAAAATCATGGCTTATTATCCCAATTATATATTGCACCGGGCCATATAGATGATCAAGGGCTTGTTGTGCATCTAT GGTGGAAGCCTTACGTGATTTGTGTATGGTTAGGGGCAATAATGATGGCTATGGGGGGGTGTTTTTCTCTTTTTGGTTAT TGGTTTCGCATTGGGTTGCATCGACGGATAGCTTCCCGCTTCAAGTTTTCTGAAAAGGCTTTGAGATGA Protein sequence : MLVELGHIFLAAAFAVSLMQAFLPALGVWWEDHSLMRTAVPFTYITFTLLLLSFLIIVHAHMVSDFSVLNVVENSHSEKP MLYKITGVWGNHEGSMLLWVLSLAFFSTLMALFSQHLPEQFKTLILVCQSWIISAFLVFVLFLSNPFLRINPPALQGNDL NPLLQDIALAIHPPLLYLGSVGFSLCFSFAVAALVMGHIDGRWAHWVRPWLLLAWCFLTLGIMVGSYWAYYELGWGGYWF WDPVENASFMPWLSGTAFLHSALVLEKRETLKSWTLFLALLTFSLSLMGTFLVRSGLLVSVHSFAIDPARGRAILALLFF FTGGAFFLFALRVPILKAGRLFRPISREGFIVLNNLLLTTITATVLIGTLYPYFIEALTGKKISVGAAFFNITCGPLMIL LLLLVPFGSMMVWKSGDFLAVFERLWVVCVLACVACFITFYATSLRDIFAALGIGLSVFVFLGSLADLWKKSGHHKLALS VRFKRFIGLPWSVFGAAMAHMGLAVTLFGIVCVATFAQERILTMHIGDRVTIAGKTICFDKVHESAGPNYSAMEFNFTVY ENKHAVRNVIASKRFYSSQNISTTEVGIQNHGLLSQLYIAPGHIDDQGLVVHLWWKPYVICVWLGAIMMAMGGCFSLFGY WFRIGLHRRIASRFKFSEKALR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 7e-66 | 41 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 6e-81 | 41 |
