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Name : HIMB5_00011510 (HIMB5_00011510) Accession : YP_006757072.1 Strain : alpha proteobacterium HIMB5 HIMB5 Genome accession: NC_018643 Putative virulence/resistance : Unknown Product : malate synthase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.3.3.9 Position : 1064799 - 1066961 bp Length : 2163 bp Strand : + Note : PFAM: Malate synthase; TIGRFAM: malate synthase G DNA sequence : ATGACTAATACATACAAAAATATCGGAAATTTAAAAGTCTCGGAAATTTTAGCTGATTTTGTAAATAAAGAACTATTAGA AGGAACAAATCTTAAGCCTGAAAAATTTTGGGAAGGTTTTGAAAAAGTCATACATGAGTTGGCGCCCAAGAATAAAGAAC TTATTAACATAAGAGAAGATATTCAAAATAAAATTAACGACTGGCATAAAGCAAATAAGGGAAATGAAATACATTTAGAA AATTATAAAAAGTTTCTTAAAGATATAGGGTACTTAAAAGAAGAAGGGCCTGATTTTAAAATTGAAACCAAAAATGTTGA TAAAGAAATCACATCTGTAGCTGGGCCTCAACTTGTTGTTCCAATAATGAACGCAAGATATGCTCTAAATGCTGCTAACG CTCGATGGATGAGTTTATATGATTCTTTGTATGGAACTGATGTAATTGAAGAATCTGAAGATAGTACATCACAAAGATAT GACCCTGAAAGAGGAGAACTTGTAATTAAATATGGAAGAGAATTTTTAGATAAATATTTTCCTTTAAACGATTTTAGTTG GAAAAAAATTACTGGTACGGCAATTCAAGATGGTGAATTGAAAGTTCTAAAAGGTATTGATGTTACAACATTGAAAGAAA CAAATAAGTTTATAGGTCACCGTGGAGAAGCAGACAACCCTTCTGCAATAATTCTAAAAAATAATAACCTTCATATTGAG ATATTAAAAAATCCAAGAGCATTTAGTGCGCAACAGGATCATGCTGGTATAAGTGATATTATTTTAGAATCAGCTATTTC TACTATCTGTGATAACGAAGATAGTGTTGCTGCAGTTGATGCTGAAGATAAAATCCTTTGTTATAGAAATTGGTTGGGTT TAATGAAGGGTGATCTAGTTAGTCGGTTTGAGAAAGAAGGTAAAACATTAGAGAGAAAATTAAACCCAAACAGAAGTTAT ATTTCAAAAGATGGTAAAGGATTAAAACTTCATGGAAGAAGTTTGTTGCTAGTAAGAAATGTTGGACATTTAATGACTAA TCCATCAATTTTATTAAAAGATGGAAATGAAATTCCAGAAGGCTTAATGGATGCATTCATTACTACAGCTGCAGCCCTTC ATGATTTTAAAAGAAAAGGTAATTCTAGAACTGGTTCAATTTATATTGTTAAACCAAAAATGCATGGACCAGATGAAACT GCATTTACAGATGAAATTTTCACAAAAGTTGAAGAAGTGTTAGGTCTAGAAAAGTATACTTGTAAAATTGGAATTATGGA TGAAGAAAGAAGGACATCATCAAACCTTAAAGAGTGTATCAGATCTTTAAAAAATAGAGTCTTCTTTATTAATACTGGTT TCTTAGACCGTACAGGTGATGAGATGCATACATCTATGGAAGCTGGTCCAATGATTAAAAAAGGAGATATGAAATCTTCT AAGTGGATACAAGCCTATGAAAATAATAACGTTGATATTGGATTGTCGTGTGGATTTTCTGGTAAAGCACAAATAGGAAA AGGTATGTGGGCAATGCCAGATAAGATGAAAGATATGCTAGAACAAAAAACTGGTCATCTTAAAGCAGGAGCAAATTGTG CATGGGTTCCTTCGCCTACGGCTGCAGCAATTCATGCTCTTCATTATCATGAGATTGATATATTTAATGTTCAAAAAGAA TTAACAAAAAGACAAAAAGCTAAACTTGATGATTTATTGACAATTCCAGTTGCTGATAGACCGAACTGGTCTGTAGATGA AATAAATCAGGAAATTTCCAATTCTGCTCAAACACTGTTAGGTTATGTAGTAAGATGGGTCGATCAAGGTGTTGGATGTT CAAAAGTTCCTGACATAAATAATATTGGTTTAATGGAAGATAGAGCAACATTAAGAATTTCTTCACAACACATTGCAAAC TGGATACATCACGGAATAACCACAAAAATTCAAGTTACAGAAATAATGAAAGAAATGGCAAAAGTAGTTGATGAACAAAA CAAAAACGATCCTAAGTATATTAAAATGAGTGAAAATTTTGACAATTCTATTGCCTTTAAAACTGCTTGTGATTTAATTT TTAAGGGCACTAAACAACCTTCAGGTTATACAGAACCTTTATTGCATCAAAATAGATTGGAAATTAAATCTAATCTGAAC TAG Protein sequence : MTNTYKNIGNLKVSEILADFVNKELLEGTNLKPEKFWEGFEKVIHELAPKNKELINIREDIQNKINDWHKANKGNEIHLE NYKKFLKDIGYLKEEGPDFKIETKNVDKEITSVAGPQLVVPIMNARYALNAANARWMSLYDSLYGTDVIEESEDSTSQRY DPERGELVIKYGREFLDKYFPLNDFSWKKITGTAIQDGELKVLKGIDVTTLKETNKFIGHRGEADNPSAIILKNNNLHIE ILKNPRAFSAQQDHAGISDIILESAISTICDNEDSVAAVDAEDKILCYRNWLGLMKGDLVSRFEKEGKTLERKLNPNRSY ISKDGKGLKLHGRSLLLVRNVGHLMTNPSILLKDGNEIPEGLMDAFITTAAALHDFKRKGNSRTGSIYIVKPKMHGPDET AFTDEIFTKVEEVLGLEKYTCKIGIMDEERRTSSNLKECIRSLKNRVFFINTGFLDRTGDEMHTSMEAGPMIKKGDMKSS KWIQAYENNNVDIGLSCGFSGKAQIGKGMWAMPDKMKDMLEQKTGHLKAGANCAWVPSPTAAAIHALHYHEIDIFNVQKE LTKRQKAKLDDLLTIPVADRPNWSVDEINQEISNSAQTLLGYVVRWVDQGVGCSKVPDINNIGLMEDRATLRISSQHIAN WIHHGITTKIQVTEIMKEMAKVVDEQNKNDPKYIKMSENFDNSIAFKTACDLIFKGTKQPSGYTEPLLHQNRLEIKSNLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcB | CAE85241.1 | GlcB protein, malate synthase G | Not tested | PAI V 536 | Protein | 0.0 | 57 |
