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Name : HIMB5_00014440 (HIMB5_00014440) Accession : YP_006757358.1 Strain : alpha proteobacterium HIMB5 HIMB5 Genome accession: NC_018643 Putative virulence/resistance : Unknown Product : FAD-dependent oxidoreductase family protein,FAD-binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1318252 - 1319745 bp Length : 1494 bp Strand : + Note : PFAM: FAD binding domain; FAD linked oxidases, C-terminal domain; TIGRFAM: glycolate oxidase, subunit GlcD DNA sequence : ATGGAGTTAGCTTTACCTAAAATTGATCAAAAAACGATAGATAACAAAAATTCTATTGTTAAAAATTTATGTAAGCTGAC AAATCCAGAAAATGTTTTAAGTCATGCAGATGAAATAAAACCATACGAGACAGATGCGCTAGCTGCATACACTCAAACAC CTTTAGCAGTTGTACTTCCAGAAAATACTGATGAAGTAAGTGAAATCTTAAAATATTGTCACAAAGAAAATATTAAAGTA ATTCCAAGAGGTGCTGGCACTGGTTTATCTGGAGGAGCATTACCATTGCAAGATGCAGTTATTCTTGGTTTGGGAAAATT TAATAAAATTTTAAATATAGATTTTCCAAATAAATGTGTCGTTACTCAACCAGGTGTAACAAATTTAGGAATAACGCATG CTGTTCAACACAAAGGTTTCTATTATGCGCCAGATCCTTCTAGTCAATTAGCTTGCTCTATTGGAGGTAATGTTGCTGAA AATTCAGGTGGAGTACACTCACTTAAATATGGAACAACTACAAACAACATTCTTGGTGTTGAAATGGTCATGATGGATGG AACCATCTGTAGATTTGGTGGAAAAGCGTTAGATCAAGAAGGTTATGATTTGATGGGATTAATTTGTGGATCCGAGGGTT TATTAGGAGTTGTTACAGAGGTAACAGTAAAGATTTTAAAAAAACCACAAGTAGTTAAAGCTGCATTGATTGGTTTTCCT TCAATTAAAGAAGGTGGTGATGCAGCATCAGAAATAATTTCAAGCGGAATTGTTCCAGCAGGTATGGAGATTATGGATAG AGCATTAATTGAAGCAACTGACAACTTTAGTAAAGCAGGATATCCAAGAGATGCAGAATTACTTTTAATTGTAGAGCTTG ATGGAACAGAGTCTGAAGTAAATGAGTTATTAAAAAAAGTAAGTGAAATTTCTAAGAAGAATAATTGTTCAAGTTTAAAA CTTAGTAAAAATGAACAAGAAAGATTAAAATTTTGGGCTGGTAGAAAAGCAGCGTTTCCAGCATGTGGAGCAATGGCTCC AGATTATTATTGTATGGATGGAGTTATACCAAGAGGAAAACTTGCAGAGGCACTTCTCGAAATAAAAAAACTTTCTGAAA AATATGATTTACCCGTTGCAAACTGTTTTCATGCAGGTGATGGAAACTTACACCCATTAATTATGTTTGATGGCAGTGAC AAAGAACAGTTAAGAAAAACAGAAGAATTTGGAGCTGAAATTTTAAAAACTTGCGTAAAATTAGGTGGAGTTATTACAGG AGAACATGGAGTTGGAATAGAAAAAAGAGAACTAATGTGCGAAATGTTTAATAATACAGATATTCAGCAACAACTCGATA TTAAAAAATCTTTAGATGAAAAAAATTTATTAAACCCTGGAAAGGTTTATCCAATTCTAAGAAAATGTGCAGAGGAAGGA AGGGTTCATGTCCACACAAGTAAGAACAAATTCCCAGATCTTCCAAGATTCTAA Protein sequence : MELALPKIDQKTIDNKNSIVKNLCKLTNPENVLSHADEIKPYETDALAAYTQTPLAVVLPENTDEVSEILKYCHKENIKV IPRGAGTGLSGGALPLQDAVILGLGKFNKILNIDFPNKCVVTQPGVTNLGITHAVQHKGFYYAPDPSSQLACSIGGNVAE NSGGVHSLKYGTTTNNILGVEMVMMDGTICRFGGKALDQEGYDLMGLICGSEGLLGVVTEVTVKILKKPQVVKAALIGFP SIKEGGDAASEIISSGIVPAGMEIMDRALIEATDNFSKAGYPRDAELLLIVELDGTESEVNELLKKVSEISKKNNCSSLK LSKNEQERLKFWAGRKAAFPACGAMAPDYYCMDGVIPRGKLAEALLEIKKLSEKYDLPVANCFHAGDGNLHPLIMFDGSD KEQLRKTEEFGAEILKTCVKLGGVITGEHGVGIEKRELMCEMFNNTDIQQQLDIKKSLDEKNLLNPGKVYPILRKCAEEG RVHVHTSKNKFPDLPRF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-114 | 51 |
