Gene Information

Name : ASU2_00560 (ASU2_00560)
Accession : YP_006816493.1
Strain : Actinobacillus suis H91-0380
Genome accession: NC_018690
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : di- and tricarboxylate transporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 107606 - 108961 bp
Length : 1356 bp
Strand : +
Note : COG0471 Di- and tricarboxylate transporters

DNA sequence :
ATGCGTAATAATGTCATTTTTATTGCGAATGTTGCATTGTTTTTCATTCTTCTCAATACATTACCTTTTGCGCCTGAAGC
GAATAAAGGCTTAGCGTTATTAGTATTTGTTGCTGTATTGTGGCTCACTGAAGCTTTACATGTCACTGTAACAGCTTTAC
TCGTTCCAATTCTTTCGATTGCATTAGGATTGGTTAAATCTAAAGATGCATTAGTGGCATTTGCTGATCCGACAATTTTC
CTTTTCTTTGGTGGTTTTGCCTTAGCGACCGCATTACATATTCAGCAATTAGATCGTCTCATTGCGAATAAAATTATGGC
AATGGCAAAGGGTAAACTTTCTGTTGCGGTGATTTATTTGTTTGCGGTGACAGCATTCCTTTCAATGTGGATGAGTAATA
CTGCAACCGCTGCGATGATGTTACCGTTGGCGATGGGAATTTTAAGCAAATTGGATCGCTCTCAACATCATAATACTTAT
GTATTCGTATTACTGGGTATTGCTTATAGTGCAAGTATTGGTGGAATGGGAACCTTGGTTGGCAGTCCGCCGAATGCGAT
CGTGGCGTCACAATTGCATCTGTCATTTGCAGACTGGATGAAATATGGTTTACCGATTATGTTTATCTTGCTGCCGGTAA
TGGTTGGCGTGCTGTATGTCGTGTTTAAGCCTAAATTTAATGTGAAGTTTGAACAAACTTTTGAAAAAATTGAGCTTAAT
CGTGATCGTATTCTAACCTTGGTTATTTTCGTTTTCATTGCTTTAAGCTGGGTGTTTAGCTCTCAATTGAATCCGATCAT
TTCAGGTTTATTAGGGTTAAAAGGCAATATCGGTAGCTTTGATAGTATTATGGCAATGGTTGCTGCCGCACTAATTTGTA
TTACCCGTGTGGCAACTTGGCAACAGGTTCAAGAGAATACCGAATGGGGCGTATTATTCCTATTTGGTGGTGGTTTAACC
TTGAGTGCGGTACTTGGTCAAACCGGTGCAAGTAAAATTATGGCGGATGGAATTGTTGCTTTAATTGACGGTAGCCACTT
TTATGTAATTGGGTTAATTGTTGCTGCCTTTATTATTTTCTTAACCGAATTTACTTCAAATACGGCAAGTGCGGCGTTAT
TAGTGCCGATCTTTATCTCGATTGCACAAGCGCTTAATATGCCACCGCTTGGTTTAGCGTTAATCATTGGTTTAGGCGCA
AGCTGTGCCTTTATGTTGCCGGTGGCAACGCCGCCGAATGCGATTGTATTCGGAACGGGACAAATTAAACAAAATGAAAT
GGTTAAAGCCGGTTTCTGGTTAAATATCATTTGTGTTGTGGTAATTGCTACTATCGGCTATGTATTTTGGTTATGA

Protein sequence :
MRNNVIFIANVALFFILLNTLPFAPEANKGLALLVFVAVLWLTEALHVTVTALLVPILSIALGLVKSKDALVAFADPTIF
LFFGGFALATALHIQQLDRLIANKIMAMAKGKLSVAVIYLFAVTAFLSMWMSNTATAAMMLPLAMGILSKLDRSQHHNTY
VFVLLGIAYSASIGGMGTLVGSPPNAIVASQLHLSFADWMKYGLPIMFILLPVMVGVLYVVFKPKFNVKFEQTFEKIELN
RDRILTLVIFVFIALSWVFSSQLNPIISGLLGLKGNIGSFDSIMAMVAAALICITRVATWQQVQENTEWGVLFLFGGGLT
LSAVLGQTGASKIMADGIVALIDGSHFYVIGLIVAAFIIFLTEFTSNTASAALLVPIFISIAQALNMPPLGLALIIGLGA
SCAFMLPVATPPNAIVFGTGQIKQNEMVKAGFWLNIICVVVIATIGYVFWL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf77 AAO17231.1 Orf77 Not tested tcd island Protein 7e-93 62