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Name : ASU2_10960 (ASU2_10960) Accession : YP_006818559.1 Strain : Actinobacillus suis H91-0380 Genome accession: NC_018690 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2400815 - 2402755 bp Length : 1941 bp Strand : + Note : COG1138 Cytochrome c biogenesis factor DNA sequence : ATGATTGCGGAATTAGGCAATTATGGCTTAGCACTTGCGTTAGGATTGTCAATTTTATTGGCAATCTTACCGCTTATCGG TGCACAGAAAGGTAATATCACCTTAATGTCGTTAGCTCGCCCGATGACATGGGGAATGTTTCTTGCGTTAACGATTTCAT TCGGCTCACTTTTCTATTTATTTGCCGTAAATGATTTTAGTGTGCAGTATGTGGTGAATAACTCGAATTCAACCTTACCG CTACAATACCGTTTATCGGCGGTCTGGGGCTCTCATGAGGGCTCTCTATTGCTTTGGATTTGGCTATTATCACTTTGGGC GGTTGCTGTAGCTGCCTTTAGTCGTCAGATGCCGGAAGAAGCCGTGGCGCGCGTATTGAGTATCATGGGCTTAATTAGTA TTGGATTCTTATTATTTATTATTTTTAGTTCGAATCCGTTTGATCGTACCTTCCCTAATTTCCCGGCAGACGGTCGAGAA TTAAACCCGATGTTGCAAGATGTCGGCTTAATTTTCCATCCGCCGTTATTATATATGGGATATGTCGGGTTCTCGGTGGC ATTCGCCTTTGCGATTGCTTCCCTAATGACCGGCAGATTGGATACCGCTTGGGCACGCTGGTCTCGTCCTTGGACCATGG CAGCTTGGGTATTTTTAACGCTAGGTATCGTGTTAGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAATTAGGCTGGGGCGGCTGGTGG TTCTGGGATCCTGTCGAGAATGCTTCTTTAATGCCTTGGATTGCCGGCACAGCGCTGATTCATTCCTTAGCGGTCACGGA AAAACGCAGTACCTTTAAAGCTTGGACAGTGTTACTTGCTATCTTAGCATTTTCGCTTTGCTTGCTAGGTACGTTCTTGG TGCGTTCAGGCATATTGGTTTCGGTGCATGCGTTTGCGTCGGATCCAACACGTGGTTTATATATCTTGGCTTATTTAGTG CTGGTTATTGGCGGCTCATTATTACTTTATGCCTTCCAAGGTTCGAAAATTAAAAGTTTAGATAATTATGAACGTTATTC ACGTGAATCAATGTTGTTAATTAATAATATTTTATTAATGGCATTTTTATCCGTGGTATTTTTAGGTACGATTTTACCGC TAATTCATAAGCAGATCGGTTTAGGCTCAATCTCTATTGGTGCGCCGTTCTTTGATCAAATGTTTGTTATCTTAATGGTA CCGTTTGCCTTTATTTTGGGTATCGGCCCATTAGTGAAATGGCGTAGAGATCAAATTTCAGCGATTCGTACGCCGGTACT TATCTCATTAGTATTAATGACGGTGCTTGGTTTTGCATTACCATATTTGTTTGCTGATCGTATTACCGCAACCTCTGTGT TAGGGGTAATGATGGCGGCAATTATCGTTATTTTGAGCTTATATGAATTACATCAACGTGCGACACATCGCCATACCTTC TTTAGCGGCATTTTTAAATTATCTCGTTCGCATTGGGGGATGGTGTTAGCGCATGTTGGGGTAGCGATGACCGTATTTGG TATCGCATTTAGTCAGAATTTTAGTATTGAGAAAGACGTTCGTATGAACGTGGGCGATCAAGTACAAATTCTGGATTACA ATTTTGAATTTAAAGGAATCAAGATTACTGACGGAGTGAACTACCAAGGTGGCACAGCAGAAATTGCAATTACTAAAAAC GGTGAATATGAAGCAACCTTAAATGCAGAAAAGCGTTTTTATAACGTGAGTAAAATGGGTATGACCGAAGCGGCGATTGA TTGGGGTTTTAGCCGAGATCTTTATGCTGCTTTAGGTGAAAAGCTTGAAGACGGCTCATGGGGCGTTCGTTTATATTACA AACCGTTTATTCGTTGGATTTGGCTTGGCGGGTTATTTATGGCGTTAGGCGGTTTATTATGTATGATGGATAAACGCTAT CGCGTTCGTATTCATGCCTAA Protein sequence : MIAELGNYGLALALGLSILLAILPLIGAQKGNITLMSLARPMTWGMFLALTISFGSLFYLFAVNDFSVQYVVNNSNSTLP LQYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLSLWAVAVAAFSRQMPEEAVARVLSIMGLISIGFLLFIIFSSNPFDRTFPNFPADGRE LNPMLQDVGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGRLDTAWARWSRPWTMAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASLMPWIAGTALIHSLAVTEKRSTFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV LVIGGSLLLYAFQGSKIKSLDNYERYSRESMLLINNILLMAFLSVVFLGTILPLIHKQIGLGSISIGAPFFDQMFVILMV PFAFILGIGPLVKWRRDQISAIRTPVLISLVLMTVLGFALPYLFADRITATSVLGVMMAAIIVILSLYELHQRATHRHTF FSGIFKLSRSHWGMVLAHVGVAMTVFGIAFSQNFSIEKDVRMNVGDQVQILDYNFEFKGIKITDGVNYQGGTAEIAITKN GEYEATLNAEKRFYNVSKMGMTEAAIDWGFSRDLYAALGEKLEDGSWGVRLYYKPFIRWIWLGGLFMALGGLLCMMDKRY RVRIHA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-148 | 63 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 8e-121 | 51 |
