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Name : secD (Q91_1265) Accession : YP_006837805.1 Strain : Cycloclasticus sp. P1; MCCC 1A01040 Genome accession: NC_018697 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase subunit SecD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1344695 - 1346554 bp Length : 1860 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGACGAATCATTTTCCTGCTTGGAAGAACTTAATGATAATAATGGCGTTAGTTGTTGCTATTATTTACGCACTACCAAA TCTTTACGGTGAAGACCCTTCTGTACAAATTTCGCCTTTGCGTGGTGCGGTCATCAACAGTTCTGTTTTAGCTGATGTAA AAGATCAGCTAGCACAAAATGGTGTTGCCTTATTAAAAGGTGAGTTGAATGACAGCCAAATTTTGTTGCGCTTCAAGCAT TCGAATGATCAACTTAAGGCGGTTGATATTATTAAGTCGGTCTTAGGGAATAACTATGTTGTGGCTCTTAATTTGGCGCC AACAACCCCTCAATGGTTGCGTTCGTTAAATGCAGCGCCTATGTATTTAGGCTTGGATTTAAGAGGTGGTGTGCATTTCT TACTGGAAGTGGATATGCAAGCTGCTGAGAAGCAAGCAGTAGACCGTGGTGCGGCTGATTTTCGCCAATATTTGCGCGAA AATAAATTGCGTTATCTAAGCGTTATGGTCAATGGCCACAATGTTGGTATTAAATTTAGAAACCAACAGATTCATGACGA GGCGATCAGCAAATTGGAGTCTCAGTTCCGTACTTGGGACTTTAAGCCTGAAGTTAGCGAGTCTTCAACGCCCACCTTAA CGGCAACGATGTCAGATGATGAGTTAATGGACGTAAGAAACTATGCTGTTCAGCAAAATATCATTACGTTAAAAAATCGT GTTAATGAGTTAGGTGTTGCAGAGCCTGTTATTCAAAGACAGGGTGAAAGCCGTATTGTTGTTGAATTACCTGGTGTCCA GGACACGGCTCGTGCAAAAGAGATTTTAGGTGCAACTGCCACACTTGAGTATCATCTGGTTGATACGCAAAATTCAGTGT CATCTGCATTAGCTGGAAGAGTGCCGATTGGCTCTAAGTTATATAACCGTCGAGATGGTGGCCAAATCCTGTTGAAAAAA CAGGTTATTGTGACTGGTAATGAGATTGTAGATGCTTCATCAGGGATAGAAGGTGATACAGGCTCCGCGATGGTTTCTGT GTCATTAGATGGTCCAGGTGGTAAAAAAATGAGCAAAACCACACGAGAAAATATTGGTAAACCAATGGCGGTTGTATTTA TTGAAAATAGAACCGATATAAAAATGGTTAACGGCGAGCCGGTACGCTACAAAACAGTCGTCGAGGAAGTGATTAATGTG GCGACCATTCGTGGGCACTTTAGTAACCGTTTTCAAACAACAGGCTTAGATAATTCAGCTGAAGCACGTGATCTAGCTTT ATTATTAAGAGCAGGTGCCTTGGCTGCGCCGATTGATATTGTTGAAGAGCGCACGGTTGGGCCAAGCCTAGGGCAAGATA ATATTGATAAAGGCTTCAATTCTGTGATGATTGGTTTTGTTTTAGTCTTAATTTTTATGGCTATTTATTACAAGACATTC GGCCTTTTTGCCGATGTGGCCTTGGCCTTTAATCTGGTTTTTATCGTTGCTGTCTTGTCACTCTTGCAAGCCACGTTAAC GCTGCCTGGAATTGCCGGCATTGTGCTAACAGTGGGGATGGCGGTAGATGCTAATGTGCTAATTTTTGAGCGCATTAAAG AGGAGATTAAAAATGGAAACTCACCTCAAGCTAGTATTGCGGCGGGCTACGATAAAGCCTTTTCTACCATTGCGGATGCA AATATCACGACATTGATTGCCGCGATTATCCTTTTCGGTTTTGGTACAGGGCCTATTAAAGGTTTCGCTATTACCTTAAG TATCGGTATTTTAACCTCTATGTTCACCGCTATTATTGGTACGCGTGCATTAGTTAATGTGACTTTTGGTAGTCGTCAAA TAGAAAAACTGAAGATTTAA Protein sequence : MTNHFPAWKNLMIIMALVVAIIYALPNLYGEDPSVQISPLRGAVINSSVLADVKDQLAQNGVALLKGELNDSQILLRFKH SNDQLKAVDIIKSVLGNNYVVALNLAPTTPQWLRSLNAAPMYLGLDLRGGVHFLLEVDMQAAEKQAVDRGAADFRQYLRE NKLRYLSVMVNGHNVGIKFRNQQIHDEAISKLESQFRTWDFKPEVSESSTPTLTATMSDDELMDVRNYAVQQNIITLKNR VNELGVAEPVIQRQGESRIVVELPGVQDTARAKEILGATATLEYHLVDTQNSVSSALAGRVPIGSKLYNRRDGGQILLKK QVIVTGNEIVDASSGIEGDTGSAMVSVSLDGPGGKKMSKTTRENIGKPMAVVFIENRTDIKMVNGEPVRYKTVVEEVINV ATIRGHFSNRFQTTGLDNSAEARDLALLLRAGALAAPIDIVEERTVGPSLGQDNIDKGFNSVMIGFVLVLIFMAIYYKTF GLFADVALAFNLVFIVAVLSLLQATLTLPGIAGIVLTVGMAVDANVLIFERIKEEIKNGNSPQASIAAGYDKAFSTIADA NITTLIAAIILFGFGTGPIKGFAITLSIGILTSMFTAIIGTRALVNVTFGSRQIEKLKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 5e-118 | 46 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-118 | 46 |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 9e-118 | 46 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-118 | 46 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-118 | 46 |
