Name : glcD (ANA_C12928) Accession : YP_006997441.1 Strain : Genome accession: NC_019427 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate oxidase subunit GlcD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.1.3.15 Position : 3294878 - 3296347 bp Length : 1470 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCTTACCAAAAATAAAAAAGAAATCAACTGGAAACCTATTATCAAAAAATTTGTCGCTGTAGTTGGTGAAAAAGGCGT AGTTCAACGCAAAGAAGAACTTCTCACCTATGAATGTGACGGTTTAACCAGCTATAAACAATGTCCCCCAGTCGCAGTAT TACCCAGAACCACAGAACAAGTCTCAGAAATTGTCAAAATTTGCAATCAATATTCCGTTCCCTTCATTGCTAGAGGTTCA GGAACAGGTTTATCTGGTGGGGCTTTACCAACGGAAAATTCTGTTTTAATTGTCACTTCTTTAATGCGACAAATCCTTAG TATTGATTTAGAAAATCAACGGGCTGTAGTGCAACCAGGAGTAATTAATAGTTGGGTGACTCAAGCTGTTAGTGGTGCTG GTTTTTACTTTGCACCTGACCCTTCTAGTCAAATTATTTGTTCTATTGGTGGCAATATTGCCGAAAATTCTGGAGGAGTC CATTGTTTAAAATATGGTGTGACAACAAATCATGTTTTGGGCTTAAAACTTGTCCTTCCTAACGGTGAAATAGTTGATGT TGGTGGACAAATTCCCGAAACCCCAGGTTATGATTTACCTGGTGTATTTGTGGGTTCAGAAGGAACATTAGGAATTGCCA CAGAAATCACCCTGAAGATTCTCAAGAGTGCGGAATCTATTTGTGTCTTACTAGCAGATTTTACTAGCGTAGATGCTGCG GCTGCCACCGTTTCTGATATTATTAGCGCGGGGATTATTCCCGGTGGCATGGAAATGATGGATAATATTAGTATCAATGC TGTAGAAGATGTTGTTGCCACTAATTGTTATCCTCGTGATGCGACGGCAATTTTGTTAGTAGAAATTGATGGTTTAGAAG TAGAAGTTTCTGCCAATAAACAGCGAGTCATAGAAATTTGCAAAAAGAATGGGGCGCGAAATGTTACTAGTGCTAGTGAC CCAGAAACTAGATTAAAATTATGGAAAGGCAGAAAAGCAGCTTTTGCGGCTGCGGGACATATTAGCCCTGATTATTATGT GCAAGATGGGGTAATTCCTCGCACTCAATTACCTTATGTTCTCCAGGAAATTGAAAGATTAAGTCATGAATATGGTTATC CCATTGCCAATGTTTTTCATGCTGGAGATGGTAATTTACATCCATTAATTTTATTTGATAATTCTGTACATGGAGAATTG GAAAAAGTCGAAGAATTGGGAGGAGAAATTCTCAGGCTATGTGTAAGAGTAGGTGGAAGTATTTCCGGTGAACATGGTAT TGGTGCTGATAAAAAATGCTATATGCCAGATATGTTTAGTGAAGCTGATTTAGAAACAATGCAATGGGTAAGACAGGTAT TTAATCCCCAAGGTTTGGCAAATCCTGGCAAGATTTTTCCCACACCTCGCACTTGTGGAGAAGCAGCAAAAGCATCTATT CAACAATTCTCAGGTGTAGAAAGATTCTAA Protein sequence : MLTKNKKEINWKPIIKKFVAVVGEKGVVQRKEELLTYECDGLTSYKQCPPVAVLPRTTEQVSEIVKICNQYSVPFIARGS GTGLSGGALPTENSVLIVTSLMRQILSIDLENQRAVVQPGVINSWVTQAVSGAGFYFAPDPSSQIICSIGGNIAENSGGV HCLKYGVTTNHVLGLKLVLPNGEIVDVGGQIPETPGYDLPGVFVGSEGTLGIATEITLKILKSAESICVLLADFTSVDAA AATVSDIISAGIIPGGMEMMDNISINAVEDVVATNCYPRDATAILLVEIDGLEVEVSANKQRVIEICKKNGARNVTSASD PETRLKLWKGRKAAFAAAGHISPDYYVQDGVIPRTQLPYVLQEIERLSHEYGYPIANVFHAGDGNLHPLILFDNSVHGEL EKVEELGGEILRLCVRVGGSISGEHGIGADKKCYMPDMFSEADLETMQWVRQVFNPQGLANPGKIFPTPRTCGEAAKASI QQFSGVERF |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-109 | 50 |