Gene Information

Name : glcD (ANA_C12928)
Accession : YP_006997441.1
Strain :
Genome accession: NC_019427
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : glycolate oxidase subunit GlcD
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.1.3.15
Position : 3294878 - 3296347 bp
Length : 1470 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGCTTACCAAAAATAAAAAAGAAATCAACTGGAAACCTATTATCAAAAAATTTGTCGCTGTAGTTGGTGAAAAAGGCGT
AGTTCAACGCAAAGAAGAACTTCTCACCTATGAATGTGACGGTTTAACCAGCTATAAACAATGTCCCCCAGTCGCAGTAT
TACCCAGAACCACAGAACAAGTCTCAGAAATTGTCAAAATTTGCAATCAATATTCCGTTCCCTTCATTGCTAGAGGTTCA
GGAACAGGTTTATCTGGTGGGGCTTTACCAACGGAAAATTCTGTTTTAATTGTCACTTCTTTAATGCGACAAATCCTTAG
TATTGATTTAGAAAATCAACGGGCTGTAGTGCAACCAGGAGTAATTAATAGTTGGGTGACTCAAGCTGTTAGTGGTGCTG
GTTTTTACTTTGCACCTGACCCTTCTAGTCAAATTATTTGTTCTATTGGTGGCAATATTGCCGAAAATTCTGGAGGAGTC
CATTGTTTAAAATATGGTGTGACAACAAATCATGTTTTGGGCTTAAAACTTGTCCTTCCTAACGGTGAAATAGTTGATGT
TGGTGGACAAATTCCCGAAACCCCAGGTTATGATTTACCTGGTGTATTTGTGGGTTCAGAAGGAACATTAGGAATTGCCA
CAGAAATCACCCTGAAGATTCTCAAGAGTGCGGAATCTATTTGTGTCTTACTAGCAGATTTTACTAGCGTAGATGCTGCG
GCTGCCACCGTTTCTGATATTATTAGCGCGGGGATTATTCCCGGTGGCATGGAAATGATGGATAATATTAGTATCAATGC
TGTAGAAGATGTTGTTGCCACTAATTGTTATCCTCGTGATGCGACGGCAATTTTGTTAGTAGAAATTGATGGTTTAGAAG
TAGAAGTTTCTGCCAATAAACAGCGAGTCATAGAAATTTGCAAAAAGAATGGGGCGCGAAATGTTACTAGTGCTAGTGAC
CCAGAAACTAGATTAAAATTATGGAAAGGCAGAAAAGCAGCTTTTGCGGCTGCGGGACATATTAGCCCTGATTATTATGT
GCAAGATGGGGTAATTCCTCGCACTCAATTACCTTATGTTCTCCAGGAAATTGAAAGATTAAGTCATGAATATGGTTATC
CCATTGCCAATGTTTTTCATGCTGGAGATGGTAATTTACATCCATTAATTTTATTTGATAATTCTGTACATGGAGAATTG
GAAAAAGTCGAAGAATTGGGAGGAGAAATTCTCAGGCTATGTGTAAGAGTAGGTGGAAGTATTTCCGGTGAACATGGTAT
TGGTGCTGATAAAAAATGCTATATGCCAGATATGTTTAGTGAAGCTGATTTAGAAACAATGCAATGGGTAAGACAGGTAT
TTAATCCCCAAGGTTTGGCAAATCCTGGCAAGATTTTTCCCACACCTCGCACTTGTGGAGAAGCAGCAAAAGCATCTATT
CAACAATTCTCAGGTGTAGAAAGATTCTAA

Protein sequence :
MLTKNKKEINWKPIIKKFVAVVGEKGVVQRKEELLTYECDGLTSYKQCPPVAVLPRTTEQVSEIVKICNQYSVPFIARGS
GTGLSGGALPTENSVLIVTSLMRQILSIDLENQRAVVQPGVINSWVTQAVSGAGFYFAPDPSSQIICSIGGNIAENSGGV
HCLKYGVTTNHVLGLKLVLPNGEIVDVGGQIPETPGYDLPGVFVGSEGTLGIATEITLKILKSAESICVLLADFTSVDAA
AATVSDIISAGIIPGGMEMMDNISINAVEDVVATNCYPRDATAILLVEIDGLEVEVSANKQRVIEICKKNGARNVTSASD
PETRLKLWKGRKAAFAAAGHISPDYYVQDGVIPRTQLPYVLQEIERLSHEYGYPIANVFHAGDGNLHPLILFDNSVHGEL
EKVEELGGEILRLCVRVGGSISGEHGIGADKKCYMPDMFSEADLETMQWVRQVFNPQGLANPGKIFPTPRTCGEAAKASI
QQFSGVERF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcD CAE85245.1 GlcD protein Not tested PAI V 536 Protein 4e-109 50