|
Name : ccmF (A1OE_535) Accession : YP_007019996.1 Strain : Candidatus Endolissoclinum faulkneri L2 Genome accession: NC_019566 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 478989 - 480908 bp Length : 1920 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCGCTTGTCATAGCTTTAGTTGTATCAGTATTTCAAACGATAATTCCTCTTTATGGTACGGCTTGTCAACAGCCTAG ATTAATATCTTTTGCTTGTCCAGCTGCTATTGTTCAATTTACTGCACTAGTACTATCCTTTGGATCATTGATTAATGCGT TCGTGGCCTCGGATTTCTCTGTAGCTAATGTAGTTGATAACTCTAGTTCTCTAAAACCTATGCTTTACAAAGTTGCAGGC GTGTGGGGAAACCATGAAGGATCCATGTTGCTTTGGGTGTTAATTCTATCTTTTTTTGGGGCTTCTGTGGCGATTTTTGG AGCTAATTTGCCAGAAATTTTACGTGCGCGGGTCATAGCAATACAAGGTTTAATTGGTGCTAGTTTTTTAACATTTATAA TATTTACTTCTAATCCATTCGTCAGAATGATTCCAGCTCCAATAGATGGACGTGGACTAAATCCTTTACTGCAGGATATT GGTCTTGCTCTGCATCCTCCTATACTATATTTAGGTTATGTTGGTCTTTCAACTACATTTTCTTTTGCTGTAGCTGCTCT TTTAGAAGGTCGTGTTAGTCGTTCATGGGCACGCTGGGTGCGTCCATGGATTTTAGCCGCTTGGGTGGCACTGACTGCAG GAATCACACTTGGCTCTATTTGGTCTTATTACGAACTTGGCTGGGGAGGATGGTGGTTCTGGGATCCAGTTGAAAATGCT AGTTTTATGCCTTGGCTAGTGGCTACCGCTTTATTGCACTCGGTAATTGTGCTGGAAAAGCGCAACGCTCTTAAACGCTG GACTGTTTTGTTGGCCTTAGTTGCTTTTGCCTTTTCGTTGCTTGGTACTTTCTTAGTACGTTCAGGCGTATTGACAAGCG TGCACTCTTTTGCTGTTGATTCTCAACGTGGTATTTTCATGCTTGTTCTACTTTCCGTTACAATCGTTGGTTCTTTATTT CTTTATGCTTGGCGAGCGCCGGCTATAGAAAGTAGTGAAATTTTTTTCTTCATCAGTCGTGAAGGCGCTTTGATAACAAA CAACCTTTTTATGATAACTGGAGCAACTACTGTACTAATAGGTACAATTTATCCTTTGTTTCTGGAGAGTATTTCTGGAG AGAAAATTTCTGTTGGTCCACCATTTTTTGAGTCTACTTTTGTACCGCTTATGGTGCCGTTGATTTTAGCTGTCGGTGTT GGCCCATTTTTGACATGGAAACGTGACAATTTAGTAATTGTTGTAAAAAATGTATTTTTTGCAACAGTTTGTTTATTTAT GGTATTTGTATTTCTTTGGGGTGTGCCAATCGGTGCGATGTTTGGCCTGGCTTTGGCAGTTTGGCTAATGTTGTCTGTAT TAACTGAATGGGCTCACCGTGTGCGTTTATTTCGAGTATCACTTTTTTCCTCTTTATCTCGTGCGCTTGTATTACCCCGT TCGGCCTACGGGATGTCTATCGCTCATTTTGGATTGGCGGTATTTATTTTTGGTGCTGTCGGTAATAACTTTTACAGCAC AGAGGTTGTGCGGTACGCTTCTCCTGGAGAGAAGATAAAAATTGCCGGACATACTTTAACTTTTCAAAGTGTGAATGCGG GAAAGGGGGTTAATTACGATTCATATGTGGGTAAATTTGTTATGGAAAATGGACAAGTGATTGAATCAGAACGTAGATTT TTTCCCATAGAAGGTCAGCAAACAACTGAGGTTGGGCTGTGTATTCGACCTTTAGGTGATATTTATACTGTTTTAGGTGA GGCAGTTGCGCGCAATAAGTGGACTATACGAATTTATTACAATGCTTTTGTAGTTTGGATTTGGATTGGAAGTTTTTTAA TGTCATTGGGAGGCTTGCTGTCATTTCTCGATTCTCGTTTACGCATTCGTCTTCAGGGGTCATGCGCCATCATTCGATGA Protein sequence : MALVIALVVSVFQTIIPLYGTACQQPRLISFACPAAIVQFTALVLSFGSLINAFVASDFSVANVVDNSSSLKPMLYKVAG VWGNHEGSMLLWVLILSFFGASVAIFGANLPEILRARVIAIQGLIGASFLTFIIFTSNPFVRMIPAPIDGRGLNPLLQDI GLALHPPILYLGYVGLSTTFSFAVAALLEGRVSRSWARWVRPWILAAWVALTAGITLGSIWSYYELGWGGWWFWDPVENA SFMPWLVATALLHSVIVLEKRNALKRWTVLLALVAFAFSLLGTFLVRSGVLTSVHSFAVDSQRGIFMLVLLSVTIVGSLF LYAWRAPAIESSEIFFFISREGALITNNLFMITGATTVLIGTIYPLFLESISGEKISVGPPFFESTFVPLMVPLILAVGV GPFLTWKRDNLVIVVKNVFFATVCLFMVFVFLWGVPIGAMFGLALAVWLMLSVLTEWAHRVRLFRVSLFSSLSRALVLPR SAYGMSIAHFGLAVFIFGAVGNNFYSTEVVRYASPGEKIKIAGHTLTFQSVNAGKGVNYDSYVGKFVMENGQVIESERRF FPIEGQQTTEVGLCIRPLGDIYTVLGEAVARNKWTIRIYYNAFVVWIWIGSFLMSLGGLLSFLDSRLRIRLQGSCAIIR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-115 | 46 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-96 | 44 |
