Name : shiA (BN6_75130) Accession : YP_007041611.1 Strain : Saccharothrix espanaensis DSM 44229 Genome accession: NC_019673 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Shikimate transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 8303941 - 8305230 bp Length : 1290 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGGGAACTCCGGGGTGCGCAGGGTTGCGCTCGCCAGTTCGGCGGGCAACGCGGTCGAGCTGTACGACTTCCTGCTCTA CGGCACGGCGTCCGCGCTGGTCTTCGACAAGCTGTTCTTCCCGTCGTTCGACCCGTGGGTCGGCACGCTGCTGGCGTTCG CCACGTTCGGCGCGGGGTTCCTGGCCCGACCGCTGGGCGGCGTGGTGATCGGCCACTTCGGCGACCGGGTCGGCCGGCGC TCGATGCTGGTGCTCACGCTCACCGCGACCGGCGTCGCCACCGCGCTGATCGGGCTGCTGCCCACCTACGACTCGATCGG CGTGGCCGCGCCGATCCTGTTGGTGCTGCTCAGAATCGTGCAGGGGTTCTTCCTCGGCGGCGAGCAGGGCGGTGCGACCC TGATGGCGGTCGAGCACGCCCCGCCGGGGCGCACCGCGTGGTACGGCAGCTGGACCTTCCTCGGTTCCCCGCTGGGGTTG TTGCTGGCCAACGGTGTCCTCGCGGCGTCCACGGCGGTGTCCGGCGACCAGTTCCTCACCTGGGGCTGGCGGGTGCCGTT CCTGTTCAGCCTGGTCCTGGTCGGCGTCGGGCTCTACGTGCGGCTGTCGGTCGAGGAGAGCCCCGAGTTCCGCGCCGCGC GGTCGGAGCGCGGCACCGTGAAGCTGCCGGTGGTGGAGGTCCTGCGCGACTCGTGGCGCAGGGTGCTGCTCGGCGCGGGC GTGAACCTCGGGTTCAACATGTTCATCTTCGTGATCGCGACCTTCGTGGTCTCCTACGGCACCAAGCAGTTGGGGCTGTC GAGGTCGATGCTGCTCAACGCCGGGCTGATCGGCGCGGCCTCGCAGGCGGTGGCGATCCTGGTGTTCGCGAGGCTCTCCG ACCGGATCGGCCGGCTGCCGGTGATGCTCGGCGGTGCGGTGTTCCTCGGCCTGTACGCCTTCCCGCTGTTCTGGTTGCTG GAGACGCGGTCGCCGGTGCTGGTGGTGCTGGCGCTGGTGATCGGCTTCACCGGGTCGGCGGCGGTGTTCGGGCCGATGCC CGCCTACTACGCCGAGCTGTTCGGGACGCGGGTCCGGTACAGCGGGGTGTCGTTGAGCTACCAGGTGGGCGCGGTGCTCG GCGGCGGCCTGTCGCCGCTGATCGCGGTGTGGCTGCTGGAACTCACGCCCACCCGGTCGTCCTGGCCGGTGTCGGTGTAC CTGGTGGTGGGCGCGGTGATCAGCGTCCTGTCGGTGGTGGCGATCGGCGAAACCCTCCGGCGGGTGCCGGAGGGCGCGAC GGTCCGCTAG Protein sequence : MGNSGVRRVALASSAGNAVELYDFLLYGTASALVFDKLFFPSFDPWVGTLLAFATFGAGFLARPLGGVVIGHFGDRVGRR SMLVLTLTATGVATALIGLLPTYDSIGVAAPILLVLLRIVQGFFLGGEQGGATLMAVEHAPPGRTAWYGSWTFLGSPLGL LLANGVLAASTAVSGDQFLTWGWRVPFLFSLVLVGVGLYVRLSVEESPEFRAARSERGTVKLPVVEVLRDSWRRVLLGAG VNLGFNMFIFVIATFVVSYGTKQLGLSRSMLLNAGLIGAASQAVAILVFARLSDRIGRLPVMLGGAVFLGLYAFPLFWLL ETRSPVLVVLALVIGFTGSAAVFGPMPAYYAELFGTRVRYSGVSLSYQVGAVLGGGLSPLIAVWLLELTPTRSSWPVSVY LVVGAVISVLSVVAIGETLRRVPEGATVR |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
APECO1_1067 | YP_853084.1 | shikimate transporter | Not tested | PAI IV APEC-O1 | Protein | 7e-44 | 46 |