Gene Information

Name : shiA (BN6_75130)
Accession : YP_007041611.1
Strain : Saccharothrix espanaensis DSM 44229
Genome accession: NC_019673
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Shikimate transporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 8303941 - 8305230 bp
Length : 1290 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGGGAACTCCGGGGTGCGCAGGGTTGCGCTCGCCAGTTCGGCGGGCAACGCGGTCGAGCTGTACGACTTCCTGCTCTA
CGGCACGGCGTCCGCGCTGGTCTTCGACAAGCTGTTCTTCCCGTCGTTCGACCCGTGGGTCGGCACGCTGCTGGCGTTCG
CCACGTTCGGCGCGGGGTTCCTGGCCCGACCGCTGGGCGGCGTGGTGATCGGCCACTTCGGCGACCGGGTCGGCCGGCGC
TCGATGCTGGTGCTCACGCTCACCGCGACCGGCGTCGCCACCGCGCTGATCGGGCTGCTGCCCACCTACGACTCGATCGG
CGTGGCCGCGCCGATCCTGTTGGTGCTGCTCAGAATCGTGCAGGGGTTCTTCCTCGGCGGCGAGCAGGGCGGTGCGACCC
TGATGGCGGTCGAGCACGCCCCGCCGGGGCGCACCGCGTGGTACGGCAGCTGGACCTTCCTCGGTTCCCCGCTGGGGTTG
TTGCTGGCCAACGGTGTCCTCGCGGCGTCCACGGCGGTGTCCGGCGACCAGTTCCTCACCTGGGGCTGGCGGGTGCCGTT
CCTGTTCAGCCTGGTCCTGGTCGGCGTCGGGCTCTACGTGCGGCTGTCGGTCGAGGAGAGCCCCGAGTTCCGCGCCGCGC
GGTCGGAGCGCGGCACCGTGAAGCTGCCGGTGGTGGAGGTCCTGCGCGACTCGTGGCGCAGGGTGCTGCTCGGCGCGGGC
GTGAACCTCGGGTTCAACATGTTCATCTTCGTGATCGCGACCTTCGTGGTCTCCTACGGCACCAAGCAGTTGGGGCTGTC
GAGGTCGATGCTGCTCAACGCCGGGCTGATCGGCGCGGCCTCGCAGGCGGTGGCGATCCTGGTGTTCGCGAGGCTCTCCG
ACCGGATCGGCCGGCTGCCGGTGATGCTCGGCGGTGCGGTGTTCCTCGGCCTGTACGCCTTCCCGCTGTTCTGGTTGCTG
GAGACGCGGTCGCCGGTGCTGGTGGTGCTGGCGCTGGTGATCGGCTTCACCGGGTCGGCGGCGGTGTTCGGGCCGATGCC
CGCCTACTACGCCGAGCTGTTCGGGACGCGGGTCCGGTACAGCGGGGTGTCGTTGAGCTACCAGGTGGGCGCGGTGCTCG
GCGGCGGCCTGTCGCCGCTGATCGCGGTGTGGCTGCTGGAACTCACGCCCACCCGGTCGTCCTGGCCGGTGTCGGTGTAC
CTGGTGGTGGGCGCGGTGATCAGCGTCCTGTCGGTGGTGGCGATCGGCGAAACCCTCCGGCGGGTGCCGGAGGGCGCGAC
GGTCCGCTAG

Protein sequence :
MGNSGVRRVALASSAGNAVELYDFLLYGTASALVFDKLFFPSFDPWVGTLLAFATFGAGFLARPLGGVVIGHFGDRVGRR
SMLVLTLTATGVATALIGLLPTYDSIGVAAPILLVLLRIVQGFFLGGEQGGATLMAVEHAPPGRTAWYGSWTFLGSPLGL
LLANGVLAASTAVSGDQFLTWGWRVPFLFSLVLVGVGLYVRLSVEESPEFRAARSERGTVKLPVVEVLRDSWRRVLLGAG
VNLGFNMFIFVIATFVVSYGTKQLGLSRSMLLNAGLIGAASQAVAILVFARLSDRIGRLPVMLGGAVFLGLYAFPLFWLL
ETRSPVLVVLALVIGFTGSAAVFGPMPAYYAELFGTRVRYSGVSLSYQVGAVLGGGLSPLIAVWLLELTPTRSSWPVSVY
LVVGAVISVLSVVAIGETLRRVPEGATVR

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_1067 YP_853084.1 shikimate transporter Not tested PAI IV APEC-O1 Protein 7e-44 46