Gene Information

Name : Riv7116_0085 (Riv7116_0085)
Accession : YP_007053244.1
Strain : Rivularia sp. PCC 7116
Genome accession: NC_019678
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cysteine desulfurase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 98811 - 99992 bp
Length : 1182 bp
Strand : -
Note : PFAM: Aminotransferase class-V

DNA sequence :
ATGCCTCAACGTCCCATCTACCTCGATTGCCACTCTACAACACCAGTCGATGAAAATGTAGTAAATGCCATGCTACCTTA
CTTCACCGAACACTTTGGTAATGCTTCAAGTACCAGTCATATTTACGGTTGGGAAGCAGAAGCTGCCGTAAAAAAGGCGC
GAGAAACAATTGCAGCAGCTATTAATGCTTCTCCAGAAGAAATTATTTTTACTAGCGGTGCCACAGAAGCGAACAATTTA
GCTATTAAAGGCGTTGCAGAAACTTATTTTTCCCAAGGTCAACATATTATTACTATTGCAACAGAACATAGCGCAATTAT
AGATCCCTGTAATTATTTGAAAACTTTGGGCTTTGATATTACTTTTCTTCCCGTAGAAAAAGATGGAACTATTAATCTTG
ATAATTTAGAAAAAGCCATCCGTAACGATACTATTTTAGTTTCAGTCATGGCTGCTAACAACGAAATTGGGGTTTTACAA
CCGCTTGCAGAAATTGGTGCCATATGTCGCGATCGCAGCAAAGGCGAAAGTAATATTATTTTCCATTCAGATAGCGCTCA
GGCTATTGGTAAAATACCTTTGGACGTACAAGCAATGAATATCGACTTAATGTCTTTAACAGCACATAAAGTCTACGGAC
CAAAAGGTATCGGTGCTTTGTACGTGCGTCGCCGCAAACCCAGGGTGGTTTTAGCTCCCCAGCAACACGGTGGCGGTCAG
GAGCGGGGTATACGCTCTGGAACATTGTATACACCGCAAATCGTGGGATTTGGCAAAGCTGTGGAAATTGCTTTAAAAAA
TCAAGTTAAAGAAAATAAATTTATTGCTCAACTCAGACAAAACTTGTGGGAACAGATTTCTCAGTTAGAAGGAGTCTATC
TCAACGGGCATCCCACCCAAAGATTAGCAGGGAACCTAAATCTAAGCATTGAGGGAGTTGACGGCTCGGCATTATTATTG
GGATTGCAGCCAATCATGGCAGTTTCCTCTGGCTCGGCTTGCTCGTCAACAAATACCGCACCTTCCCACGTTTTAACAGC
ATTGGGACATTCGGAAAAGCTAGCTTATGCTTCCGTTCGTTTTGGTATCGGAAGATTTAATACAGAGGAAGAAATTAATC
GAGTTGCCGAACACTTTATCTCTACGGTAAAAAGTCTGCGAAAGCAAGCGGTAATGATTTAA

Protein sequence :
MPQRPIYLDCHSTTPVDENVVNAMLPYFTEHFGNASSTSHIYGWEAEAAVKKARETIAAAINASPEEIIFTSGATEANNL
AIKGVAETYFSQGQHIITIATEHSAIIDPCNYLKTLGFDITFLPVEKDGTINLDNLEKAIRNDTILVSVMAANNEIGVLQ
PLAEIGAICRDRSKGESNIIFHSDSAQAIGKIPLDVQAMNIDLMSLTAHKVYGPKGIGALYVRRRKPRVVLAPQQHGGGQ
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GLQPIMAVSSGSACSSTNTAPSHVLTALGHSEKLAYASVRFGIGRFNTEEEINRVAEHFISTVKSLRKQAVMI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAT96060.1 cysteine desulfurase Not tested T-PAI Protein 2e-80 50