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Name : Sta7437_0532 (Sta7437_0532) Accession : YP_007131102.1 Strain : Stanieria cyanosphaera PCC 7437 Genome accession: NC_019748 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate oxidase, subunit GlcD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.1.2.4 Position : 611764 - 613245 bp Length : 1482 bp Strand : + Note : PFAM: FAD binding domain; FAD linked oxidases, C-terminal domain; TIGRFAM: glycolate oxidase, subunit GlcD; COGs: COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenase; InterPro IPR006094:IPR004113:IPR004490; KEGG: cyp:PCC8801_0822 glycolate oxidase, subunit GlcD; PFA DNA sequence : ATGATGCTTCGCAATCTCTTTAAACCGACAGATAACAAATGGCAACCGATTATTAACCAATTAGAAGCTGCGATTGGTAA AGATGGGGTTGTGCGTCGCAAAGAAGAATTACTTACCTACGAATGTGATGGGTTAGCTAGTTACCGTCAACGCCCTGCTT TAGTCGTACTACCTCGCACTACCGAACAAGTAGCAGCAGCAGTAAAAATCTGCCATGACAATGATATTCCTTGGGTGGCT AGAGGTGCAGGTACGGGTTTATCTGGTGGTGCTTTACCTGTAGAAGATTGCGTTTTAATTGTTACGGCTAGGATGAAACA AATTTTAGATATTGATCTTGAAAATCATCGTATCACCGTACAACCAGGCATTATTAATAATTGGGTAACTCAAGCTGTTA GTGGTGCAGGTTTTTATTATGCCCCCGATCCTTCTAGTCAAATTATCTGTTCGATTGGTGGGAATGTAGCGGAAAATTCT GGTGGAGTTCACTGTCTTAAATATGGTGTCACTACCAACCACGTAATCGGTTTAAAATTAGTTATTCCTGACGGTTCGGT TATTGATGTCGGTGGTACAATTCCTGAAATGCCAGGCTATGATTTAACTGGTTTATTTGTGGGTTCGGAAGGTACGCTAG GTATCGCTACAGAAGTAACACTACGTATTCTTAAAACTCCTGAATCGATTTGTGTAGTTTTAGCCGATTTTCCAAGCATT GAAGATGCTGGTGCAGCCGTGGCAGGGATTATCAGTGCAGGGATTATTCCTGCGGGCATGGAAATTATGGATAATCTTAG TATCAATGCCGTAGAAGATGTGGTGGCAACTGGATGTTATCCTCGCGATGCCGAAGCTATTTTGTTAGTAGAATTGGATG GTTTGGAAGTAGAAGTTGCAGAAGGTAAAAAACGCATAGCAGAAATTTGTCGGCAAAATAATTCTCGCAATCTTACCTCG GCTAACGATGCCGAAACCCGTTTAAAATTGTGGAAAGGCAGAAAAGCAGCCTTCGCAGCAGCAGGACATATTAGTGTTAA TTACTTTGTCCAAGATGGTGTAATTCCCCGTACTAAATTAGTTTCGGTACTAAAAGAAATTAATCGTCTTAGTGAAGAAT CTGGGTATCGTATTGCTAATGTTTTCCATGCAGGTGATGGTAATTTACATCCTTTAATTCTTTACGATAATTCTGTCCCA GGTGAGTTTGAAGAAGTTGAGAAATTAGGAGGAGAAATTCTTAAACTCTGTGTGGAAGCAGGAGGAAGTCTTTCCGGTGA ACACGGTATTGGTTCAGATAAAAATTGTTATATGCCTTATATGTTCAATGAAACTGATTTGGAAACAATGGGATATGTAC GCAATGCCTTTAATCATAAAGGTTTAGCTAATCCAGGTAAAATGTTTCCTACACCCCGTACCTGTGGCGAAGTTGCTAAT GCAGGGATGATTAAACCAATTAAAGATGCAGAATTGTTTTAA Protein sequence : MMLRNLFKPTDNKWQPIINQLEAAIGKDGVVRRKEELLTYECDGLASYRQRPALVVLPRTTEQVAAAVKICHDNDIPWVA RGAGTGLSGGALPVEDCVLIVTARMKQILDIDLENHRITVQPGIINNWVTQAVSGAGFYYAPDPSSQIICSIGGNVAENS GGVHCLKYGVTTNHVIGLKLVIPDGSVIDVGGTIPEMPGYDLTGLFVGSEGTLGIATEVTLRILKTPESICVVLADFPSI EDAGAAVAGIISAGIIPAGMEIMDNLSINAVEDVVATGCYPRDAEAILLVELDGLEVEVAEGKKRIAEICRQNNSRNLTS ANDAETRLKLWKGRKAAFAAAGHISVNYFVQDGVIPRTKLVSVLKEINRLSEESGYRIANVFHAGDGNLHPLILYDNSVP GEFEEVEKLGGEILKLCVEAGGSLSGEHGIGSDKNCYMPYMFNETDLETMGYVRNAFNHKGLANPGKMFPTPRTCGEVAN AGMIKPIKDAELF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-99 | 52 |
