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Name : Cylst_3484 (Cylst_3484) Accession : YP_007148307.1 Strain : Cylindrospermum stagnale PCC 7417 Genome accession: NC_019757 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate oxidase, subunit GlcD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3968708 - 3970180 bp Length : 1473 bp Strand : - Note : PFAM: FAD binding domain; FAD linked oxidases, C-terminal domain; TIGRFAM: glycolate oxidase, subunit GlcD DNA sequence : ATGCTTACCCAAAATAAAAAACAAATTGACTGGAAACCAATAATCAAAAAATTTGAAGCAGCACTCGGCAAAAACGGCGT AGTCAAAACCCGTGAAGAACTCATCACTTATGAATGTGACGGTTTAACCAGCTATCGTCAACGTCCCGCTTTAGTGGTTT TGCCAAGAACGACAGAACAAGTTGCCGCAGCAGTCAAGATATGCAACCAATACTCCGTTCCCTTCATCGCACGGGGTTCT GGTACCGGCTTATCGGGTGGCGCTTTGCCGTCAGAAGACTCCGTTTTGATTGTCACATCCCTCATGCGGCAAATACTCAA GATTGATTTAGAAAATCAGCAAGCAATTGTCCAACCAGGAGTAATTAACAGTTGGGTAACACAAGCTGTTAGTGGTGCTG GATTTTACTACGCTCCCGACCCTTCCAGCCAAATTATTTGCTCAATTGGCGGCAATATTGCCGAAAATTCTGGGGGTGTC CATTGTTTAAAATACGGCGTTACCACTAACCACGTTTTAGGTTTAAAACTCGTACTTCCAGATGGTGAAATTGTCGATGT CGGGGGACAAATTCCCGAAACACCTGGTTATGATTTAACGGGTGTTTTTGTCGGTTCAGAAGGTACTTTAGGTATCGCTA CAGAAATCACTTTGCGAATTCTTAAAAGTGCCGAATCAATTTGTGTGCTTTTAGCAGATTTTACCAGCGTAGAAGCGGCT GCGGCGAGTGTTTCTGATATCATCAGCGCCGGAATTATTCCTGGTGGCATGGAAATGATGGATAACATCAGCATCAATGC TGTAGAAGATGTGGTAGCAACAAATTGTTATCCGCGTGATGCTACCGCAATTTTGTTAGTAGAAATTGATGGGTTGGAAG TAGAAGTTGCTGTGAATAAACAGCGTATCGCCGAAATTTGTTTAAAAAATGGGGCGCGAAATATTACTACTGCCAATGAC CTAGAAACACGATTAAAATTGTGGAAAGGACGCAAAGCTGCTTTTGCCGCTGCGGGACATTTAAGCCCAGATTATTATGT GCAGGATGGGGTAATTCCCCGGACTCAATTACCTTATGTTTTACAGGAAATTGAATCATTAAGTCAAAAATATGGTTACA CTATTGCTAATGTATTCCATGCTGGTGATGGCAACCTACACCCACTAATTTTGTTTGATAATTCTGTATCGGGAGAATTA GAGAAGGTGGAAGAATTAGGAGGAGAAATTCTCAAGCTTTGTGTTAAAGTTGGTGGTAGCATTTCTGGTGAACATGGCAT TGGTGCGGATAAAAAGTGCTATATGCCTGATATGTTTAGTGAAGCTGATTTAGAAACTATGCAATGGGTGCGGCAAGTAT TTAATCCTCAAGGGTTAGCAAATCCGGGAAAGATATTCCCCACGCCGCGCACTTGTGGTGAAGCCGCCAACGCTGCAAAT ATTAAGCAGTTTGCAGGGGTAGAAAAATTTTAA Protein sequence : MLTQNKKQIDWKPIIKKFEAALGKNGVVKTREELITYECDGLTSYRQRPALVVLPRTTEQVAAAVKICNQYSVPFIARGS GTGLSGGALPSEDSVLIVTSLMRQILKIDLENQQAIVQPGVINSWVTQAVSGAGFYYAPDPSSQIICSIGGNIAENSGGV HCLKYGVTTNHVLGLKLVLPDGEIVDVGGQIPETPGYDLTGVFVGSEGTLGIATEITLRILKSAESICVLLADFTSVEAA AASVSDIISAGIIPGGMEMMDNISINAVEDVVATNCYPRDATAILLVEIDGLEVEVAVNKQRIAEICLKNGARNITTAND LETRLKLWKGRKAAFAAAGHLSPDYYVQDGVIPRTQLPYVLQEIESLSQKYGYTIANVFHAGDGNLHPLILFDNSVSGEL EKVEELGGEILKLCVKVGGSISGEHGIGADKKCYMPDMFSEADLETMQWVRQVFNPQGLANPGKIFPTPRTCGEAANAAN IKQFAGVEKF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-102 | 51 |
