Gene Information

Name : Anacy_2669 (Anacy_2669)
Accession : YP_007157016.1
Strain : Anabaena cylindrica PCC 7122
Genome accession: NC_019771
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : glycolate oxidase, subunit GlcD
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.1.2.4
Position : 3033230 - 3034699 bp
Length : 1470 bp
Strand : +
Note : PFAM: FAD binding domain; FAD linked oxidases, C-terminal domain; TIGRFAM: glycolate oxidase, subunit GlcD; COGs: COG0277 FAD/FMN-containing dehydrogenase; InterPro IPR004490:IPR006094:IPR004113; KEGG: naz:Aazo_1664 glycolate oxidase subunit GlcD; PFAM: F

DNA sequence :
ATGCTTACCCAAGATAAAAAACAAATCGACTGGAAACCCATCATCAAAAAATTTATTGCAGTTCTTGGAGAAAAAGGAGT
AGTAAAACGCCGGGAAGAACTCCTCACTTATGAATGCGACGGCTTAACCAGCTATCGCCAAACTCCCCCAGTTGCAGTTT
TACCGCGCACCACAGAACAAGTAGCTGAAGTTGTCAAAATTTGTAATCAATACTCCGTCCCCTTCATTGCCAGGGGTTCT
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GCAGCAACTGTTTCCGATATCATCAGCGCCGGAATTATTCCCGGTGGGATGGAAATGATGGATAATATTAGTATTAACGC
CGTTGAAGATGTTGTCGCTACTAATTGTTATCCTCGTGATGCAACGGCAATTTTATTAGTAGAAATTGATGGTTTAGAAG
TAGAAGTTGCGGTTAATAAAAAGCGAGTAGCTGAAATTTGTCAAAAAAATGGGGCGCGAAATATCACGACTGCGAATGAT
CCCGAAACGAGATTAAAATTGTGGAAAGGACGAAAAGCAGCTTTTGCCGCTGCTGGACATTTAAGCCCTGATTATTATGT
GCAAGATGGTGTAATTCCTCGGACTCAATTACCTTATGTATTAAATGAAATTGAGGCTTTAAGTCAAAAATATGGTTATC
CAATTGCTAATGTATTTCATGCTGGAGATGGTAATTTACATCCTTTAATTTTATTTGATAATTCCGTGCATGGGGCATTA
GAAAAAGTTGAAGAATTAGGTGGAGAAATTCTGAGACTGTGTGTGAAAGTCGGTGGTAGCATTTCTGGTGAACATGGAAT
TGGTGCTGATAAAAAATGTTATATGCCAGATATGTTTAGTGAAGCTGATTTAGAAACTATGCAATGGGTAAGACAGGTTT
TTAATCCTCAAGGTTTAGCAAATCCTGGTAAGATTTTCCCTACTCCGCGCACTTGTGGAGAAGCAGCAAAGGCTTCAATT
CAGCAGTTTCCAGGAGTGGAGAGATTTTAA

Protein sequence :
MLTQDKKQIDWKPIIKKFIAVLGEKGVVKRREELLTYECDGLTSYRQTPPVAVLPRTTEQVAEVVKICNQYSVPFIARGS
GTGLSGGALPSEDSVLIVTSLMRQIIKIDLENQLAVVQPGVINSWVTQAVSGAGFYYAPDPSSQIICSIGGNIAENSGGV
HCLKYGVTTNHVLGLKLVLPDGSIVDVGGQIPEMPGYDLTGVFVGSEGTLGIATEITLRILKSAESICVLLADFTSVEDA
AATVSDIISAGIIPGGMEMMDNISINAVEDVVATNCYPRDATAILLVEIDGLEVEVAVNKKRVAEICQKNGARNITTAND
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EKVEELGGEILRLCVKVGGSISGEHGIGADKKCYMPDMFSEADLETMQWVRQVFNPQGLANPGKIFPTPRTCGEAAKASI
QQFPGVERF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcD CAE85245.1 GlcD protein Not tested PAI V 536 Protein 1e-112 49