Name : CDEE_0530 (CDEE_0530) Accession : YP_007447868.1 Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E Genome accession: NC_020283 Putative virulence/resistance : Unknown Product : AMP nucleosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.2.4 Position : 312900 - 314405 bp Length : 1506 bp Strand : + Note : Nucleotide transport and metabolism; SecretomeP prediction: 0.08 DNA sequence : ATGGATTCTACTTTTATTTCAAGAATGGAAAAACAAAAGATAAAGACGCCAGAGCCTTTATCTTTTATTTCTTTTGATAA AGCTGAAAAAGCAGTTGATTATCTAATAGAGATATATGAAAGGAACACGAATTTTTTGTGTTCATCTTTTATAGAAGAAA TAAATTGTAAAGATCAGGTGGCTAATCATAAATTTAGAGCATTCTATCCGGCTATAAGGATTTCTGTGTCTACTCATGAT TCCATAGATTCAAGAATTTCGTATGGCCATGTTGCAGAGCCCGGATTCTATCAAACTACTATTACTAGACCTAAGCTTTT TAAATCTTATTTGATTGAACAGATTAGTCAGCTTATAAATAATCATAATGTTCCTGTTTGGATTGGTGAGTCTAATTCTG CTATACCAATACATTTTGCTTTTATAGATACTAATGCAAAATTTCAAGAAAATGATAGTGCCAATAGATTACTAAGGGAT ATTTTTGATGTGCCAGATTTATCTGTTACAGATGACTCTATAGTTAATGGGACTTGGAAAGGAAAAGAGAAAGAACCGAA ACCATTAGCTCCTTTTACTGCTGAACGCATAGATTATTCGCTGCAAAGATTACAACATTATACGGCAACAGCACCAGAAT TTTTCCAAAATTATGTTTTATTTACAAACTATCAGTTTTATGTTGATGAGTTTTGTAATATGGCAAAAAAGTTAATTTTA CAAGAAAATGGTGGTTATACAGCATTGGTTGAGCCAGGTAATAATATAATTACTAAGGATAATTGTAATAATTTGAGAAG TGATGGATTTAAAACTCCTCAAATGCCTGCTTATCATTTAGTCAGGCCTAATCATTCAGGCATTACTTTAGTTAATATAG GGGTAGGGCCATCAAATGCAAAGACAATAACTGATCATATTGCTGTTTTGAGACCTCATGTTTGGTTAATGTTAGGACAT TGTGCTGGTCTAAGAGATTCACAACGTTTAGGTGACTACGTGTTAGCACATGGTTATGTAAGAGATGATCATGTTCTTGA TATAGATTTGCCTACTTGGGTTCCTGTTCCTGCATTAGCTGAAGTCCAAGTTGCTTTGGAGCGTGCTGTTGAAGAAATAT CTGGTCTTGAAGGATGGGAATTGAAACGTATTATGAGAACTGGTACTGTTGTAACTATAGACAATCGTAATTGGGAATTA CATGATCAGGTAGAATTAGTAAAACGTTTTTCTCAATCTCGAGCAATCGCTTTAGATATGGAGTCTGGTACAATAGCTGC TAATGGTTTCAGATTTCGTGTGCCTTATGGTACTTTATTATGTGTTTCCGACAAACCATTACATGGAGAATTAAAATTGC CTGGTATGGCTACTGCTTTTTATCGTACCCAAGTTAATAAGCATTTAGAAATTGGTATTAAAACGTTGGAAATTTTGCGC AGTATGCCTTCTGCAAGGCTTCATTCCAGGAAATTACGAACATTTATGGAAACTGCATTTCAGTAA Protein sequence : MDSTFISRMEKQKIKTPEPLSFISFDKAEKAVDYLIEIYERNTNFLCSSFIEEINCKDQVANHKFRAFYPAIRISVSTHD SIDSRISYGHVAEPGFYQTTITRPKLFKSYLIEQISQLINNHNVPVWIGESNSAIPIHFAFIDTNAKFQENDSANRLLRD IFDVPDLSVTDDSIVNGTWKGKEKEPKPLAPFTAERIDYSLQRLQHYTATAPEFFQNYVLFTNYQFYVDEFCNMAKKLIL QENGGYTALVEPGNNIITKDNCNNLRSDGFKTPQMPAYHLVRPNHSGITLVNIGVGPSNAKTITDHIAVLRPHVWLMLGH CAGLRDSQRLGDYVLAHGYVRDDHVLDIDLPTWVPVPALAEVQVALERAVEEISGLEGWELKRIMRTGTVVTIDNRNWEL HDQVELVKRFSQSRAIALDMESGTIAANGFRFRVPYGTLLCVSDKPLHGELKLPGMATAFYRTQVNKHLEIGIKTLEILR SMPSARLHSRKLRTFMETAFQ |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
amn | YP_853085.1 | AMP nucleosidase | Not tested | PAI IV APEC-O1 | Protein | 2e-92 | 50 |