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Name : cobT (Cspa_c14620) Accession : YP_007454486.1 Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) Genome accession: NC_020291 Putative virulence/resistance : Unknown Product : nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase CobT Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.4.2.21 Position : 1602208 - 1603302 bp Length : 1095 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATGAAAATATAAAAAAATTAAATAATATTATTAAGGTTATAGAAGGGGCAGATAAGGATGCTATCTTGCAAGCAGA GAAAAGAATGACTTCCCTTGTAAAACCTTTAAAAAGTTTAGGAAAGCTAGAGGAAATGGCTATAAAGCTTTCTGGGATTA CAGGGAAAATAAAAAATAATATTAATAAGAAGCTAGTAATAATAATGTGTTCAGATAATGGAGTTGTTGAAGAAGGAGTT GCTTCAGCACCACAATCAGTTACTCTTTCTCAAACAATTAATTTTACTAAGGGGCTTACAGGAGTTGCCGTTCTAGCAAA AGCTAATAACACAGAACTTATGGTAGTTGATGTTGGAATAAATTATGATTTTGATTATCCAAATGTAATTAATAGAAAAA TAAGAAAATCAACAAACAACATTGCTAAAGGGCCAGCTATGAGTTATGAAGAAGCAGCTCAGGCAATTTTAATTGGAATT GAGGCAGTTAATAAAGCACGAAATGAAGGTTATGAGATTATTGGCGTTGGTGAAATGGGGATTGGAAATACTTCAACAAG TAGTGCTGTTTTATCAGCATTAACAGCTATAAGTGTAGAGGATGTAGTTGGAAGAGGAGCTGGAATTACTGATGAAGCTT TCAGAAAAAAAATAAAGGTAGTAGAAAAAGCTATAGAAATAAATAAACCAGATAAGTCAGATCCAATAGAGGTTGTTTCA AAGGTGGGTGGATTTGATATAGCTGCTATGGCAGGAGTTTTTTTAGGAGCTGCTTATTATAAAATTCCAGTAGTTATAGA TGGTTTTATATCAGCTGTTGCAGCGTTAATTGCTTTTAGGTTAAATAACAATACAAGAGATTATATGTTTACTTCTCATT GTTCAAAAGAAGTGGGATATAATGCAGCTATTAAAGAACTTGACTTAAGTCCAATTTTAAATTTGGATATGGGATTAGGA GAAGGTAGTGGATGTCCATTGGCCTTTTCAATCATAGATTCAGCTTGTGCAGCAATGAATAATATGGCTACCTTTGAGGA AGCTGAAATTAATGATAGTTATTTAGATGAACTTAAAAAAATGCAGAATAAATAG Protein sequence : MNENIKKLNNIIKVIEGADKDAILQAEKRMTSLVKPLKSLGKLEEMAIKLSGITGKIKNNINKKLVIIMCSDNGVVEEGV ASAPQSVTLSQTINFTKGLTGVAVLAKANNTELMVVDVGINYDFDYPNVINRKIRKSTNNIAKGPAMSYEEAAQAILIGI EAVNKARNEGYEIIGVGEMGIGNTSTSSAVLSALTAISVEDVVGRGAGITDEAFRKKIKVVEKAIEINKPDKSDPIEVVS KVGGFDIAAMAGVFLGAAYYKIPVVIDGFISAVAALIAFRLNNNTRDYMFTSHCSKEVGYNAAIKELDLSPILNLDMGLG EGSGCPLAFSIIDSACAAMNNMATFEEAEINDSYLDELKKMQNK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cobT | YP_853092.1 | nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase | Not tested | PAI IV APEC-O1 | Protein | 3e-45 | 42 |
