|
Name : CDSE_0527 (CDSE_0527) Accession : YP_007459270.1 Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E Genome accession: NC_020294 Putative virulence/resistance : Unknown Product : AMP nucleosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.2.4 Position : 318102 - 319610 bp Length : 1509 bp Strand : + Note : Nucleotide transport and metabolism; SecretomeP prediction: 0.11. DNA sequence : ATGGATTCAATTTTTATCCCTAAAATGGAAAAGAAGAATTTTAGAAAACCTCAACCTCTTCCATTTATTCCTTTTGCAAA AGCTGATAAAGCAGTTGATTATTTAATAGAAATATATGATAGAAATACAGAATTTTTACGCTCTTCTTTTAAGAAAGAAT TGTTTGACGGACAAGATCTTAATGTAAGAATCAGGGCCTATTATCCAGCGATAAGAATTTCAGTATCTAATCATGACATG ATAGATTCCAGATTTTCCTATGGTCATGTTGCAGAGCCTGGAGTTTATCAGACTACTATTACAAGACCGAAGCTTTTTAA ATCGTATTTAATAGATCAAATAAATCAATTAATTAAAAACCATAATGTTGAAATATGGATAGGTGAATCTGATTCTCCGA TTCCTATACACTTTGCTTTTACTGATTCTTCTAATGCCAATATTAAATTTCAAGAAGGTAGTATCACAAATAAATTACTT AGAGATATATTTGATGTTCCTGATTTATCAGTTACTGATGATGCTATAGTGAATGGCACATGGAAAGTAAAGAAAGAAGA ATCAAAACCATTAGCCCCATTTACAGCAGCGCGAATAGATTATTCATTACAAAGATTGCAGCATTACACAGCAACATCTC CAGAACATTTTCAGAATTATATTCTTTTTACAAATTATCAGTTTTATGTAGATGAATTTTGTGGAATGGCTAAAAAATTA GTAGATAGTGGTAGTGCTGGTTATACTGCATTAGTTGAGCCAGGAAATAAAATTATTACAAAAAATGATAATGATTTAAA AGACAATGGTTTCAAAATGCCTCAAATGCCAGCATATCATTTGGTGAGAGAAAATCATTCTGGTATAACTTTAGTAAATA TAGGGGTAGGTCCATCAAATGCAAAAACTATAACAGACCATATTGCTGTTTTAAGACCTCATGTTTGGCTTATGCTTGGT CATTGTGCAGGATTAAGAGATTCTCAACGTTTAGGAGATTATGTCTTAGCTCATGGATATGTTAGAGATGACCACGTTCT TGATATAGATTTACCAATATGGGTTCCAGTTCCTGCTTTAGCTGAAGTGCAAGTTGCTTTAGAAAATGCTGTCGAAAAAG TTTCAGGTTTAAGTGGTTGGGAATTAAAACACATTATGCGAACAGGAACAGTTGTAACAATAGATAATCGTAATTGGGAA TTACACGATCAGACAGAATTGGTAAAACGTTTCTCTCAATCACGTGCTATTGCTTTAGATATGGAATCAGGGACAATAGC AGCCAATGGTTTTAGGTTCCGTGTTCCATATGGAACTTTACTATGTGTGTCAGATAAACCATTGCATGGTGAATTAAAAT TACCAGGTATGGCTAATGATTTTTATAGAACGCAAGTTAATAAACATTTAGAAATAGGTATTAAAGCATTAGAAATGCTT CGTGAAATGCCATCAGAGAGGTTACATTCTAGAAAATTAAGAACATTTATGGAAACAGCATTCCAATAG Protein sequence : MDSIFIPKMEKKNFRKPQPLPFIPFAKADKAVDYLIEIYDRNTEFLRSSFKKELFDGQDLNVRIRAYYPAIRISVSNHDM IDSRFSYGHVAEPGVYQTTITRPKLFKSYLIDQINQLIKNHNVEIWIGESDSPIPIHFAFTDSSNANIKFQEGSITNKLL RDIFDVPDLSVTDDAIVNGTWKVKKEESKPLAPFTAARIDYSLQRLQHYTATSPEHFQNYILFTNYQFYVDEFCGMAKKL VDSGSAGYTALVEPGNKIITKNDNDLKDNGFKMPQMPAYHLVRENHSGITLVNIGVGPSNAKTITDHIAVLRPHVWLMLG HCAGLRDSQRLGDYVLAHGYVRDDHVLDIDLPIWVPVPALAEVQVALENAVEKVSGLSGWELKHIMRTGTVVTIDNRNWE LHDQTELVKRFSQSRAIALDMESGTIAANGFRFRVPYGTLLCVSDKPLHGELKLPGMANDFYRTQVNKHLEIGIKALEML REMPSERLHSRKLRTFMETAFQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| amn | YP_853085.1 | AMP nucleosidase | Not tested | PAI IV APEC-O1 | Protein | 1e-94 | 48 |
