|
Name : HPOK310_0219 (HPOK310_0219) Accession : YP_007537853.1 Strain : Helicobacter pylori OK310 Genome accession: NC_020509 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium-dependent transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 224732 - 226390 bp Length : 1659 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAAAATTATTCGCATGCCAATACGCATACAGATACGCGCGCCGATGATAAAAGCACTAAAATCGTGCGCTTGTTGGG GTTAATAGGGGGAGTGCTAATCGCGCTCATTATCTATTACGCTTTAAACGCTCAACTGCCTCATATTGTAGAAGAAATCC CCAAGCTTAATTCCTTAAATTATAAGGCGATGCCTGTTGTGGCTGGGGTGGCTGTTTTAATGGGGATATGGTGGATGACT GAAGCCATTGACCTGCCCGCAACCGCGCTTTTACCTTTAGTGCTTTTTAGCGTCTTTAGCGTGGATCAATTCTCTAGCGT TAGCTCTTCTTACGCATCGCCGATTATCTTTCTTTTCATGGGAGGGTTTATTTTAGCTTTAAGCATGCAAAAATGGAATT TGCACACACGCATCGCTCTAAGCATTATTTTATTAGTAGGCACAAGCCCTAGGAGATTGATTTTAGGTTTCATGATAGCT ACAGGCTTTCTGTCTATGTGGGTGAGCAATACCGCAACGGCGGTGATGATGCTCCCTATTGGCATGAGCGTTTTGCAATT AGTCGCTAAACTTGTGGGCAAAGAAAACGCCTCTAATTCATGGCATCAAAAAGAAGAAATCACCAAAGCGCATGGGGGTA TTATGGGAAATATCGTGCATAAGGGCAAAGATATTACCCAAGTCATTCAAGAAAAGACCATCATTTATCGCACGAATTTC AGTATTTGCTTGATGCTTGGCATCGCTTATGCGGCTTCTATTGGCTCTTTAGGCACTCTTATTGGCACGCCGCCTAACGC TTTATTAGCCGGCTATATGAAAACCGCTTTCAATATTGAAATTGGTTTCGCCCGGTGGATGGTGTTTGGGACGCCGTTAG CCTTCATCATGCTCATTTTATCGTGGCTCTTGCTCACTTATGTGATTTTCCCTTTAAAGATTAAAGAAATCCCAGGGGGT AAGGAAGTCATTAGGGCAGAGTTAAAAAAATTAGGCCGTTTGAGTTGGGCGGAAATCTCTGTGGGCGTTATTTTTATTTT AGCGTCTTTAGGGTGGATTTTTTTAGATACGATTTTAAAATCTTGGGGCATTAAAATAGATAAAATTGATTCAGTGATCG CTATGGGGGTTTCTGCACTTTTATTCATTTTGCCCGCTAATAATCAGGGCGATAGGCTCATTGATTGGGGTGTTGCTAAA AAACTCCCTTGGGATGTGTTGCTTTTATTTGGCGGCGGGTTAGCCTTGAGCACGCAATTTTCTAAAACCGGGTTGAGTTT GTGGATTGGGCATTTAGTTTCTGGCTTTTCGCATTTACCGATTTTATTCATTATTTTCATGGTAACTTTAATGGTCATTT TCTTAACCGAAATCACTTCTAACACCGCCACCGCTGCCGCGTTTTTACCCGTGATTGGAGGGGTTGCGATGGGCATGGGT TATGAAAATCATCAGAGCTTGTTATTGACCATTCCTGTAGCCTTGAGCGCGACTTGCGCGTTCATGCTCCCTGTAGCCAC CCCACCCAATGCGATAGCTTATGGCTCTGGGTATGTTAAAATAACGGATATGATTAAAGCCGGTTTGTGGCTTAATCTGG TAGGAGTTGTTTTGATTAGCGCGTTTAGCTATTTTTTAGTTTCGCTGGTATTTAATTGA Protein sequence : MENYSHANTHTDTRADDKSTKIVRLLGLIGGVLIALIIYYALNAQLPHIVEEIPKLNSLNYKAMPVVAGVAVLMGIWWMT EAIDLPATALLPLVLFSVFSVDQFSSVSSSYASPIIFLFMGGFILALSMQKWNLHTRIALSIILLVGTSPRRLILGFMIA TGFLSMWVSNTATAVMMLPIGMSVLQLVAKLVGKENASNSWHQKEEITKAHGGIMGNIVHKGKDITQVIQEKTIIYRTNF SICLMLGIAYAASIGSLGTLIGTPPNALLAGYMKTAFNIEIGFARWMVFGTPLAFIMLILSWLLLTYVIFPLKIKEIPGG KEVIRAELKKLGRLSWAEISVGVIFILASLGWIFLDTILKSWGIKIDKIDSVIAMGVSALLFILPANNQGDRLIDWGVAK KLPWDVLLLFGGGLALSTQFSKTGLSLWIGHLVSGFSHLPILFIIFMVTLMVIFLTEITSNTATAAAFLPVIGGVAMGMG YENHQSLLLTIPVALSATCAFMLPVATPPNAIAYGSGYVKITDMIKAGLWLNLVGVVLISAFSYFLVSLVFN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 7e-102 | 52 |
