|
Name : C427_2835 (C427_2835) Accession : YP_007544292.1 Strain : Glaciecola psychrophila 170 Genome accession: NC_020514 Putative virulence/resistance : Unknown Product : malate synthase G Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2681075 - 2683339 bp Length : 2265 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGTAAACGAATTAATGAACATGGTTATAAAATTGCCGATTGTCTTTACAACTTAGTCAATAATGATGTGCTGCCTGG TTTACAAGTTAATAAACAAGATTTTTGGCAAGCGGTTGCAGCTGTGTTTAATGAGTTTATTCCTAGAAACAAAGCTTTGT TGGCTACTCGAGAAGAGCTGCAATCAAAAATTAATACTTGGCATTTAGAACATCTGAACGGCGAATTTTCACAACAAACA TATCAACAGTTTTTGACTGAGATTGGTTATTTGGTTCCTGAAAAAAGTGATTTTCAAATCACTACAGAAAATGTTGACGC TGAAGTTGCTTTAATTGCAGGGCCCCAGTTAGTAGTGCCACTAATGAACGCACGATTTGCACTCAATGCCGCCAATGCTA GATGGGGCAGTTTATATGACGCCCTTTATGGCTCTGATGTAATCGTTGATGACCTTTTAAAAGTTGATGACCTTTTAAAA GTTGATGACTCTTTAAACGTTAATGACTCTTTAAACGTTAATGACTCTGCCACAAAACCAGCCTCTGGTTACAATCCTAT TCGTGGTAAAAAAGTACAAACTTTTGCTCGTGACTTTTTAGATGCATCCTTACCATTGGTTCAAGGCAGTCATCATGATG CGGTTCAATATAAAATCAATAACCAGCAGCTTATTATTCATTTAAATACAGGTAGCTTGGTTAACTTAAAAGACATGACT CAGTTTGTTGGATTTAATGGTTCCACAGAAAGTCCCAGTGCAATTTTATGTATCAATAATGGGTTACATATTGAAATTCA AATTGATGACACCAACTTAATTGGTCAAACAGATGCTGCTGGTGTGAAGGACGTTGTTCTAGAATCTGCATTGAGCACCA TTCAAGATTGCGAAGATTCCATAGCAGCGGTAGATGCGGCAGATAAAACAGCAGTTTATGCTAATTGGTTAGGACTGATG AAAGGTGATTTGTCTGAAACTATCAGTAAAGGGGGCAAAGAAACCACCAGAACACTTAATCCAGATAGAACATACCTGTC TGCAGACGGTGAACCCATGAGTTTACCGGGGCGCAGCTTGCAATTTATCCGTAATGTAGGTCATTTAATGACAACGGACG CTATATTAACGGTGAATGATGATGAAGTGCCCGAAGGCATTCTAGATGCCCTGATAACATCCTTGATTGCTCTTCACGAC TTAAATGGTTCATCTAAGTTTGTGAACTCTAAACATGGCAGCATCTATATTGTTAAGCCTAAAATGCATGGGCCCGAAGA AGTACAATTTACCAATGACTTGTTTATCCGCGTAGAGACTAGTTTAGGCCTTGCAGAAAATACTATCAAAATGGGTATTA TGGATGAAGAGCGGAGAACTTCAGCCAATCTAAAAGAGTGTATTCGTGAAGCAAGTGCTCGTTTGGCCTTTATTAATACT GGGTTTTTAGATAGAACTGGCGATGAAATACACACCAGCATGTTAGCAGGGCCAGTGGTTCGAAAGGAACTAATGAAAAA TGAAAAATGGATTTCAGCCTACGAAAATAGAAATGTGGTAATTGGTCTAAAAGCAGGTCTTAAAGGTAAAGCGCAAATCG GTAAAGGTATGTGGGCTACACCTGATGAAATGGCAGCAATGCTAAAGGCTAAAATAGGTCATCCAAAATCCGGTGCATCA TGTGCATGGGTACCTTCACCTACAGCAGCCACATTACATGTTATGCATTACCATCAAGTTAATGTTTCAGAGGTACAACA GCAAATATTAACTGAGGCTAATACGAGTGAAGTTCATGCTCATCTAGAAGCGTTGCTAACTATTCCGTTGCTTAAAAACA GTGCAGATTTGTCAGAACACGAACGACAAGACGAATTGAATAATAATGTCCAAGGATTATTGGGTTATGTGGTGCGTTGG GTTAATCAGGGAGTAGGGTGCTCAAAAGTTCCCGATATTGATAACGTAGGGCGCATGGAAGACAGAGCGACATTACGTAT ATCCAGTCAACATATTTGCAACTGGTTACATCATGGTTTACTGAGTACTGATCAAGTCATGCAAACCCTTAAACGTATGG CGGTTGTTGTGGATACTCAAAATCAACAAGATAGTTCTTATATTTCAATGGCACCAAACTTTGATTCCAGTTTAGCTTTT CAGGCAGCAGTAGACCTTATATTTAAAGGCAAGGAACAGCCAAGTGGTTACACAGAACCCTTGTTGCATAAAATGCGCAA TGAACTTAAAGCACAGCTTAACTAA Protein sequence : MSKRINEHGYKIADCLYNLVNNDVLPGLQVNKQDFWQAVAAVFNEFIPRNKALLATREELQSKINTWHLEHLNGEFSQQT YQQFLTEIGYLVPEKSDFQITTENVDAEVALIAGPQLVVPLMNARFALNAANARWGSLYDALYGSDVIVDDLLKVDDLLK VDDSLNVNDSLNVNDSATKPASGYNPIRGKKVQTFARDFLDASLPLVQGSHHDAVQYKINNQQLIIHLNTGSLVNLKDMT QFVGFNGSTESPSAILCINNGLHIEIQIDDTNLIGQTDAAGVKDVVLESALSTIQDCEDSIAAVDAADKTAVYANWLGLM KGDLSETISKGGKETTRTLNPDRTYLSADGEPMSLPGRSLQFIRNVGHLMTTDAILTVNDDEVPEGILDALITSLIALHD LNGSSKFVNSKHGSIYIVKPKMHGPEEVQFTNDLFIRVETSLGLAENTIKMGIMDEERRTSANLKECIREASARLAFINT GFLDRTGDEIHTSMLAGPVVRKELMKNEKWISAYENRNVVIGLKAGLKGKAQIGKGMWATPDEMAAMLKAKIGHPKSGAS CAWVPSPTAATLHVMHYHQVNVSEVQQQILTEANTSEVHAHLEALLTIPLLKNSADLSEHERQDELNNNVQGLLGYVVRW VNQGVGCSKVPDIDNVGRMEDRATLRISSQHICNWLHHGLLSTDQVMQTLKRMAVVVDTQNQQDSSYISMAPNFDSSLAF QAAVDLIFKGKEQPSGYTEPLLHKMRNELKAQLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcB | CAE85241.1 | GlcB protein, malate synthase G | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-180 | 53 |
