|
Name : LPE509_02352 (LPE509_02352) Accession : YP_007568895.1 Strain : Legionella pneumophila Philadelphia 1 Genome accession: NC_020521 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Cytochrome c heme lyase subunit CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2499607 - 2501559 bp Length : 1953 bp Strand : - Note : FIG00130339 DNA sequence : ATGATAGCGGAATTAGGGCTGTTTTTTTTGGTTTTGGCTTTAGTGGCTTCTTTGATGTTAGCTTTGATCCCATTGGCGGG TTTGCAATTCAATCGGAAAGACTGGATTGATTCCTCCAGGAATTATGTCGTGCTGCAATTTTTATTTGTGGCATGTGCTT ACCTATGTCTCACGGCCTGTTTTTTGATGGATGATTTTTCGGTGATCTATGTGCTGAATAATTCCAGCTTATTGCTCCCA TGGTTTTATAAATTTTGTGCTGTGTGGGGTGGGCATGAAGGTTCCATGCTGTTATGGGTCGCTATCCTTAGTTTTTGGAT GATCCTGGTTTGTTTTTTTAGCTCAAGCCTTGATACGGAAATGCGCGCTCGGGTATTAGTTATTTTAGGTTGGCTAAGTA TTGGTTTTATTCTTTTTTTGTTAATGACTTCCAATCCTTTCTTGCGCCAATTTCAAGTATTGAATACACAGGGCCGTGAT CTGAATCCATTGCTGCAAGATCCTGGCTTTTTATTCCATCCTCCTATGTTGTACATGGGATATGTAGGGTTTTGTGTCGC TTTTGCTTTTGCTATTGCCGCTTTATGGGCAGGGAAAGTAGAAACCAGTTGGTCTAAATGGACCAGACCCTGGACTCTGG CTGCCTGGTGTTGTTTAACCGCGGGAATTACTTTAGGCAGTTGGTGGGCTTATAGAGAATTAGGCTGGGGTGGTTGGTGG TTTTGGGATCCTGTAGAAAACGCTTCTTTTATGCCCTGGCTGGTTGGTACGGCACTATTGCATTCTTTGGCAGTTACAGA GCAACGCCAGCAATTTAAAGCGTGGACCATGTTGCTTGCAATCGCTGCTTTTTCTTTAAGTTTAATTGGTACTTTTCTTG TTCGCTCTGGAGTTTTAACTTCAGTTCATGCCTTTGCGGTTGATCCTCAGCGGGGATTATATATTCTGGGATTTTTGTTA TTCGTCATTGGGGGTTCTTTAACATTGTTTCTTTTCAGAGCCCAAACCTTGCAAGTCAATAAACATCCTGGCTTATTATC CCGAGAAAGTGCGTTGTTGTTAAACAATGTGTTTTTAGTGGTTATTATGCTGACGGTATTAATGGGCACGGTTTATCCAT TGCTGGTGGAAGGGTTAGGGTTAGGTAAATTATCCGTTGGAGCGCCCTATTTTAATGCAGTATTTGTTCCATTAATGATT CCTTTATTGTTGCTAATGGGGTTAGGTGTCCGTTTGAAATGGCAGAATGATTGTTGGAGGGATGTCTTCAGAAAGCTAAA TCGTATTTTTTTGCTTAGTCTGATATTGCCTGTCATTTTACTATTCTGTACCTCAACTGAAATACACCTTACAGCCCTTT TGGGATTAATTTTGGCATTCTGGGTTTTGTTGAGTACTGCTAATGCGGCGTATCACAAAGTCAGGGATAGAGGGGTGGCA GGAGTTGGACAGGCTTATTGGGGGATGGTTTTGGCTCATTGTGGTGTCGCAGCAACAGTGATTGGCATTGCTGTTTCTTC AGCTTATGGCGTACAAGATGATGTACGTATGTCTCCTGGCAAGCAAGTGAATCTGCTGGATTATCAGATTGGATTCATTA ATCAGACTCCGTTGAATGGCCCAAATTACAAAGGGACAAGGGCTGAGTTTTCAATACAATATCAGAATAAAACCAGGAAA ATTTTTCCTGAAAAAAGAGTGTATACCATTGGACAAATGCCAATGACTGAGTCTGCGATTGATGTTACTCCTTTCCGAGA TATTTACATTGCTTTGGGGGAACCACTGTCTGAGGATGCCTGGTCGGTACGTATTTATTATAAACCGTTGGTCCGCTGGA TTTGGGCTGGCGGATTTATGATTTTAGCCGGAGGCGTTTTGGCATTAACAGATAGAAGGTATTACAGAAAAAGGCAAGTA ACGGTAATGTCAGTGCGGGAGATCAAGATATGA Protein sequence : MIAELGLFFLVLALVASLMLALIPLAGLQFNRKDWIDSSRNYVVLQFLFVACAYLCLTACFLMDDFSVIYVLNNSSLLLP WFYKFCAVWGGHEGSMLLWVAILSFWMILVCFFSSSLDTEMRARVLVILGWLSIGFILFLLMTSNPFLRQFQVLNTQGRD LNPLLQDPGFLFHPPMLYMGYVGFCVAFAFAIAALWAGKVETSWSKWTRPWTLAAWCCLTAGITLGSWWAYRELGWGGWW FWDPVENASFMPWLVGTALLHSLAVTEQRQQFKAWTMLLAIAAFSLSLIGTFLVRSGVLTSVHAFAVDPQRGLYILGFLL FVIGGSLTLFLFRAQTLQVNKHPGLLSRESALLLNNVFLVVIMLTVLMGTVYPLLVEGLGLGKLSVGAPYFNAVFVPLMI PLLLLMGLGVRLKWQNDCWRDVFRKLNRIFLLSLILPVILLFCTSTEIHLTALLGLILAFWVLLSTANAAYHKVRDRGVA GVGQAYWGMVLAHCGVAATVIGIAVSSAYGVQDDVRMSPGKQVNLLDYQIGFINQTPLNGPNYKGTRAEFSIQYQNKTRK IFPEKRVYTIGQMPMTESAIDVTPFRDIYIALGEPLSEDAWSVRIYYKPLVRWIWAGGFMILAGGVLALTDRRYYRKRQV TVMSVREIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-114 | 52 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-122 | 51 |
