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Name : HCBAA847_1434 (HCBAA847_1434) Accession : YP_007601295.1 Strain : Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 Genome accession: NC_020555 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1381132 - 1384419 bp Length : 3288 bp Strand : - Note : similiar to HCN_1361 of H. cinaedi PAGU611 DNA sequence : TTGAAAAAAGAATCTAATGACTTCGTATTTAGAGCCAAAAGAAACTTTTTTATTGCTTTACAAGATGCCAAGACAACTTG GAAGAAAATAAAATTCAAAAAATTGCCTTTAATTATCATTGTGGGGGAAGAAGGTGCTGGGAAAAGCACTTTTATCAATT ATTCTAATGTAGAATATCCCTTAAGTGATAGTCTGCAATCTTATAAGAAATTTCATCAATCCACTAATAATTTTTCTTTG TATGTTTCTAAAAATGGAGCTTTGCTTGATACAGAGGGAAATTATTTTTCTCAAGAAAAGTTTTTTGTCCCATCAAGCAG TGATGAACTTCCAGAAGATGATTTAGATAAAAACAAAGAATTTCTGATTAAAAAGAATATTTGGAGGATTTTTTTAAACT TCTTAAATAGAAACTTTTTTCATAATAAGCTCAATGGCATAGTTTTAGTAATAGATACAAGATTATTTTTAAGCAATCCC AAAGAGTATTCAAAAGATATTATTCGCTATCTTGTAAAAAGAGTAAATGATTGCGAAAATTATCTTAATCTTCAATTTCC TATTTATGTAGTTTTTTCTAAGATTGATTTATTAGAGGGCATGAAAGAGTTTTTTGAAATTTTTAATGAAAGAATAGTTG ATAGAGCTTTAGGTATTAGTTTTAAAGAGAAGTTAAATGATGATATTTTAGATAAACGGTTAAAGCAACTAAGTCAGTCT TTGTTTTTAAATTTTACCAATAAAAATCATTTTATTCATTCTCTTGAGGACAAAAACAAGACTTATCTTTTTTTAAAGCA GTTTGATAATCTATTCGCTTTAGCAAAAAACTTTCTTTTAGAGATACAGAACGAAAACACATTTAAGAATAATTCTTTGT TAAGAGGAGTGTATTTTGTAAGTGCTTATCAAGAAAATATTCCTAGAAACTTTTTACTCGATAGTATATGTGAGAAATAC AATATTAAAAAAACATTAGCAAAAGTGAATCCCTTACACAATAAGCAGAGTTACTTTGTGAAATCTTTATTAGATGATAT TATTTTTAAAGATTATTCTTTGAGCAGTATGAAAAATATTTTTAAAAAGTTTTCTTTATTGTTGCTTGTATTAATTGTAA GTTTAAGCACTTATTTCTTATCCTTTTATTTTATTTCTAGGCATAAAGCAGAAAAAGAAAAGGCAGAAAGCACTTTAACC GCATTGCAGGTTTTATTAAGTGATACAGACTACAAAAAGTTTAGTATAAAAGAAAGAGCAAATTTACTTGCAAATTTAAA AAATATTTTGGGTGTCTATCCTCAACTCTTAGCAAATAATAATCTTATGCAATATCCAAGTTTGAATATATCATATAGAG GTTTTTTAAATGCTCAAGAGTTTTATTATAAATTGAACGAAGATGTGCTTAAAAATACTTTACTTAAAGAGATGGAATAT ATTTTACAAACAGATGAAAATGATAAAAATAATTTAATAAAAACTTTGTATATGTATAAATCTTTATTTGAACAAAAATA TTTGAACAAAAATTTGCTTAAAATTTGGATTAATGAAAATTGGCAATTACTAAGTAAATATAATATTTCTAGGGAGAATT TCTTAAGTGGAGTTGATGCTATTCAAAAGATTCATATAGAAAGTTTTTATGAAGATAAAAAGAGCATTGAATTAGCAATC AAAATGCTACAAAGAACGACATCAAGACCACAAAGACTATATGTTTTGTTAAATTTTTTAAATAGTGATAAACGAAAAGA AATTTATAAAATAAAAGAAGAATTAGGCTTTGCCGCGACTAATGTTTTTGCAGAATCAAGTAAAATAGCTTCCATAGATA AAATCTATACCAAAAATGGAATGATAGGATTTTTACAAAATCTCAATCAAAATGTAGATGATATAATAAATATAGAATCT TGGATGCTTGAAAGCACTGATGGCTTGACAAAAGAAAATAAGGGTATGCTTTCTATAGACATACTCAAATTGTATTTAGT GGAATATCAAAATAAATGGGAAGATTTACTTCTTTCTCTTGCACCAAAACAATATAATTCTAAAGAATCTATACTCAATC AGCTCGATATTCTATCTAAAAAGGATAATCCTGTATCGACTTTAATTAGAATCGTTAGCACTAATACCAAGTTAAATGAT GCTTTTTTGCTTGGAGAAGCCTATAATATAGGGCTTAATGCCAATGAGATTAAAACACATTTTGGCAATATTACCCATTT TTTTAGTTCTTATCATAAAATTGCGGAGCAAGATTCTATTCTAAGTTCTGGAGCTTCGGCAGTAGGTCTTAATATCAATA ATGATGTAAAGATTATGGAAGTTCTTGGTTTAGATATTAAAAACATCCAAACCAAGATAATAGAGTTTGGCACAAATAAT ACTCAAAGTGTTGAAAATAAGATAGCATATGCACTTAATCGTGGAAAAGAACAAGATGACCCTTTTATAGTGTTTGTTAA TGATATTAAAAAGCTTCCGCCAGAATTGGAAAAATATTATGCAAAATTACATTTATATGCTTGGAATCTCGTAGAGTCTC ACGGAGTCTCTTTGCTTAATACTGCTTGGTTCAATGAAGTTTATACCCCCTTTATCAATGATATTGCCCCTTTTTATCCT TTTAATGATGAAAGCACACAGCAATTAAGTATAGATTCTTTCAAAGAATTCTTTGGCAGAAATGGGACTATTAATAGGTT TTATGATAAATATTTAAATTCTGTACTAGTTAAGAAGACAAATACTTATTCCTTAAATACTCAATCTGATGTTAAAATAA ATTTTTCTAAGAATTTTTTAGATTTTATGAGAGAGACTAAAAACCTTTCATACTTAATGTTAAACTCAAATGATAATATA AGAGTTAATTTTACATTACAAAGTTTAGATTTGAGTGCCGATTTCTCTTCTATAGAATTACAATACAATTCTCATAATAT GAAGTATGACCATACTTTAAATTCTGCTCTACAGATTATTGGAGAACAATTTAATAATAATACGAATTTGAATTTGACAG CTTTTGATTACCACAATTTAAATTTAAGCCATCATAAAATGTATATTGGCGAGTGGGCTTGGTATAGATTCTTAAAAGAA AATCAAAATAATGGTGCGTATAGTGTAATTTTTAATAATAATAAAAAATTATATTTTGATTTTAAATTGATTAATGGTGC TTCAGAGACTCATCAAATCCTTAATGCACTCCCGCAGATAAAAATCGTAGAACGTATTACAATAGGAGGAAATAACAATG GCAGATAA Protein sequence : MKKESNDFVFRAKRNFFIALQDAKTTWKKIKFKKLPLIIIVGEEGAGKSTFINYSNVEYPLSDSLQSYKKFHQSTNNFSL YVSKNGALLDTEGNYFSQEKFFVPSSSDELPEDDLDKNKEFLIKKNIWRIFLNFLNRNFFHNKLNGIVLVIDTRLFLSNP KEYSKDIIRYLVKRVNDCENYLNLQFPIYVVFSKIDLLEGMKEFFEIFNERIVDRALGISFKEKLNDDILDKRLKQLSQS LFLNFTNKNHFIHSLEDKNKTYLFLKQFDNLFALAKNFLLEIQNENTFKNNSLLRGVYFVSAYQENIPRNFLLDSICEKY NIKKTLAKVNPLHNKQSYFVKSLLDDIIFKDYSLSSMKNIFKKFSLLLLVLIVSLSTYFLSFYFISRHKAEKEKAESTLT ALQVLLSDTDYKKFSIKERANLLANLKNILGVYPQLLANNNLMQYPSLNISYRGFLNAQEFYYKLNEDVLKNTLLKEMEY ILQTDENDKNNLIKTLYMYKSLFEQKYLNKNLLKIWINENWQLLSKYNISRENFLSGVDAIQKIHIESFYEDKKSIELAI KMLQRTTSRPQRLYVLLNFLNSDKRKEIYKIKEELGFAATNVFAESSKIASIDKIYTKNGMIGFLQNLNQNVDDIINIES WMLESTDGLTKENKGMLSIDILKLYLVEYQNKWEDLLLSLAPKQYNSKESILNQLDILSKKDNPVSTLIRIVSTNTKLND AFLLGEAYNIGLNANEIKTHFGNITHFFSSYHKIAEQDSILSSGASAVGLNINNDVKIMEVLGLDIKNIQTKIIEFGTNN TQSVENKIAYALNRGKEQDDPFIVFVNDIKKLPPELEKYYAKLHLYAWNLVESHGVSLLNTAWFNEVYTPFINDIAPFYP FNDESTQQLSIDSFKEFFGRNGTINRFYDKYLNSVLVKKTNTYSLNTQSDVKINFSKNFLDFMRETKNLSYLMLNSNDNI RVNFTLQSLDLSADFSSIELQYNSHNMKYDHTLNSALQIIGEQFNNNTNLNLTAFDYHNLNLSHHKMYIGEWAWYRFLKE NQNNGAYSVIFNNNKKLYFDFKLINGASETHQILNALPQIKIVERITIGGNNNGR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| HH0252 | NP_859783.1 | hypothetical protein | Not tested | HHGI1 | Protein | 0.0 | 45 |
