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Name : PCNPT3_10435 (PCNPT3_10435) Accession : YP_007640863.1 Strain : Psychromonas sp. CNPT3 Genome accession: NC_020802 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2461253 - 2463211 bp Length : 1959 bp Strand : - Note : COG1138 Cytochrome c biogenesis factor DNA sequence : ATGCTGGCTGAAATTGGACAAATTGCACTCGCAATCGCTTGTATGTTAGCGCTTCTACAGGCGGTATATCCGCTGTATGG TGTTTATAGTGGTCATCAAGGTGCAATAAAGTCGGCGAAAACATTTACTATTTTACAATGTATTTTTGTCACCTTGGCTT TTATTATTTTAAGCTACCTCTTTTTAATTAATGATTTCACAGTGGCTTATATTGCCTCGAACTCTAACAGTGCATTACCT TGGTATTATCGATTATCGGCAGTATGGGGATCGCATGAAGGATCCTTATTATTATGGGTATTTTTATTGTCATTATGGAG TATGGCGGTAGCGGTGCTCAGTAAGCGATTACCCATAGAATCGGTTGCGCGTGTCTTAGCTATTTTAGGGCTGTTATCTT TGGGGTTTTATTTATTTGTATTATTTACATCTAATCCTTTTTTACGAACGTTGCCTTATTTCCCTGTGGATGGACGTGAT TTAAACCCATTATTACAAGATGTTGGGCTTATTATCCATCCCCCTATGTTGTATATGGGCTATGTGGGATTTTCTGTTGC GTTTGCTTTTGCAATTGCTGCATTAATGGAAGGTCGTTTAGACAGCGCTTGGGCTAAATGGTCTCGACCTTGGACGATGG CAGCTTGGATATTCCTGACATTAGGTATCGCATTAGGCAGTTGGTGGGCTTATTACGAATTAGGCTGGGGCGGTTGGTGG TTTTGGGATCCTGTTGAAAATGCTTCGTTTATGCCTTGGCTAGTGGGCACTGCTCTTATCCATTCTTTAGCTGTGAGTGA GAAGCGAGGCGTCTTTAAATCTTGGACTGTGTTACTTGCCATCAGTGCATTCTCATTAAGTTTATTGGGGACGTTTTTAG TGCGCTCTGGCATATTAGTATCTGTACATGCTTTTGCCAGCGATCCTTCTCGTGGTTTATTTATTTTAGCGTTTTTAATT TTAGTTATCGGTGGCTCGTTATTACTTTTTGCCTTGCAAGCTTCAAAGGTAAAAAGTCGAGGCCGTTATGCTTTTATCTC GCGTGAAACGTTTTTACTGATTAATAATATTTTATTGATAGCCGCTTTAATTGTGGTTTTATTAGGAACATTATTGCCAT TAGTGCATAAACAGCTGGGATTGGGGAGCATATCAATTGGTGAACCTTTCTTTAATCGTATGTTTAGTGTGTTGATAGTG CCTTTTGCTTTGTTTTTAGGTGCTGCGCCTTTATTGCGCTGGAAACGCCAAAAAATGAGTGAGCTTTTTAAACCTTTTTT ACATTCATTACTGCTTAGTATTTTAGCGACGTTCTTGTTTTTATATACATTTAGTTCGCATTTTACATGGCTTGCATTGA TGGGCGTTTTCCTTGGGTTTTGGATAGTGATGACCGTTACTTATGAACTCTACTTACGCTCTACACATCGTAACAGCCTC TTTCCTGGTTTAATGAAATTAGGATATAGTCATTGGGCGATGAGCTTAGGGCATTTGGGTTTTGCTGTGCTTATCATTGG TATCACGATGACCCAGAACTTCTCTATTGAGCGTGATGTAAAACTGGCCGTTGGGGACAGTATTGTTTTTGAAAATTATG AATTTAATTTTGATGCGGTCGAGCCTCTGGTTGGTAAAAACTACACGGGCACTGCCGGTATTTTTAATATTAAAAAGCAA GGCCAACATGTTGCCACAATGAAAGCGGAAAAACGCATTTACAGTGTGCAACGTATGCCAATGACGGAAGCTGCCATTGA TGCGGGTATTACGCGCGATTTGTATATTGCAATGGGTGAAATGCTAGAGGATGGATCGTGGGCTGTACGTATTTATTATA AACCGTTTATTCGTTGGATCTGGTTTGGACCTTTATTGATGGCCTTTGCCGGATTGTTGATGATGCTCGATAGCCGTTAT CGTGTTAAAAAAACGCCTCTAAAAGGAGGTGTGTCATGA Protein sequence : MLAEIGQIALAIACMLALLQAVYPLYGVYSGHQGAIKSAKTFTILQCIFVTLAFIILSYLFLINDFTVAYIASNSNSALP WYYRLSAVWGSHEGSLLLWVFLLSLWSMAVAVLSKRLPIESVARVLAILGLLSLGFYLFVLFTSNPFLRTLPYFPVDGRD LNPLLQDVGLIIHPPMLYMGYVGFSVAFAFAIAALMEGRLDSAWAKWSRPWTMAAWIFLTLGIALGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASFMPWLVGTALIHSLAVSEKRGVFKSWTVLLAISAFSLSLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPSRGLFILAFLI LVIGGSLLLFALQASKVKSRGRYAFISRETFLLINNILLIAALIVVLLGTLLPLVHKQLGLGSISIGEPFFNRMFSVLIV PFALFLGAAPLLRWKRQKMSELFKPFLHSLLLSILATFLFLYTFSSHFTWLALMGVFLGFWIVMTVTYELYLRSTHRNSL FPGLMKLGYSHWAMSLGHLGFAVLIIGITMTQNFSIERDVKLAVGDSIVFENYEFNFDAVEPLVGKNYTGTAGIFNIKKQ GQHVATMKAEKRIYSVQRMPMTEAAIDAGITRDLYIAMGEMLEDGSWAVRIYYKPFIRWIWFGPLLMAFAGLLMMLDSRY RVKKTPLKGGVS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 7e-132 | 59 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-117 | 52 |
