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Name : ccmF (TOL_1077) Accession : YP_007681750.1 Strain : Thalassolituus oleivorans MIL-1 Genome accession: NC_020888 Putative virulence/resistance : Unknown Product : heme lyase, subunit CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1140464 - 1142458 bp Length : 1995 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACAGAGCTGTACAGTATGGTGCCCGAATTTGGCCAACTAGCGTTAATATTTGCTTTTGTCTGCGCCGCTTTTCAAGT GGTCATTCCATTGGTAGGCGTAAATCGTGGAGCGCCTTGGCTAATGGCGTATGCCCGCCCTTTGGCGACTGGCCAAGCGC TATTTTTATTGATATCGCTATTTTCTTTAGCGTATTGCTTTGTTGTTGATGATTTCTCGGTGGCGTATGTCGCTGCCAAT AGCAATACCGCGTTACCAACACCCTTTAAAATCAGCGCGGTATGGGGCGCTCATGAAGGCTCTTTGCTGCTATGGGTAAC TATGCTTGGCTTGTGGAGCTTGGCGGTTGCTTGGTTAAGTAAGTCGTTACCTATCGATATGATTGCTCGAGTACTTGCGG TAATGGGCATGGTGTCGGTGGGCTTTATTTTGTTCACCCTTGAAACCTCAAATCCATTCAGTCGTCATTTGCCATCGGCT CCAGCCGAAGGCGGCGACCTTAATCCCTTGCTACAAGATTTCGGTTTGATTGTGCATCCGCCTACTTTGTACATGGGTTA CGTTGGCTTATCAGTGGCTTTTGCTTTTGCTATCGCAGCGTTAATGAGTGGTCGTTTGGATGCCGCTTGGGCGCGTTGGT CGCGTCCGTGGACAACCGCTGCGTGGATCTTCCTAACTGTCGGCATCGCATTGGGTAGCTGGTGGGCGTATTACGAACTT GGCTGGGGTGGCTGGTGGTTCTGGGATCCGGTAGAAAATGCATCATTAATGCCTTGGCTGGTTGCAACTGCGTTACTGCA TTCCTTAGCGGTAACGGAAAAACGCGGTTTATTTAAAAGCTGGACTGTGTTGCTGGCGATCTTTGCTTTTTCGTTAAGTT TACTCGGCACCTTCTTGGTTCGTTCTGGGGTATTAACTTCCGTGCATGCGTTCGCTTCTGATCCTGAGCGCGGTATTTTT ATTCTCGCATTGCTCGGTATCTGTGTTGGTGGATCCTTACTTTTATACGCGATAAAAGCACCGACCGTAGCCTCAACGGG ACGTTTCGAGCTGGTATCGCGCGAGATGTTTTTACTGCTAAATAACTTGCTGTTAGTGGTCATCGCTTTAGCTATTTTAA TCGGAACACTATATCCGCTTGTGTACGATTTTATGGGACTCGGCAAATTGTCTGTGGGTGCCGCTTGGTTTAATACTATG TTTGTTCCGCTTAGCGTAGGTCTTGCGGTTGTGGTGGGTGCAGGTGCTATGTCACGCTGGAAAGTCGATTCGCTTGGTCG TATCGGCACTATGCTTTGGCCTGCGGCGATAGCAGCGATTGTTTTTGCCATTATTACGCCAATGATTATCAGCGGTGAAT TGAAAGGCATGGTGGTGCTTGGTTTAAGCGTCAGTATTTGGCTCACGCTAGCCACCTTTATTGATGTGTGGAAAAAATCA CGCGGACAAATTACTCGAATTCCTAATTTAGGAATGAGTTATCTCGGTATGATTTTGGCGCACTTAGGTGTGGCGGTGAC GATTGTGGGTGTCACTATGGTGGCTAACTACAGTACTGAAAAATCGGTAAGGATTGCTCCTGGTGAACGTGAAACCTTAG GTGATTATGTCTTTGAATTTGCTCAGGGCGGACACATCACTGGGCCAAACTATACCTCTGATGCCGTGCGCTTTAATGTG TATGAAGATGACAAGTTAATTAGCACTTTGATGGCGGAAAAGCGTCGCTATACCGCTCGTGGTTCGGTGATGACAGAGGC GGCTATTGATGTCTCTTTGTTCCGTGATTTATACGTCTCTATGGGCGAACCGTTAGACAACGGTGCTTGGGGGATGCGCT TGCAGGTTAAGCCATTTATGCGCTGGGTATGGCTGGGTGCTATTTTTATGGCGTGTGGTGGTTTCTTAGCTATGTTGGAT AAACGCTATCGTCGTCGCGCTGATAAAAAAGTAACGGCAGCAAAAGGTGCTGAACTGGGGGGAGTAAACGCATGA Protein sequence : MTELYSMVPEFGQLALIFAFVCAAFQVVIPLVGVNRGAPWLMAYARPLATGQALFLLISLFSLAYCFVVDDFSVAYVAAN SNTALPTPFKISAVWGAHEGSLLLWVTMLGLWSLAVAWLSKSLPIDMIARVLAVMGMVSVGFILFTLETSNPFSRHLPSA PAEGGDLNPLLQDFGLIVHPPTLYMGYVGLSVAFAFAIAALMSGRLDAAWARWSRPWTTAAWIFLTVGIALGSWWAYYEL GWGGWWFWDPVENASLMPWLVATALLHSLAVTEKRGLFKSWTVLLAIFAFSLSLLGTFLVRSGVLTSVHAFASDPERGIF ILALLGICVGGSLLLYAIKAPTVASTGRFELVSREMFLLLNNLLLVVIALAILIGTLYPLVYDFMGLGKLSVGAAWFNTM FVPLSVGLAVVVGAGAMSRWKVDSLGRIGTMLWPAAIAAIVFAIITPMIISGELKGMVVLGLSVSIWLTLATFIDVWKKS RGQITRIPNLGMSYLGMILAHLGVAVTIVGVTMVANYSTEKSVRIAPGERETLGDYVFEFAQGGHITGPNYTSDAVRFNV YEDDKLISTLMAEKRRYTARGSVMTEAAIDVSLFRDLYVSMGEPLDNGAWGMRLQVKPFMRWVWLGAIFMACGGFLAMLD KRYRRRADKKVTAAKGAELGGVNA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-120 | 54 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-134 | 53 |
