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Name : lysS (SLY_0330) Accession : YP_007996529.1 Strain : Candidatus Phytoplasma australiense NZSb11 Genome accession: NC_021236 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 277688 - 279181 bp Length : 1494 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAAAAAAATGACAGAACAAGAAGGAATTAGACACCAAAAAATAGAAGAATTGAAAAAATTAAAAACTGAACCTTT TGGTAAAAATTTCACTTGTTCGCACACAATTGAAAACATTATTTTAAATTATCAAAACATTGATCAAGAATGGTTCGAAG AAAACAAAGTTAATGTAAAAATTGCAGGAAGAATTATTTTAAAAAGAGGACAAGGAAAAGCCGGATTTTTACATCTACAA GATTTTAATTTTAAAATTCAAGTTTATCTTAGATCTGATTTATTAGGGGATGCTTTCCTTCTTTATCAAAATTGTGATTT AGGTGATATCGTAGGGATTAAAGGTTTTTTGTTTAAAACTAAAACAAAAGAGCTCACAATTAAAGCTCTAGATTTTATCC ATTTAACTAAATCTTTAAAACCATTACCAGATAAATTTCATGGTTTGCAAAACCGCGAAGAGATGAGAAAAAAACGTTAT TTAGATCTTATGGTTAATGAAAAAAGTCGACAAGTTTTTTTAACTCGTAGTTTAATTATCAAATCAATTCGTAATTTTTT TGATAATGAGGGCTTTTTGGAGGTAGAAACCCCCATTTTGCAACCTTCTTTGGGCGGAGCTTCTGCCAAGCCATTTATTA CTAGCCATAACGCTTTAAATTCTGATTTTTATTTAAGGATAGCTACCGAACTGCCTTTAAAAAAATTAATTGTTGGTGGT ATGCCAAAAGTTTATGAAATTGGTCGAATTTTCCGTAATGAAGGAATGGATGCAACCCATAACCCGGAATTTAGCACTAT AGAGGCTTATCAGGCTTATTCTGATATACAAGGAATGATGGAATTAACTCAAAAATGTCTTCAGTATATTTGTCAAACTG TTTTAAAAAGTTTAGAAATCAATTACCAAAATAAAAAAATTAGTTTTCAAACTTTTCAAAAAATTAGCATGACAGATGCT ATCAAAAAAGAAACAGGCATTGATTTCCAAAAAAAATTATCTCAAGAAACTTGTTTACAATTAGCAAAACAACATGATAT CAACGTCATGTCTCATTTTAGTCAAGGTCATATTATTGAAGCTTTTTTTGAAAAATACGTTGAACATAAATTAATCCAGC CTACTTTTATTTACGGCCATCCTTTAGAAATTAGTCCTTTAGCCAAAAAAAATCTTAATGACCCTCGTTTTACTGATCGT TTTGAACTTTTTATCGCTGGAAAAGAATTTGTGAATGCTTTTAGCGAATTAAACGACCCCATCGAACAAGAAAAACGTTT TTTAAATCAATTAAAACAAAAAGAATTAGGTGACGATGAGGCTTGTGAAATGGATTATGATTTTTTAGATGCCTTAAGTT ACGGTATGCCTCCCACTGGTGGGCTCGGAATGGGAATTGATCGAATAGTGATGCTTTTAACCGATACTCCCAATATCCGT GATGTTATTTTATTTCCTCATTTCAAAAATAAAAACATTATTAAGAAAAAATAA Protein sequence : MNKKMTEQEGIRHQKIEELKKLKTEPFGKNFTCSHTIENIILNYQNIDQEWFEENKVNVKIAGRIILKRGQGKAGFLHLQ DFNFKIQVYLRSDLLGDAFLLYQNCDLGDIVGIKGFLFKTKTKELTIKALDFIHLTKSLKPLPDKFHGLQNREEMRKKRY LDLMVNEKSRQVFLTRSLIIKSIRNFFDNEGFLEVETPILQPSLGGASAKPFITSHNALNSDFYLRIATELPLKKLIVGG MPKVYEIGRIFRNEGMDATHNPEFSTIEAYQAYSDIQGMMELTQKCLQYICQTVLKSLEINYQNKKISFQTFQKISMTDA IKKETGIDFQKKLSQETCLQLAKQHDINVMSHFSQGHIIEAFFEKYVEHKLIQPTFIYGHPLEISPLAKKNLNDPRFTDR FELFIAGKEFVNAFSELNDPIEQEKRFLNQLKQKELGDDEACEMDYDFLDALSYGMPPTGGLGMGIDRIVMLLTDTPNIR DVILFPHFKNKNIIKKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 3e-92 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_007996529.1 | Lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 2e-92 | 45 |
