|
Name : ccmF (LP6_0850) Accession : YP_008062567.1 Strain : Legionella pneumophila Thunder Bay Genome accession: NC_021350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 941746 - 943698 bp Length : 1953 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATAGCGGAATTAGGGCTGTTTTTTTTGATTTTGGCTTTAGTGGCTTCTTTGATGTTAGCTTTGATTCCATTGGCGGG TTTGCAATTCAATCGGAAAGACTGGATTGATTCCTCCAGGAATTATGTCGTACTGCAATTTTTATTTGTGGCATGTGCTT ACCTATGTCTCACGGCCTGTTTTTTGATGGATGATTTTTCGGTGAACTATGTGCTGAATAACTCCAGCTTATTGCTCCCA TGGTTTTATAAATTTTGTGCTGTGTGGGGTGGGCATGAAGGTTCCATGCTGTTATGGGTCGCTATCCTTAGTTTTTGGAT GATCCTGGTTTGTTTTTTTAGCTCAAGCCTTGATACGGAAATGCGCGCTCGGGTATTAGTTATTTTAGGTTGGCTAAGCA TTGGTTTTATTCTTTTTTTGTTAATGACTTCCAATCCTTTCTTGCGCCAATTTCAAGTATTGAATACACAGGGCCGTGAT CTGAATCCATTGCTGCAAGATCCTGGCTTTTTATTCCATCCTCCTATGTTGTACATGGGATATGTAGGGTTTTGTGTCGC TTTTGCTTTTGCTATTGCCGCCTTATGGGCAGGGAAAGTAGAAACCAGTTGGTCTAAATGGACCAGACCCTGGACTCTGG CTGCCTGGTGTTGTTTAACCGCGGGAATTACTTTAGGCAGTTGGTGGGCTTATAGAGAATTAGGTTGGGGTGGTTGGTGG TTTTGGGATCCTGTAGAAAACGCTTCTTTTATGCCCTGGCTGGTTGGTACGGCACTATTGCATTCTTTGGCAGTTACAGA GCAACGCCAGCAATTTAAAGCGTGGACCATGTTGCTTGCAATCGCTGCTTTTTCTTTAAGTTTAATCGGTACTTTTCTTG TTCGCTCTGGAGTTTTAACTTCAGTCCATGCCTTTGCTGTTGATCCTCAGCGGGGATTATATATTCTGGGATTTTTGTTA TTCGTCATTGGGGGTTCTTTAACATTGTTTCTTTTCAGAGCCCAAACCTTGCAAGTCAATAAACATCCCGGCTTATTATC CCGAGAAAGTGCGTTGTTATTAAACAATGTGTTTTTAGTGGTTATTATGCTGACGGTATTAATGGGCACGGTTTATCCAT TGCTGGTGGAAGGGTTAGGGTTAGGTAAATTATCCGTTGGAGCGCCCTATTTTAATGCGGTATTTGTTCCATTAATGATT CCTTTATTGTTGCTAATGGGGTTAGGTGTCCGTTTGAAATGGCAGAATGATTGTTGGCGGGATGTCTTCAGAAAGCTAAA TCGTATTTTTTTGCTTAGTCTGATATTGCCTGTCATTTTACTATTCTGTACCTCAACTGAAATACACCTTACAGCCCTTT TGGGATTAATTTTGGCATTCTGGGTTTTGTTGAGTACTGCTAATGCGGCGTATCACAAAGTCAGGGATAGAGGGGTGGCA GGAGTTGGACAGGCTTATTGGGGGATGGTTTTGGCTCATTGTGGTGTCGCAGCAACAGTGATTGGCATTGCTGTTTCTTC AGCTTATGGCGTACAAGATGATGTACGTATGTCTCCTGGCAAGCAAGTGAATCTGCTGGATTATCAGATTGGATTCATTA ATCAGACTCCGTTGAGTGGCCCAAATTACAAAGGGACAAGGGCTGAGTTTTCAATACAATATCAGAATAAAACCAGGCAA ATTTTTCCTGAAAAAAGAGTGTATACCATTGGACAAATGCCAATGACTGAGTCTGCGATTGATGTGACTCCTTTCCGAGA TATTTACATTGCTTTGGGGGAGCCACTGTCTGAGGATGCCTGGTCGGTACGTATTTATTATAAACCGTTGGTCCGCTGGA TTTGGGCTGGCGGATTTATGATTTTAGCCGGAGGCGTTTTGGCATTAACAGATAGAAGGTATTACAGAAAAAGGCAAGTA ACGGTAATGTCAGGGCAGGAGATCAAGATATGA Protein sequence : MIAELGLFFLILALVASLMLALIPLAGLQFNRKDWIDSSRNYVVLQFLFVACAYLCLTACFLMDDFSVNYVLNNSSLLLP WFYKFCAVWGGHEGSMLLWVAILSFWMILVCFFSSSLDTEMRARVLVILGWLSIGFILFLLMTSNPFLRQFQVLNTQGRD LNPLLQDPGFLFHPPMLYMGYVGFCVAFAFAIAALWAGKVETSWSKWTRPWTLAAWCCLTAGITLGSWWAYRELGWGGWW FWDPVENASFMPWLVGTALLHSLAVTEQRQQFKAWTMLLAIAAFSLSLIGTFLVRSGVLTSVHAFAVDPQRGLYILGFLL FVIGGSLTLFLFRAQTLQVNKHPGLLSRESALLLNNVFLVVIMLTVLMGTVYPLLVEGLGLGKLSVGAPYFNAVFVPLMI PLLLLMGLGVRLKWQNDCWRDVFRKLNRIFLLSLILPVILLFCTSTEIHLTALLGLILAFWVLLSTANAAYHKVRDRGVA GVGQAYWGMVLAHCGVAATVIGIAVSSAYGVQDDVRMSPGKQVNLLDYQIGFINQTPLSGPNYKGTRAEFSIQYQNKTRQ IFPEKRVYTIGQMPMTESAIDVTPFRDIYIALGEPLSEDAWSVRIYYKPLVRWIWAGGFMILAGGVLALTDRRYYRKRQV TVMSGQEIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 8e-122 | 51 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-113 | 50 |
