Gene Information

Name : nifS (Abm4_1184)
Accession : YP_008075511.1
Strain : Methanobrevibacter sp. AbM4
Genome accession: NC_021355
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cysteine desulfurase NifS
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1417261 - 1418466 bp
Length : 1206 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGTATATATGGATAATTCAGCAACTTCACCTGTTGATCCTGAAGTTTTTGAAGAAATGAAACCATTCTTTGTAGAGAA
TTTTGGAAATGCTTCTACATTATATGAAATAGGTAGGGTTTCTCAAAGAGCTGTTGCAAAGGCTCGTCAACAAGTTGCAG
ATTTAATTAATGCTGATACAAGAGAAATTATATTTACTAGTGGAGGTTCAGAATCCGATAACTTTGCAATTAAAGGAATT
GCTTTAAGGGAAAGATCCAAACATCCAGAAAAGAATCATATTATCACAAGTCAAATTGAACACCCTGCAGTATTAGAGAC
TTGTCGATACTTGGAAAAATGGGGATTTGAAGTCACCTACCTACCAGTAGGACCTACCGGTTTAGTTGATCCTGAAGATC
TTGAAAACGCTATTAAAGATGAAACATTCCTTGTAACAATTATGCATGCAAACAATGAAATCGGTACAATAGAGCCTATC
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AGATGTTAAAAAACAGAATATTGATTTACTTTCAATAAGTTCACATAAATTATATGGACCTAAAGGTGTAGGTGCATTAT
ACATTAGGAAAGGTGTTAAAATTGATCCTTTAATCCATGGTGGTGGTCAGGAAAGAAAACTTAGAGCTGGAACAGAAAAT
GTTGCAGGAATTGTAGGATTCGGTAAGGCATGTGAAATTGCACAGAGGGACATGGAGAAAAATACCGCTAAGTTAACTGA
AATCAGAGATGCTATTATCAAAAGGGTTCTTGAAGAGGTACCTGAATCCTATGTAAATGGTGACTTGGAACATAGGTTAG
CTAACAATGTTCATTTGAGATTCTCTGGAATTGAAGGTGAATCATTATTATTAAGACTTGATGCTAAAGGAATTCAAGTA
GCAACAGGTTCTGCATGTTCATCTCAAAAATTAGAACCATCACATGTTTTAACAGCTATTGGTTTAGAACCGGCATTAGC
TCATGGATCTTTAAGATTGTCTTTAGGTGTTGAAAACAGTATTGATGATGTTGATTATGTTGTAGATTCCATTAAGGAAG
TAGTTGACGGTCTTAGAAAAATGTCTCCTTTATGGGACTATACCAATCAGAAATATATTGAAATTAACAAAGAAGATGTA
TATTAA

Protein sequence :
MVYMDNSATSPVDPEVFEEMKPFFVENFGNASTLYEIGRVSQRAVAKARQQVADLINADTREIIFTSGGSESDNFAIKGI
ALRERSKHPEKNHIITSQIEHPAVLETCRYLEKWGFEVTYLPVGPTGLVDPEDLENAIKDETFLVTIMHANNEIGTIEPI
EKLGEIAHKHNVLFHTDAVQSAGKVPIDVKKQNIDLLSISSHKLYGPKGVGALYIRKGVKIDPLIHGGGQERKLRAGTEN
VAGIVGFGKACEIAQRDMEKNTAKLTEIRDAIIKRVLEEVPESYVNGDLEHRLANNVHLRFSGIEGESLLLRLDAKGIQV
ATGSACSSQKLEPSHVLTAIGLEPALAHGSLRLSLGVENSIDDVDYVVDSIKEVVDGLRKMSPLWDYTNQKYIEINKEDV
Y

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAT96060.1 cysteine desulfurase Not tested T-PAI Protein 3e-67 47