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Name : CYCME_1162 (CYCME_1162) Accession : YP_008373851.1 Strain : Cycloclasticus zancles 7-ME Genome accession: NC_021917 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Preprotein translocase subunit SecD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1162385 - 1164202 bp Length : 1818 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCGTTAGTTGTTGCTATTATTTACGCACTACCAAATCTTTACGGTGAAGACCCTTCTGTACAAATTTCGCCTTTGCG TGGTGCGGTCATCAACAGTTCTGTTTTAGCTGATGTAAAAGATCAGCTAGCACAAAAAGGTGTTGCCTTATTAAAAGGTG AGTTGAATGACAGCCAAATTTTGTTGCGCTTCAAGCATTCGAATGATCAACTTAAGGCGGTTGATATTATTAAGTCGGTC TTAGGGAATAACTATGTTGTGGCTCTTAATTTGGCGCCAACAACCCCTCAATGGTTGCGTTCGTTAAATGCAGCGCCTAT GTATTTAGGCTTGGATTTAAGAGGTGGTGTGCATTTCTTACTGGAAGTGGATATGCAAGCTGCTGAGAAGCAAGCAGTAG ACCGTGGTGCGGCTGATTTTCGCCAATATTTGCGCGAAAATAAATTGCGTTATCTAAGCGTTATGGTCAATGGCCACAAT GTTGGTATTAAATTTAGAAACCAACAGATTCATGACGAGGCGATCAGCAAATTGGAGTCTCAGTTCCGTACTTGGGACTT TAAGCCTGAAGTTAGCGAGTCCTCAACGCCCACCTTAACGGCAACGATGTCAGATGATGAGTTAATGGACGTAAGAAACT ATGCTGTTCAGCAAAATATCATTACGTTAAAAAATCGTGTTAATGAGTTAGGTGTTGCAGAGCCTGTTATTCAAAGACAG GGTGAAAGCCGTATTGTTGTTGAATTACCTGGTGTCCAGGACACGGCTCGTGCAAAAGAGATTTTAGGTGCAACCGCAAC ACTTGAGTATCATCTGGTTGATACGCAAAATTCAGTGTCATCTGCATTAGCTGGAAGAGTGCCGATTGGTTCTAAGTTAT ATAACCGTCGAGATGGTGGCCAAATCCTGTTGAAAAAACAGGTTATTGTGACCGGTAATGAGATTGTAGATGCTTCATCA GGGATAGAAGGTGATACAGGCTCCGCGATGGTTTCTGTGTCATTAGATGGTCCGGGTGGTAAAAAAATGAGCAAAACCAC ACGAGAAAATATTGGTAAACCAATGGCGGTTGTATTTATTGAAAATAGAACCGATATAAAAATGGTTAACGGCGAGCCGG TACGCTACAAAACAGTCGTCGAGGAAGTGATTAATGTGGCGACCATTCGTGGGCACTTTAGTAACCGTTTTCAAACAACA GGCTTAGATAATTCAGCTGAAGCACGTGATCTAGCTTTATTATTAAGAGCAGGTGCCTTGGCTGCGCCGATTGATATTGT TGAAGAGCGCACGGTTGGGCCAAGCCTAGGGCAAGATAATATTGATAAAGGCTTCAATTCTGTGATGATTGGTTTTGTTT TAGTCTTAATTTTTATGGCTATTTATTACAAGACATTCGGCCTTTTTGCCGATGTGGCCTTGGCCTTTAATCTGGTTTTT ATCGTTGCTGTATTGTCACTCTTGCAAGCCACGTTAACGCTGCCTGGAATTGCCGGCATTGTGCTAACAGTGGGGATGGC GGTAGATGCTAATGTGCTAATTTTTGAGCGCATTAAAGAGGAGATTAAAAATGGAAACTCACCTCAAGCTAGTATTGCGG CGGGCTACGATAAAGCCTTTTCTACCATTGCGGATGCAAATATCACGACATTGATTGCCGCGATTATCCTTTTCGGTTTT GGTACAGGGCCTATTAAAGGTTTCGCTATTACCTTAAGTATCGGCATTTTAACCTCTATGTTCACCGCTATTATTGGTAC GCGTGCATTAGTCAATGTGACTTTTGGTAGTCGTCAAATAGAAAAACTGAAGATTTAA Protein sequence : MALVVAIIYALPNLYGEDPSVQISPLRGAVINSSVLADVKDQLAQKGVALLKGELNDSQILLRFKHSNDQLKAVDIIKSV LGNNYVVALNLAPTTPQWLRSLNAAPMYLGLDLRGGVHFLLEVDMQAAEKQAVDRGAADFRQYLRENKLRYLSVMVNGHN VGIKFRNQQIHDEAISKLESQFRTWDFKPEVSESSTPTLTATMSDDELMDVRNYAVQQNIITLKNRVNELGVAEPVIQRQ GESRIVVELPGVQDTARAKEILGATATLEYHLVDTQNSVSSALAGRVPIGSKLYNRRDGGQILLKKQVIVTGNEIVDASS GIEGDTGSAMVSVSLDGPGGKKMSKTTRENIGKPMAVVFIENRTDIKMVNGEPVRYKTVVEEVINVATIRGHFSNRFQTT GLDNSAEARDLALLLRAGALAAPIDIVEERTVGPSLGQDNIDKGFNSVMIGFVLVLIFMAIYYKTFGLFADVALAFNLVF IVAVLSLLQATLTLPGIAGIVLTVGMAVDANVLIFERIKEEIKNGNSPQASIAAGYDKAFSTIADANITTLIAAIILFGF GTGPIKGFAITLSIGILTSMFTAIIGTRALVNVTFGSRQIEKLKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 9e-114 | 47 |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-113 | 47 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-113 | 47 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-113 | 47 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-113 | 47 |
