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Name : secD (HifGL_000056) Accession : YP_008543196.1 Strain : Haemophilus influenzae KR494 Genome accession: NC_022356 Putative virulence/resistance : Unknown Product : SecD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 58407 - 60257 bp Length : 1851 bp Strand : + Note : intracellular trafficking, secretion, and vesicular transport DNA sequence : ATGTTAAACCGTTATCCATTATGGAAGAATTTGATGGTGATTTTTATTGTAGCCATCGGGATTTTATATTCTCTTCCAAA TATTTATGGTGAAGATCCTGCGGTTCAAATTTCTGGTACGCGCGGTCAAGAAGCGAATACTAGCGTGCTTGGACAAGTTC AAGATGTGCTTAAAACCAATAATCTTCCAACCAAATCTGTCGTACTTGAGAACGGCTCAATTTTGGCTCGTTTCACTAAT ACCGATGATCAACTCCTCGCTAAAGATAAAATTGCTGAACGTCTTGGCAATAATTACACCACTGCATTAAATCTTGCTCC TGCGACTCCAGCTTGGTTAAGTATGTTTGGTGCTAACCCAATGAAATGGGGATTAGATTTACGCGGTGGGGTTCGTTTTT TGATGGAAGTGGATATGAATGCAGCACTTGTAAAACGCCAAGAGCAGTTACAAGACAGTTTGCGTGGCGAACTTCGTAAA GAAAAAATTCAATATACTGCTATTAAAAATACTGAGCATTTTGGTACGTTGATAACCTTAGCTAATGTAAACCAGCGTGC TAAAGCTGAGCGAATTATTCGCCAATTGCATCCAACATTAGACATTACTGAGCCTGATGCTGATAGTATTAATTTAGGGC TATCTACTGCAGCATTAAATGAAGCACGCGACTTAGCCATTGAGCAAAATTTAACGATTTTACGTAAACGTGTTGCTGAA TTAGGGGTTGTAGAAGCAGTAATTCAACGTCAAGGTGCGGAGCGTATTGTGATTGAATTACCAGGTGTTCAAGACACTGC ACGTGCAAAAGAAATTTTAGGGGCAACGGCAACACTTGAGTTTCGTATCGTAAATCAAAATGTTACAGCCGATGCTATTT CTCGTAATATGTTACCAGCTGATTCGGAAGTTAAATATGATCGCCAAGGTCATCCTGTTGCATTATTTAAACGTGCGGTA TTAGGTGGGGAGCATATTATTAATTCAAGCTCTGGTTTAGATCAGCATTCAAGCACGCCGCAAGTAAGTGTAACCTTGGA TAGCGAAGGTGGCGAGATTATGTCTCAGACCACTAAAAAATATTACAAAAAACCAATGGCAACGCTTTATGTTGAATATA AAGATAACGGTAAAAAAGATGAAAATGGCAAAACCATTTTAGAAAAGCATGAAGAAGTCATTAATGTTGCAACAATTCAA GGGCGTTTTGGTTCTAATTTCCAAATTACTGGTGTTGATAGTATTGCCGAAGCGCACAATCTTTCTACCTTGTTGAAATC TGGCGCATTAATTGCACCAATTCAAATTGTTGAAGAACGAACAATTGGCCCATCATTAGGTGCGCAAAATGTAGAACAAG GGATTAATGCGAGCCTTTGGGGATTAGTTGCGGTTATTGCTTTTATGTTGTTTTACTACAAAATGTTTGGTGTGATTGCA AGTTTTGCACTTGTTATTAATATCGTATTACTTATGGGATTAATGTCTATTTTACCCGGAGCGACGCTTTCAATGCCAGG TATTGCGGGTATCGTTTTAACTTTAGGTATGTCAGTAGATGCGAACGTATTAATTTTTGAACGTATTAAAGAAGAAATTC GTAATGGTCGTTCAATTCAGCAAGCCATTAATGAAGGTTATAACGGCGCATTTACTTCTATTTTTGACGCAAACTTAACC ACAATCTTAACTGCAATTATTCTATACGCGGTTGGAACAGGCCCAATTCAAGGTTTTGCAATTACGCTTTCACTTGGTGT TGCGATTTCTATGTTTACCGCGATTACTGGAACTCGCGCATTAGTTAATGCCCTTTACGGCGGCAAACAACTTAAAAAAT TATTAATTTAG Protein sequence : MLNRYPLWKNLMVIFIVAIGILYSLPNIYGEDPAVQISGTRGQEANTSVLGQVQDVLKTNNLPTKSVVLENGSILARFTN TDDQLLAKDKIAERLGNNYTTALNLAPATPAWLSMFGANPMKWGLDLRGGVRFLMEVDMNAALVKRQEQLQDSLRGELRK EKIQYTAIKNTEHFGTLITLANVNQRAKAERIIRQLHPTLDITEPDADSINLGLSTAALNEARDLAIEQNLTILRKRVAE LGVVEAVIQRQGAERIVIELPGVQDTARAKEILGATATLEFRIVNQNVTADAISRNMLPADSEVKYDRQGHPVALFKRAV LGGEHIINSSSGLDQHSSTPQVSVTLDSEGGEIMSQTTKKYYKKPMATLYVEYKDNGKKDENGKTILEKHEEVINVATIQ GRFGSNFQITGVDSIAEAHNLSTLLKSGALIAPIQIVEERTIGPSLGAQNVEQGINASLWGLVAVIAFMLFYYKMFGVIA SFALVINIVLLMGLMSILPGATLSMPGIAGIVLTLGMSVDANVLIFERIKEEIRNGRSIQQAINEGYNGAFTSIFDANLT TILTAIILYAVGTGPIQGFAITLSLGVAISMFTAITGTRALVNALYGGKQLKKLLI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 5e-117 | 45 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 44 |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-116 | 44 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 44 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 44 |
