|
Name : nrfE (HifGL_000563) Accession : YP_008543697.1 Strain : Haemophilus influenzae KR494 Genome accession: NC_022356 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein NrfE Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 566488 - 568395 bp Length : 1908 bp Strand : - Note : posttranslational modification, protein turnover, chaperones DNA sequence : ATGCTTCCAGAACTTGGCTTTTTCCTTCTTTTACTCGCAACAGCTAGCGCGTTTTTTCTTGCGTTAGTGCCTCAATTTGG GTTATTCAAAAAAAATTCGACTTTAATTAATGCTGCTTGGCCGCTTAGTTATATTTTTACCCTTGCGACGACGTTCTCAA TTGGTTTGCTTGCTTATTCTTTTGCGGTGGATGATTTCACCCTTGAATATGTAGCGGCACATTCTAATTCCCAATTACCT ACATTTTTTAAAGTGGCTGCCACTTGGGGCGGACATGAAGGTTCAATGTTGTTTTGGTTATTTTCATTGAGTTTATGGCT TGCTGCTTTTGCTTTTTTTAATCGAAAAAATGACCGCACTTTTTCCGCTCAATCTTTATCTTTATTGGGATTAATTTGCT TTGGTTTTGCGGTGTTTATTTTATTTTATTCCAATCCATTTGGACGCATTTTTCCTGCTCCCGCAGAAGGGCGCGATCTC AATCCAATGTTGCAAGATGTGGGATTAATTTTCCATCCGCCTTTATTATATGTTGGCTATGTGGGCTTTGCGGTAAATTT TGCAATGAGTTTGAGTGCGTTGATTTATAACCAATCTGCACGACAAATTGCACGCTCAATGCGTGGCTGGGTGTTGGTTT CTTGGTTGTTTTTAACCATTGGCATTGTGCTTGGTGCGTGGTGGGCTTATTACGAACTTGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTC TGGGATCCCGTAGAAAATGCATCTTTAATGCCTTGGTTGCTTGGTTTGGCGTTATTACACAGTTTAATGGCAACAGAAAA ACAAGGTGTATTTAGTTATTGGACAACGCTTTTTTCTTTGCTCGCTTTTGCCTTTAGCGTATTAGGCACGTTTATTGTTC GTTCTGGTGCACTCACTTCTGTGCACGCTTTTGCATTGGATAACACGCGCGGTTATGTATTGTTATTAATTTTCTTTGTT TTGACAGTGTTAGCCTTTGGTTTATTCGCTTTGCGTGCGGGCAGTTTGTCAGAAAGTGCGGTGAATTTTCAGTTCGTTTC TAAATCGGGTGGCATTTTATTGCTGAATATTTTGCTGACCATTGCCACTGTTTCTACCTTTTTAGGCACCTTTTACCCGA TGTTATTCCAAGCGATGAATTGGGGCTCAATTTCGGTGGGAAGTCCTTATTTTAATAGTATTTTCTTCCCAATCATTACG GTAATTTTAATCTTAATGGTAATTTCGCTTAGCATACGTAAAGTGCAATTTGATCGCGTATTATTGATACGTTACGTATG GTTGCTTATTCCGTCTTTGATTCTCGCCAGCTTGATGATTTGGCAACAGCTACGCCATAATTCTGCGTTGAATTTTCACG CTTTCGCTTTTGTGTTATTAACTCTTGCGATTTGGCTTTTGTTGGTCACTTTATGGCAAAATTGGCGACAAATTCGTTTG TCTCAATTTGGTATGATTTTAGCACACTGTGGCGTGGCGATTGTGACTATTGGCGCAATAATGAGCGGTTATTTTGGCAG TGAAATTGGTGTGCGTTTAGCACCGCAACAAAGTCAAACGCTGGGACAATATGAATTTCACTATCGCCAATTTTCTAATG AAATCGGACCAAACTTTACGGCAGAAATCGCCTTTTTTGACGTAACTGAAAATGGTAAACCTTATGCAGAAATTATCCCC GAACGCCGTTATTACGATGTTCGTACAATGACAATGAGTGAAGTGGGGCTTAATGGCGGTTTTTGGGGCGATTTATATAT TGTGATGGGAGATTCTCTCGGCAAAGGAGAATTTACTTTCCGCTTACATTATAAACCGCTGATTCGTTGGCTTTGGGCTG GCGGTATTTTAATGGCGTTTGGCGCACTTTTTAGCGTCTTCGGATTACGCAGAAAACAGGAAAAATAA Protein sequence : MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP TFFKVAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV LTVLAFGLFALRAGSLSESAVNFQFVSKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT VILILMVISLSIRKVQFDRVLLIRYVWLLIPSLILASLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAIWLLLVTLWQNWRQIRL SQFGMILAHCGVAIVTIGAIMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEIAFFDVTENGKPYAEIIP ERRYYDVRTMTMSEVGLNGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAFGALFSVFGLRRKQEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 6e-80 | 43 |
