Gene Information

Name : ECOK1_0239 (ECOK1_0239)
Accession : YP_006099486.1
Strain : Escherichia coli IHE3034
Genome accession: NC_017628
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 267523 - 268962 bp
Length : 1440 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGGTAACTATCATATCGGGGATGGTGAATGTAGATTTAGAGTCGTGTGTTCTTCACCAGATGTATGTGAAGTAGGAGG
TTACAAGGTTCCTTTTGACAGTTACCAGACTTTAGATAGTGAAAGACAGTACAGTTCAACGGTATGGGCGCGTGGATGCA
GAGCTTTAAATGTTGGTTCAGTGATTGCTGGAACTCAAAGTAATGCCGGTAAAGGTGTCATATCCGGTACATCTCAAGGA
ACGGGTGACTGTGTTATTTTAACGGGAAGTCCGACTGTAACAATAGAAGGGAAACCTGTTGCTTATCATGGTTCAGTTGT
TGGGATTAATAACCACAACTGCCTTGGTAAATTGTATACCAAAATAAAATCACCAATGATTTCTGTCATTGATAGAACTT
TTAATTATGAAAGGACTGCTGAAGTAATACACGATTTACTGCTTCTGAAGGATCTCCTCTCTGTTGGTAATATTTTTGAC
GGAGATATTTCACCTGAGGTTAAAAATGATTTATTTCAAATAAAAGATCCTGACCAATCATGGGGGGAGTTTTTTTCAAT
AAAGAATATCAGAGAATCTCTCAGGAATGGTATTGAAGGAGATAAATCTCAGATCAGAGAATGGTTTGGAGAGAACACAC
TTACTCAAATGGGGAATGGAGCAATCACCACTTTACATGGTGTGGCGGATTTAGCCTTAGTTACATTCGATGCTCTGTTA
GATACGGCAACGGCAACGGTTGCTTGCCCGATAGGCGAAGATGGGTTATGTGAACAGGCAAATATAAATTTAAATGAAAA
AGAACAGGCTTTATTTAATATTAGTAATTCATTGATAAATGGGCAAGCATGGGATGCACTTAAAAAAATGATAATGGATA
CAAATAATGGTGATCAGATTGCTCTGGAGCATTTTGCCAGCTTTTTATGGGGCTTTATGATACCCGCAAAAATACCAGAA
GAAAATATCTCTGGGAAAGTATTTGTAGAGCCAGTAGTTTTAGAAGGTGGTGCTGGTGGCAATTGGACAGTATTTGATGA
GGTTTTAGATTCAAATGTAATAAAGCAATTGACTTTAACAGGCTGTGGAGCGGCCTGTGGGGAAATGTTGCTTAGGGATA
GGTATATTTTTGTCACGCAAAATGTAATTGGAACAGAATTAACATCTATGACGTCGCTGGCAAACAAGCTTAATAAATTT
GATGTCGGCTGGGAAGGGAATGCAGTGAGCGAATCTAGTTTATATGCCCTCAGTAATACTGGTTCATGGGGAGCAATGAT
GTGGGATTCTGGAAGTAAAGTAGGGCATTGGGTACTTGTTAAGGGTGTTGATGATGCTGGGAATGTGATAATATATGATC
CATATCAAGGGAGTCGATATCTGATGACTGAACAGGAATTTAAGGAGGTATGGAATGGGCATAGTGTTTACAAACCATAA

Protein sequence :
MGNYHIGDGECRFRVVCSSPDVCEVGGYKVPFDSYQTLDSERQYSSTVWARGCRALNVGSVIAGTQSNAGKGVISGTSQG
TGDCVILTGSPTVTIEGKPVAYHGSVVGINNHNCLGKLYTKIKSPMISVIDRTFNYERTAEVIHDLLLLKDLLSVGNIFD
GDISPEVKNDLFQIKDPDQSWGEFFSIKNIRESLRNGIEGDKSQIREWFGENTLTQMGNGAITTLHGVADLALVTFDALL
DTATATVACPIGEDGLCEQANINLNEKEQALFNISNSLINGQAWDALKKMIMDTNNGDQIALEHFASFLWGFMIPAKIPE
ENISGKVFVEPVVLEGGAGGNWTVFDEVLDSNVIKQLTLTGCGAACGEMLLRDRYIFVTQNVIGTELTSMTSLANKLNKF
DVGWEGNAVSESSLYALSNTGSWGAMMWDSGSKVGHWVLVKGVDDAGNVIIYDPYQGSRYLMTEQEFKEVWNGHSVYKP

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_1753 YP_851431.1 hypothetical protein Not tested PAI II APEC-O1 Protein 0.0 99