PAI Gene Information


Name : efa1-lifA-tox
Accession : CAC81883.1
PAI name : LEE II
PAI accession : AJ277443
Strain : Escherichia coli 042
Virulence or Resistance: Virulence
Product : Efa1-LifA-Tox protein
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes :   7 hits    ( 7 protein-level )  
Publication :
    -Benkel,P., "Direct Submission", Submitted (19-APR-2000) Benkel P., Justus-Liebig-Universitaet Giessen, Institut fuer Medizinische Mikrobiologie, Frankfurter Strasse 107, Giessen, 35392, GERMANY.

    -Benkel,P. and Chakraborty,T., "Genetic organisation and sequence of the LEE II locus in Shiga toxin-producing Escherichia coli", Unpublished.


DNA sequence :
ATGAGACTGCCAGAGAAAGTTCTTTTTCCTCCTGTCACTAGTGGCCTGTCAGGGCAGGAAAAACAAAAAAAACCGAAGAG
CATTACCGGATTTCAGGAAAATTATCAACGCAATATCAGGCCAATCAAAACAGCATCAGAAGCCCGACTACGCTTCTTTG
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TAGGTGAAGAGTTCATTAATGAAAGAAAACTGAGTGATAAAGCTTATATTGGTGTCTACAAAACAACTGGCACAGGGAAA
TATGACTGGTTAAACCCTGAATCGATCGGCGTTAATGATGTCACGCCCGCAGATGAAAGTACCTGGTGTATAGGAAAAGG
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TAGATACTGATACGTTTTTCTCTCAGTGGTCAACCAAAACCAAGAAAGATCTGCAAAAAAAAATACAAGACCTTACTGTA
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GCTAGAGATGAATGATGATATAGCCAAAAGGTCATTGTTTTCATTGCAAGTTCAAATAGCCGAAAAAATTCGGAGGATGA
CCATTCCTGTAGACAATATAATTAACATCTATCCTGATCTACATAAAAAAAATGACAATGATCTGAGTATGTCCATAAAA
GGCTTTCTTGCGAGTAATCCACATACAAAAATAAATATTCTTTATAGCAATAAGACTGAGCATAATATTTTTATAAAGGA
TTTATTCTCCTTCGCAGTTATGGAAAATGAGTTAAGAGACATTATCAATAACATGAGCAAGGATAAGACTCCTGAAAACT
GGGAAGGGAGGGTAATGTTACAAAGATATCTCGAATTAAAAATGAAAGATCATCTTAGTTTGCAATCTTCTCAGGAAGCA
AATGAGTTTCTTGAAATATCTACTTTTATTTATGAGAATGATTTCTTGAGAGAAAAGATTGAAGCAGTAAAAAACAAAAT
GAATTCTCACGAACTTTATTTTGAAAAAATAAAAAAAGAACAAAACACATGGCAGGATCTGTCCACAAAAGAACAAAAAT
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TCATAATATAGATAAAGTTATATTTAAAGGGCAAACACTGGATCGTCTTTATCATGAAGGATATGTATTTTCTGATATCA
ATACCTTGTCTCGTTATACACTACACGGACTAGGAATAACTGGTGTACATACTGAAGAAAACCTGCTACCAGCTCCTTCA
TCGTCCTTAATTAATATATTGAAAGAACATTATAATGAAGATGAAATTAGTGCGAAATTACCACTAGCATATGATTACAT
TTTAAATAAAAAAGAATCAAGCTCTATTCCTGTTGAAATTTTGAACAAACTTTCAGAGTTACCACCACATGAACTACTCA
CACCTGTTCTTGGCCAGAGTGTTAATCCTCTGGGCATGGGCTACTCATCCGATAATGGAAAAATCACAGAGCAAGTAATA
GTCAGTGGAGCTGATGGATTTGATAATCCCATATCTGGACTTATATATACCTATCTTGAAGATCTATATAACATCCATGT
AAGGATGCGAGAAGGTACACTAAATTCACAGAATCTTCGTCAGCTTCTGGAAAACTCTGTTTCTTCATGCTTTTTGACTG
AGCAAAGTATTAATAAATTACTTAGTGAGGCAGAAAAAAGGCCTTATCAGTCTTTAACAGAAATACATCAGCATCTCACA
GGATTACCAACTATTGCCGATGCAACCCTTTCATTACTTTCTGTTGGATTACCTGGTACGGGAAAACTATTGCGCAGGGA
GCAGGACTATGGGCGTCCACCAGTTACAGCAATTCAGGATTCCACATTTGTACTCCCTTATAATTTCAAAGGTATTGGTT
TTAACGATAACATTATATCCTCTGCACCTGTAGTCTCCTCATTACATTTTATCGCTGAACATGCGAAATATACTTTGTTG
TCATGGCCTGAGTTTTATCGTCATCATGCACAGCGATGGTTCGAAATGGCTAAAGGATATGGAAGCCAGAATATTGATTT
TCACCCTCAGTCTCTATTGGTAACCCAAGAAGGACGCTGTATGGGATTAGCCTTACTTTATTTACAGACTGAAGATACTG
CTCATTATAGCATTCTCCAGGAAAACCTAATGACTGTGAGTGCACTTCATCAGACCAGTAATCGCGATAAGTTGCCACTG
TCCAAAGATGATAATTCCTTAATGACAAGAACTTATAGTCTGATTGAAATGCTACAGTATCAGGGAAACAAATATATTAC
CAACGAATCGCTACTACATAAGACCGCATGGAACCAAGAAAGAATAACTTTATTATTCAATGAAAAAGGAGTTAAGCGAG
CCCTGATAAGCACGCCTAATCATACTCTGGTTCTGCAACAACTGGAGGATATTTACCGGCTCACTGATCCAAATTTTGGG
CATGCAGATTTCCTTTCACCTATAGATGCTCTGAAGTTTATTGAGGCTATGATACAATTAACTCCAACACTTCAGGAATA
TTATGGCCTATTAAACAAAGACATTAATAAACATATACAAGTACATTATGCCGAATCAGATATGGTCTGGAATAAGCTTC
TGCCAGAAAATGATGCTGGACTGAGCACCAGAATTCAGCACACCACCACCGACCGTCTGGCGAATCTGGCTGAACCAGTC
GCTGTTGCAGGTATCTCCCTGCCAGTAAAAACACTTTATGATATCGGAGCCACCCTTGACGGTCGGCGCATCACCTCTCC
TCCAACATCGGAGCAAATCCCTTCTCTGCGTCTCAACGGTGATGTTCTGAATGATTATCTGTCCCGCACAGTTCTGACTC
CAGAACAGGCTGATAACATAAGAAAAATACTGCACACTCAGGGAATACGCAGCGGTACCCGTCCCATAGATCCGGAGATG
ATTCGTGGGACGCAGGATGACCTAGTTTCGTCACAGACTCGTCTGCAAAGGCAAGCAACACGGGTTAAACAGCAACTCGC
CGGCGTACTTGATACTCTGCAACAGCACTTCCAGAACATTCCACGTTCATCCGGTCGTCATCTTTCTGTAGAGAATATTG
AGCTGGCTGATATCGGAAGTGGGCGTTTCAACCTTCAAATTCGAGATGGAGAAACATTGCATACCACTTCTGTGGAAGTA
CCGGAAGTTGTGTCCCGTTTTCAGAAACTTTCTACCATGCTTTCAGCCCTGCCTGCCAGTGGAATCATGGATTTCGACCT
CGGCATGAGTGTGGTCGGAGTCGTCCAGTATGCCCGCCTGCTACAGCAGGGGCACGAAGACAGTACCCTAGCCAAGATAA
ATCTAGCTATGGATATCAAGCAACTTTCCGAAGCAACTCTCGGCAGCATGATTCAGATTGCCGGGAATAAGTTTCTCAAT
ACAGAAGGAATCCAGGGGTTCAGACTGGAAAGCGCCGTCGCTGAAGGTATGCGCTCAGTAGCAACCCGTACCGGAGGCAC
AATGGGGAAAGCCCTTTCTGCCAGTGCCCGTGTTCTTGAACTGCCTGTACTGGAAACAGTTCTGGGGACATGGAACCTGT
ACAACAGCGTCATTCAGCTCCAGCAAGCTACATCTTATTCTGAGACAATGGCTGCCCGGGTACAGATTGCGTTTGATTCC
ATTTCTCTGGGATTAACTGCCGCTTCGGTAGCTTTCCCGCCACTAATTATTGCCACTGGCCCCATTGCGGCTATTGGTAT
GGGAGCTTCCAGTATTGCACGTAATGTGGCACGGAAAGAAGAACGGCATACACAATGGCTGGAATATAAAAAATTCCTGA
CTGATGGCAGTAAACACATTGTTGTGGCCTCTCCGGAAAGAGGTCTGCTGGATTTCTCCGGAAACAAAGTTTTTGGAAAA
ATGGTGCTGGATCTGCGTCAGTCTCCTCCTCTCTTGCATGGAGAAAGCTCTTTTAACGCTGACCGCAAAATCGGTCATCG
TCCGGATCTGGGGGACTGGCAAATTCGTGAGAAGGTGGGGTATGCCAACAGTATCAGTCCCTACTCTTCCCTGGCGCACG
GTTACGCCAACAGTAAATGGCCACAAACAATACCGAAAATTCCCTCGGGAGAATATGACACCATAATTCTGGGCTACGGT
CACCAGTATCAGGCCAATACGGAAATAGAATATCTGTCTAACTGGATTGTATGGCGGGAAGCCGTACCAGACAGTACTTC
CCGCCACAAACGTCCTCCTCTGGAGGTTCTTAATAGTCAGTGTACTGTGATAGCTGGAGAGCGTAAAACCACAGTACTTC
CCCTGAGAGTGCTCAGCGATCTGACACCGGAATGCACAGAACAGGCTATATCGTTAAAAGATTATAAATTCATACTGAGA
GGGGGAAGCGGTGGGCTGGCTGTTCAGGTCGGTGGCGCGGGATATTATGATATTGATGCAAATCCTGTGGCAAAAGAAAA
TACGCTCTCTTTTCGCGGGCTACCGGAAGAGTTTCCGCTCGCCTTTGATTTATCAAAACAAACACAGTCGGTCATGCTGA
AAACAACGGACGGTGAGGTGCCGGTAATGACCATCACCCAGAAGGGAATAAACACCCTGGTCGGTACAACGGCCGGCGAA
AACTGGCTAACGGGTAACGATAAGGACAATACCTTCCATACGAGTTCTGGTGGCGGTACTGTCATCTCTGGTGGAGGGAA
TAACCGCTATATTATCCCCCGCGATTTAAAAACTCCGCTGACACTGACGCTGTCTAATAGCTCGGTCTCTCACGAGATCC
TTCTGCCAGAAACAACTCTGACAGAATTAAAACCTGTCGCCTTTGAGCTGAGTCTGATTTACTGGGCCGGGAACAATATA
AAGGTTCAGCTGGAGGATGAGACACAACTGAACCGTTTTGCCGGAAACTTCAGGGGGCATACCAGTGATGGCATTACTCT
GGAGGCGGTTTCCCAGGAAAATGGTATTCAACTGGGGGTTTCATCATGTGATGTTCAACGCTGGCAGGCTGTTTATCCGG
AAGAAAACAACAGACCAGACGCCATACTGGACAGGCTGCATGATATGGGATGGAGCCTGGCCCCCGAGGTCAGGTTCCGG
GGAGGAGAAACATCTGCCAGCTATGACCCCCTGAACCGTCAGCTCGTTTACCGGCTTCAGGAGCGTTACTCGGAATTCAG
GCTGACCGGCAGTCGCCATTACACCACGGCTGTAACCGGAACCCCCGGAAGCCGGTACATTATTACGGGGCCGGATACAG
CACAGATATCACCGGCACAAATCATACTGGCCGGTGATAATGACCATCCGGAAACGATTGATTTGCTTGAGGCCAGTCCT
GTTCTGGTTGAAGGGAAAAAAGACAAAAACAGCGTGATATTAACGATTGCTACGATTCAGTATTCCCTTCAACTGACAAT
ATCCGGGATCGACGAATCGCTGCCCGGGACAACCCGTGTGGCAATTCAGCCTCAGGATACCCGTTTACTGGGTGACGTAC
TCCGGATCTTACCAGATAATGGTAACTGGGTGGGGATTTTCCGGAGTGGTCATACACCAACGGTAAACCGGCTGGAAAAT
TTGATGGCACTGAATCAGGTAATGACGTTCCTGCCCCGGGTATCCGGAAGTGCAGAGCAGGTATTATGCCTCGAAAACCT
AGGTGGCGTAAGGAAAAAAGTGGAGGGGGAGTTACTGTCAGGGAAGCTGAAAGGTGCGTGGAAAGCCGAAGGTGAACCTA
CTGTTCCGGTAAATATCTCAGATCTAAGTATCCCACCCTATTCACGTCTGTATCTGATTTTTGAAGGGAAAAATAATGTG
TTGCTACGCAGTAAAGTACATGCAGCTCCGTTGAAAATAACATCCGCAGGAGAGATGCAGTTATCTGAAAGGCAGTGGCA
ACAGCAGGAACATATTATTGTCAAGCCCGACAACGAAGCCCCCTCATTAATACTCAGTGAATTTCGTCGTTTCACTATTT
CATCGGATAAAAAATTTTCTTTAAAACTGATGTGCCATCAGGGGATGGTCCGCATCGACCGCAGATCATTATCGGTCAGA
TTGTTCTATCTGCGTGAACAGCCAGGTATCGGCAGTTTACGTCTGACGTTCAGAGATTTTTTCACAGAAGTGATGGATAC
AACGGACAGGGAAATTCTGGAGAAAGAGCTGAGACCAATTCTGATAGGAGATACACACCGCTTTATCAACGCTGCATACA
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GAAGAAACATCAAAAATATTGTATCAATATCAAGGTGCCATGAAAAAAAAAACAGATGGACCATCTGTGGTAGAAGATGC
CATTATGACCACTACTGTCACAACAGATTCAGGTGAACCATTCCCTACCTTCCACCCGTGGTATACAGATGATTTATCAG
GGCGTTATAAGAGCGTACCTATGGCAAGAAAAGCAGATACTTTGTATCACCTGACACCAAAAGGTGATCTACAGATAATA
TATCAGGTAGCTACAAAAATGGTGAATCAGGCGATGATTGTATCCCTGCCAAACTACCGACACGAGTGGGAAAAATATAA
TTTAAGCATCTTATCCGAAATCCCTCAGAACAATAATACTGTTGTACATTCAATCCTCAGGGTTAATGGCCCCACAATGC
AGGTGCGCACAATTGACTACAGAGGAACGGATGAAAACAATCCCATAGTATCTTTTTCAGATACAACCTTCATCAATGGT
GAACAGATGTTGAGTTATGACTCGCATTCATCAGGGCGAGTCTATTCCAGAGAAGAATATATGATGTGGGAATTGCAGCA
ACGGGTATCAGAAGCTTCCAGTGCCCGGACACAGGATTACTGGCTGATGGATGCAGCGGTAAGAAACGGAGAATGGAAGA
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GGCACAATACTCCAGACTCCAGAAGACAGAAATACGGATGTATACCTGACTACCATACAGAACAATGTATTTAGTCGTCA
GGGGGGCGGCTACCAAGTGTATTATCGGATTGATGGAATGGCTGGTGCGGATATAGCGGATAATGCACCAGGGGAAACCC
GCTGCACCCTCAGGCCCGGAACATGTTTTGAAGTGACAAGTGTGGATGAAAGGCATTATGAGTGGAATATCATTTATGTC
ACGCTGAAAACCTGTGGCTGGAGCCGAAATGGCCAAAGCAAAACGCCGAATGGTGACAACCTTTTTAACTAA

Protein sequence :
MRLPEKVLFPPVTSGLSGQEKQKKPKSITGFQENYQRNIRPIKTASEARLRFFDKMVSKENSLEDVVSLGEMIQKEIYGH
EQRTFSPVHHTGNWKSSLLHNALLGLANVYNGLRETEYPNTFNRDGIKSTNSFRDNLLTKTRTPRDNFEEGIKHPEHATI
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TEGIQGFRLESAVAEGMRSVATRTGGTMGKALSASARVLELPVLETVLGTWNLYNSVIQLQQATSYSETMAARVQIAFDS
ISLGLTAASVAFPPLIIATGPIAAIGMGASSIARNVARKEERHTQWLEYKKFLTDGSKHIVVASPERGLLDFSGNKVFGK
MVLDLRQSPPLLHGESSFNADRKIGHRPDLGDWQIREKVGYANSISPYSSLAHGYANSKWPQTIPKIPSGEYDTIILGYG
HQYQANTEIEYLSNWIVWREAVPDSTSRHKRPPLEVLNSQCTVIAGERKTTVLPLRVLSDLTPECTEQAISLKDYKFILR
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