Name : hlyB
Accession : CAD33760.1
PAI name : PAI I 536
PAI accession : AJ488511
Strain : Escherichia coli 042
Virulence or Resistance: Virulence
Product : hemolysin B
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes : 253 hits ( 253 protein-level )
Publication :
-Dobrindt,U., "Direct Submission", Submitted (27-MAY-2002) Dobrindt U., Inst. f. Molekulare Infektionsbiologie, Universitaet Wuerzburg, Roentgenring 11, 97070 Wuerzburg, GERMANY.
-Dobrindt,U., Blum-Oehler,G., Nagy,G., Schneider,G., Johann,A., Gottschalk,G. and Hacker,J., "Genetic structure and distribution of four pathogenicity islands (PAI I(536) to PAI IV(536)) of uropathogenic Escherichia coli strain 536", Infect. Immun. 70 (11), 6365-6372 (2002) PUBMED 12379716.
| DNA sequence : | |
ATGGATTCTTGTCATAAAATTGATTATGGGTTATACGCCCTGGAGATTTTAGCCCAATACCATAACGTCTCTGTTAACCC
GGAAGAAATTAAACATAGATTTGACACAGACGGGACTGGTCTGGGATTAACGTCATGGTTGCTTGCTGCGAAATCTTTAG
AACTAAAGGTAAAACAGGTAAAAAAAACAATTGACCGATTAAACTTTATTTCTCTGCCCGCATTAGTCTGGAGAGAGGAT
GGACGTCATTTTATTCTGACTAAAGTCAGTAAAGAAGCAAACAGATATCTTATTTTTGATCTGGAGCAGCGAAATCCCCG
TGTTCTCGAACAGTCTGAGTTTGAGGCGTTATATCAGGGGCATATTATTCTTATTGCTTCCCGTTCTTCTGTTACCGGGA
AACTGGCAAAATTTGACTTTACCTGGTTTATCCCTGCCATTATAAAATACAGAAAAATATTTATTGAAACCCTTGTTGTA
TCTGTTTTTTTACAATTATTTGCATTAATAACCCCCCTTTTTTTTCAGGTGGTTATGGACAAAGTATTAGTACACAGGGG
GTTTTCAACCCTTAATGTTATTACTGTCGCATTATCTGTTGTGGTGGTGTTTGAGATTATACTCAGCGGTTTAAGAACTT
ACATTTTTGCACATAGCACAAGTCGGATTGATGTTGAGTTGGGTGCCAAACTCTTCCGGCATTTACTGGCGCTACCGATC
TCTTATTTTGAGAGTCGTCGTGTTGGTGATACTGTTGCCAGGGTAAGAGAATTAGACCAGATCCGTAATTTTCTGACAGG
ACAGGCATTAACATCTGTTCTGGACTTATTATTTTCATTCATATTTTTTGCGGTAATGTGGTATTACAGCCCAAAGCTTA
CTCTGGTGATCTTATTTTCGCTGCCCTGCTATGCTGCATGGTCTGTTTTTATTAGCCCCATTTTGCGACGTCGCCTTGAT
GATAAGTTTTCACGGAATGCGGATAATCAATCTTTCCTGGTGGAATCAGTCACGGCGATTAACACTATAAAAGCTATGGC
AGTCTCACCTCAGATGACGAACATATGGGACAAACAATTGGCAGGATATGTTGCTGCAGGCTTTAAAGTGACAGTATTAG
CCACCATTGGTCAACAAGGAATACAGTTAATACAAAAGACTGTTATGATCATCAACCTGTGGTTGGGAGCACACCTGGTT
ATTTCCGGGGATTTAAGTATTGGTCAGTTAATTGCTTTTAATATGCTTGCAGGTCAGATTGTTGCACCGGTTATTCGCCT
TGCACAAATCTGGCAGGATTTCCAGCAGGTTGGTATATCAGTTACCCGCCTTGGTGATGTGCTTAACTCTCCAACTGAAA
GTTATCATGGGAAACTGGCATTACCGGAAATTAATGGTGATATCACTTTTCGTAATATCCGGTTTCGCTATAAGCCTGAC
TCTCCGGTTATTTTAGATAATATCAATCTCAGTATTAAGCAGGGGGAGGTTATTGGTATTGTCGGACGTTCTGGTTCAGG
AAAAAGCACATTAACTAAATTAATTCAACGTTTTTATATTCCTGAAAATGGCCAGGTATTAATTGATGGACATGATCTTG
CGTTGGCCGATCCTAACTGGTTACGTCGTCAGGTGGGGGTTGTGTTGCAGGACAATGTGCTGCTTAATCGCAGTATTATT
GATAATATTTCACTGGCTAATCCTGGTATGTCCGTCGAAAAAGTTATTTATGCAGCGAAATTAGCAGGTGCTCATGATTT
TATTTCTGAATTGCGTGAGGGGTATAACACCATTGTCGGGGAACAGGGGGCAGGATTATCCGGAGGTCAACGTCAACGCA
TCGCAATTGCAAGGGCGCTGGTGAACAACCCTAAAATACTCATTTTTGATGAAGCAACCAGTGCTCTGGATTATGAGTCG
GAGCATGTCATCATGCGCAATATGCACAAAATATGTAAGGGCAGAACGGTTATAATCATTGCTCATCGTCTGTCTACAGT
AAAAAATGCAGACCGCATTATTGTCATGGAAAAAGGGAAAATTGTTGAACAGGGTAAACATAAGGAGCTGCTTTCTGAAC
CAGAAAGTTTATACAGTTACTTATATCAGTTACAGTCAGACTAA
|
| Protein sequence : | |
MDSCHKIDYGLYALEILAQYHNVSVNPEEIKHRFDTDGTGLGLTSWLLAAKSLELKVKQVKKTIDRLNFISLPALVWRED
GRHFILTKVSKEANRYLIFDLEQRNPRVLEQSEFEALYQGHIILIASRSSVTGKLAKFDFTWFIPAIIKYRKIFIETLVV
SVFLQLFALITPLFFQVVMDKVLVHRGFSTLNVITVALSVVVVFEIILSGLRTYIFAHSTSRIDVELGAKLFRHLLALPI
SYFESRRVGDTVARVRELDQIRNFLTGQALTSVLDLLFSFIFFAVMWYYSPKLTLVILFSLPCYAAWSVFISPILRRRLD
DKFSRNADNQSFLVESVTAINTIKAMAVSPQMTNIWDKQLAGYVAAGFKVTVLATIGQQGIQLIQKTVMIINLWLGAHLV
ISGDLSIGQLIAFNMLAGQIVAPVIRLAQIWQDFQQVGISVTRLGDVLNSPTESYHGKLALPEINGDITFRNIRFRYKPD
SPVILDNINLSIKQGEVIGIVGRSGSGKSTLTKLIQRFYIPENGQVLIDGHDLALADPNWLRRQVGVVLQDNVLLNRSII
DNISLANPGMSVEKVIYAAKLAGAHDFISELREGYNTIVGEQGAGLSGGQRQRIAIARALVNNPKILIFDEATSALDYES
EHVIMRNMHKICKGRTVIIIAHRLSTVKNADRIIVMEKGKIVEQGKHKELLSEPESLYSYLYQLQSD
|
|
