Name : siiE
Accession : CAE11797.1
PAI name : SPI-4
PAI accession : AJ576316
Strain : Salmonella enterica RSK2980
Virulence or Resistance: Virulence
Product : large repetitive protein
Function : -
Note : Salmonella typhimurium LT2 gene STM4261
Homologs in the searched genomes : 36 hits ( 35 protein-level, 1 DNA-level )
Publication :
-Morgan,E., "Direct Submission", Submitted (11-JUL-2003) Morgan E., Division of Microbiology, Institute for Animal Health, High Street, Compton, Nr Newbury, Berkshire, RG20 7NN, UNITED KINGDOM.
-Morgan,E., Campbell,J.D., Rowe,S.C., Bispham,J., Stevens,M.P., Bowen,A.J., Barrow,P.A., Maskell,D.J. and Wallis,T.S., "Identification of host-specific colonization factors of Salmonella enterica serovar Typhimurium", Mol. Microbiol. 54 (4), 994-1010 (2004) PUBMED 15522082.
| DNA sequence : |  |
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CGCAAAAGTTTCTCTTTCCGGGCCAGACATGAACATTACCACGCCGCGTGGTTCAGTGATCATTGTCAATGGCGCTCTTT
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AGGTGCCACTGGTTCAGACCGGCGGACAGTGGCGCTTTGCGCCGACCAGCGACTGGGCGGACGGCGACTATATCCTGACG
GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCATATCGCCATTGA
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TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
AGCTGACGCAGACTAACGGGCAGTGGCGTTTTGTACCCGGCAGCGCGTGGACTGATGGCGACTATACGCTGACGGTAACG
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CGCTGACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
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GACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTAGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
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GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CAAAACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAACACGGACGACA
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GTCACGGTTGAGGTGCAACATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCGGGGAACGTAAAATACTCAG
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AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
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CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGACGCAGGGTATCGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
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GATGGCGTAAACTGGACGCCCATCAGTAAAAATGCGGCCGGGCAGTGGGAATTTACTGCAGGTAGCGCATTGCCTGATGG
TCATTATACTCTCCATGTCCAGGCGACGGATCGGGCAGGGAATACGGCAAATTCCACGCTGGGCTTCACCGTGGATACGC
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GGCAGGTAATAAATGGCTGTTTACCCCTGATACACCGTTAGTGGATGGAACTTACAAAATAGAAATAGTGGCTGAAGATA
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AGGTTCCCGTTGCGTTAAACGATGGCGTATATGAAGCCGTTGTTGTCTTCAGAGATATTGCCGGAAATACTTCTGAAACT
AAGCTGCCCTTTACCATTGATACCACGACAAGCGTCAGTGTCAGAATGGAGCCAGCGTCTGATACCGGAAATTCCAATAG
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ACGATAAGTCAGGTCGGGAGGTTTTAAAACAAACGATTACGGTTGGCGCTGATGGCAACTGGAGTGTGACGCCGAATATA
CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GTCCTGAGTTCAAAGGGTTTGCCGAAGCGTTCTCGACGATTATGATTCAGTGGGATGGGAAAGTGGTCGGCTCGGCAAAC
GCCAATGCGAATGGCGAATGGAGTTGGACGCCGCCATCAGTATTAGCGCCAGGCTCCTATGTTGTGAGCATTGTTGCCAA
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AGCTCAGCGAGGAGAGCGATAGTGGCGCCTTAGGAGACTTTACCACGAATAATAAAACGCCGACCCTGATTGGGAGCACG
TTACCTAATACGATTGTGAGTATTTATGTGGATGGCGTGAAGGTCGGCGAGGCGACAGCGGATACAGCGGGTCGATATAC
TTTCCAGTTATCGGAAATGAAAGATGGCCATTATGTCGTCCAGGTGGGTATCGTCAACCCTCGCGATAATAGCGAACTGC
GTTCTACCGCCGTTGATGTCACTATCGATACCGAGGTTGCTGAACTGGTATGGAATATATCTGGAATGCATGAGGGCGGA
TATATCAATACGGTGACGCCGGAGATTGGCGGCACCAGTGAGCCAAACAGCAAAATCACTATCTTTGTGAATGGCGTTGA
AAAAGCGATTGCTTATACGACAGGCGCAGGACACTGGGGCGTAGTATTACCCGCTTTGGGTAATGACGGTAATTATGAAT
TAACGTTTAAAGTTGAAGACGTTGCCGGTAATATCAGAGAGTTTGGTCCGCAGAATGTAATACTGGATACAGTAATTTCG
CCGTTAACCGTGGTATTACGCGAAGCTGATGACAGTGGCAAAGTTGGCGACTGGATCACCAATAAATCTCATGTCACCAT
CGATGGTACTGCCGAAGCCGGAAGTACTTTAACCATCAGGAATCCGCAGGGAGTGGTTATTGCTACCCTGGTGGTAGGCA
ATGATGGTCGATGGAGCGCAGAATTAGATCTGCGTGAAGGTAGTAATGCCTTTGTCGTGGTATCGGAAGATAAAGCGGGC
AACAGTCAACAAAAAGAGATTCTGATAGAACATGATACGCAGATTGAAATCAGCGATATTTCATTAAGTCGGGATACTAA
TAGCGGTGATAAATATGATCTGATTACCAATAATAAGTCTCCGGTACTGGTTGCCATGACCGATCCCGGCGCGACGGTAC
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GACAATCGATTCTCAAATTGCTGTCTTTGATATTGATGAAGATTCATTACCGGCCCTCTCTAATAACCGAGCGTTGTCAG
TCTCAGGTGTCGGGGAGGCTGGTTCTCAGGTCAGCATCTTTGTCGATGGTAAATTAGTCAACGTTGTTATGGTTGAGGCT
GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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ACGCCTGTCGCCATTGATTCTATCGGTGGACAAACGTTAGCAGAGATGACCGGTAGTGATGGCAAAATATATATAACGGA
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CGGGTGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCTGGCGTCACGCTGGCAACTGCTGTTGTGGCGGCAACAGGACGA
TGGGAATTATCAACAGACAAGCTTCCAGAAGGGACTTACGATATTAGTTTGGTCATTGAAGATAGCGCCGGAAATCGTTG
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TGGTAACCGGAGTGATGATGTCCCTCTCGATATCATGAAAGAGGTTCCCGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGGTGGGCGATAATATTACGCGAGATAAGCAACCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
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AGCTGATGGTTCCTATACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACTGTCA
CGATCGACAGCACGCTGACGGTGCCGGAGATTGCGTTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGCTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAA
TGGCGTGACAGACATCTATCAGGCGACGCAAGGCGCGGATGGCTGGACCTTCACGCCGCCAGCCGCCTGGAATGACGGTA
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ACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTC
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CCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATA
TCAGTACCTGAGAATATTGTTAATGTCAGTATTATGTTTGAAGGAGAAGAGTTTACTCTGCCGATAACTAACCAGAAAGC
AATATTCGAAGTTCCGCTATCTTTGGAAGATGGTGAATATACTATGGACGTGAAATTCATTGATAAAGACAATGATTTCC
TGATTAAGGAGAAAACATTCTCAGTCGATCACTCCTCGGCGGATATTGTGAACGCAATGAATGTAAGAGGAAAGACCGAG
GATGATATTAATGATTCCCCTTCCACGAGTTCTGTAGGGCACAACAATAACGGCGCTATTGATGTTTTCGCCGTTAATGA
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|
| Protein sequence : | |
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SEGENSIKVVAVDKAGNKNETTDSIITDTIAPEKPTIELDDSSDSGIKNDNITNSTLPTFIGVAEPGSTVSIYLGLKHLG
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