Name : unnamed Accession : BAH66434.1 REI name : Type-II.5 SCCmec REI accession : AB435014 Strain : Staphylococcus aureus 04-02981 Resistance or Virulence: Not determined Product : hypothetical membrane protein Function : - Note : ORF No. KC08 Homologs in the searched genomes : 17 hits ( 17 protein-level ) Publication :
-Han,X., Ito,T., Takeuchi,F., Ma,X.X., Takasu,M., Uehara,Y., Oliveira,D.C., de Lencastre,H. and Hiramatsu,K., "Identification of a novel variant of staphylococcal cassette chromosome mec, type II.5, and Its truncated form by insertion of putative conjugative transposon Tn6012", Antimicrob. Agents Chemother. 53 (6), 2616-2619 (2009) PUBMED 19364875. DNA sequence : ATGAATTTAAAAGCACCGTATGCAGGTTTAAGAGATAATTTGTTATTAACGAAAACTGGCGAAGTTTGGGCGTATTATCG TGTTCGTTCTGAGTCTATTTCAACAGCAAATTATGATGCAAAAGAAGAATCAAAAAAGCGTATGCGTTATTTTTTAGAGT CGATTAAAGGTTATCAAGATTTTCATTTTGAAATGTATGACCATGATTTAGATTTGCGAAATAAATTTAAAGAAATTAGT AAAGATTTTGATGATGAAGCTTTTAATGTAGCTGAATATTATTCAAAAGAAACTATTGACGTATTAGAACAAGAATTACA AATGATTACGCATAATTCTTTTGTTATGGGTGTTAAAATACGTGAATTAGCTGACGATGCAGTTACACTTAAAGAGATTT TAAAAAGTACATTATCAGATACGGCTGAGCGTATTGTTTCGAATTTTGGTTTTGATGTTAATTTAGACGATAAAATTTTA GATAAGTATAAAACATTTGAACGAGATTTGGCTGATAGTTTTCTAGGTATTGGAGGCGAACGTTTAACTGAGAATGAGCT GGCTTATATTATTCGGAAGCCATTTATATCAAATGCAACACATGACGTACAGGAAGAATCTTCAAGACGAGCTATTACAG ATATTTATAATGCAGTAATTGACCCTACTCGCTTGAGTGTTTTAGAAGTTGAAAATGATAACGAGAAATTTTATACAACA ACAGTTGTTGTTGATGATTTTCCGTTAGATATGGAATATACACATTTATTTGAGAAAGCTCAAAATATGCCTTTTCCGGT TGAATGTCATGTAAAAGCAAAAATTATTAATAATGAAAAAGTTAAGAAAAAATTTGACCGTGCGAAAATAAATCATAAAC AACAAGCAAAAGAAAAGCAAGATACTGGCGATAGTGCTTCGGAAGATGTTCAAGATAATTTGTTTGTATTGAATCAAATG GAACGAGAAGTGACTGGCTCAGGTGTATTTATTGAGTGGGTATTTATGTTTGTAATTAAAAGTGATGATTATAGAGACTG TAAACGTAAAGCAAAGCGTTTGATGAAACGATTAAAGGAAACTCAAATATATGCAGTTAATCCATTAGCTGACCAGTTAC AATTGTTTTATCAGTGTTTACATGGTAATGATTTATTTATTAATAAGTATTGGTTACAAAGAACTACGGCAACAGGTATA GCAGAAAATTTATTTGGTGTGTCTCAAAGTTTGGGAACAAAAACAGGTTTTTATATAGGGCGTATTGATAAATTTATTCG TTCTGTTTCACGTGAGGAAGCTGTTGCAAGTTCAAGGGATATAATTTTGTTTAGTTTATTGTTGGCCGCAAAAGGTATTA AGGGGGCTGTCAGTGATAGTCCGCATGTTTTAATTACTGGTCAAACTGGTAAAGGTAAATCATTTTTAGCAAAATTATTA TGGATTTATACATCATTTTTTAAAGGTCAAATGTTGTACTGGGATCCAAAATCTGAGTTTGCAGAATGGTTTGACAGAGT AACAGAAAGTAAGGAAATGCAAGAAAAGTATCCCCTATTTATTAATCATTTAAAAACATTTAAATATGTAACATTGAATT ATGAAGATTCAACCAATTATGGTTGTCTAGACCCTATTGTATTTTTAGATGGTATTGAAGCTAATGAGATGTTGAAATCA GTGTTTGATGAAATTAAATCTTTTGAAAATTATCATCATATTGAAACAGCAATTTATCAAGCTATTTCTGATACGGTTGA AGAACGTGAAAATGGTAAAAAAGTTGGTTCATTAAATGTAATTGAAAAATTACAGAATAATGAAGATGAGCATGTAAAAA ATGCAGGCGATTTATTATTTGAAAAAACGCAAAACAATATTTTAAAACTTGTTTTTAGTGATGGTACGAATCCAGCTTTA AATATTCAAGAAAAAGCAACTATTTTACAGGTTAAAGGTTTAGATATGCCTAAAGCAGATGATGATACATCAAGTTATTC AACAAGTGAGAAAAATGGGATTACATTAATGTTATTAATTGGTAAGTTTTTAGAGAAATTCGGTTCTCGTAGAGATGTTC AAACGACTATATTTATTGATGAGGGTTGGGCTTTTAGTGCTTCAAGACAAGGTAAAAAAGTTGGTAAGCGTATAAAAAGA ACGGGACGTTCTGAGAATAATTCACTTGTATTTATTACACAATCGGTAAAAGATAAAGCAGATGATGATGGTGGTAACTT TGGTTGTCATTTTGCATTTGATGAAAAAGATGAACGTGAGGATATTTTAAAATCTTTAGGCTTAGAATATTCAAAAGAAT CTCCTGAAAATATGGAGATGTTGAAAGATTTGAAGAAAGGTCAATGTATATTCAGTGATTTTTATGGACGTGTTGGAAAA ATGGTTGTACATTGTCCATTTGAGGAAATGACTGAAGCATTTAGAACACAAGAAGATTCTGCAAGCTCTAAAGCTGAAGA AAAATTTGCGATGTAA Protein sequence : MNLKAPYAGLRDNLLLTKTGEVWAYYRVRSESISTANYDAKEESKKRMRYFLESIKGYQDFHFEMYDHDLDLRNKFKEIS KDFDDEAFNVAEYYSKETIDVLEQELQMITHNSFVMGVKIRELADDAVTLKEILKSTLSDTAERIVSNFGFDVNLDDKIL DKYKTFERDLADSFLGIGGERLTENELAYIIRKPFISNATHDVQEESSRRAITDIYNAVIDPTRLSVLEVENDNEKFYTT TVVVDDFPLDMEYTHLFEKAQNMPFPVECHVKAKIINNEKVKKKFDRAKINHKQQAKEKQDTGDSASEDVQDNLFVLNQM EREVTGSGVFIEWVFMFVIKSDDYRDCKRKAKRLMKRLKETQIYAVNPLADQLQLFYQCLHGNDLFINKYWLQRTTATGI AENLFGVSQSLGTKTGFYIGRIDKFIRSVSREEAVASSRDIILFSLLLAAKGIKGAVSDSPHVLITGQTGKGKSFLAKLL WIYTSFFKGQMLYWDPKSEFAEWFDRVTESKEMQEKYPLFINHLKTFKYVTLNYEDSTNYGCLDPIVFLDGIEANEMLKS VFDEIKSFENYHHIETAIYQAISDTVEERENGKKVGSLNVIEKLQNNEDEHVKNAGDLLFEKTQNNILKLVFSDGTNPAL NIQEKATILQVKGLDMPKADDDTSSYSTSEKNGITLMLLIGKFLEKFGSRRDVQTTIFIDEGWAFSASRQGKKVGKRIKR TGRSENNSLVFITQSVKDKADDDGGNFGCHFAFDEKDEREDILKSLGLEYSKESPENMEMLKDLKKGQCIFSDFYGRVGK MVVHCPFEEMTEAFRTQEDSASSKAEEKFAM |