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PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

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Homologs of ORF32 gene of X99945

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SeD_A1962
( - )

NC_011205
(Salmonella enterica CT_02021853)

0.0

99.5

2) SPUCDC_1197
( - )

NC_022221
(Salmonella enterica CDC1983-67)

0.0

99.4

3) SPUL_1197
( - )

NC_016831
(Salmonella enterica RKS5078)

0.0

99.4

4) SeAg_B1791
( - )

NC_011149
(Salmonella enterica SL483)

0.0

99.2

5) STY1742
( - )

putative pathogenicity island protein (pseudogene)

NC_003198
(Salmonella enterica CT18)

e-221

98.8

6) t1248
( - )

NC_004631
(Salmonella enterica Ty2)

e-221

98.8

• Sequence Alignments

1) SeD_A1962 in NC_011205


>X99945|1|G1|1526980|CAA68203.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|257..1123|ORF32|-|proline 
          Length = 867

 Score = 1676 bits (4326), Expect = 0.0
 Identities = 863/868 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60

Query: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120

Query: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180

Query: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240

Query: 241 tggactattgcgcgttatctcagtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tggactattgcgcgttatctccgtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300

Query: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctggggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420

Query: 421 tggcaacaggaagccatacggctctttaacgctctgacgccaatgtccgatgacgatatc 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540

Query: 541 tatgccagacacgtttataccctcgcggaagaagccgttcatgttcagcgctctaatgcg 600
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 601 cagttcgccgccgaccctacgggttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggca 660
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 721 ctggtactgcgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctct 780
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 ctggtactacgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctct 779

Query: 781 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcctggcagcagccataacccgcatgaagaa 840
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcccggcagcagccataacccgcatgaagaa 839

Query: 841 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 868
           ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 867

2) SPUCDC_1197 in NC_022221


>X99945|1|G1|1526980|CAA68203.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|257..1123|ORF32|-|proline 
          Length = 867

 Score = 1674 bits (4319), Expect = 0.0
 Identities = 862/868 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60

Query: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120

Query: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180

Query: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 tggactattgcgcgttatctcagtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420

Query: 421 tggcaacaggaagccatacggctctttaacgctctgacgccaatgtccgatgacgatatc 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540

Query: 541 tatgccagacacgtttataccctcgcggaagaagccgttcatgttcagcgctctaatgcg 600
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 721 ctggtactgcgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctct 780
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 781 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcctggcagcagccataacccgcatgaagaa 840
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcccggcagcagccataacccgcatgaagaa 839

Query: 841 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 868
           ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 867

3) SPUL_1197 in NC_016831


>X99945|1|G1|1526980|CAA68203.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|257..1123|ORF32|-|proline 
          Length = 867

 Score = 1674 bits (4319), Expect = 0.0
 Identities = 862/868 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60

Query: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120

Query: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180

Query: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240

Query: 241 tggactattgcgcgttatctcagtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tggactattgcgcgttatctccgtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300

Query: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctagggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctggggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360

Query: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420

Query: 421 tggcaacaggaagccatacggctctttaacgctctgacgccaatgtccgatgacgatatc 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tggcaacaggaagccatacggctctttaacgctctgacgccaatgtccgatgacgatatc 480

Query: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540

Query: 541 tatgccagacacgtttataccctcgcggaagaagccgttcatgttcagcgctctaatgcg 600
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 601 cagttcgccgccgaccctacgggttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggca 660
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 cagttcgccgccgaccctacggtttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggca 659

Query: 661 aatggcaaacttgccgactgggatattacgccccatttgtgccagatacgctgtcctgtt 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 aatggcaaacttgccgactgggatattacgccccatttgtgccagatacgctgtcctgtt 719

Query: 721 ctggtactgcgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctct 780
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 ctggtactacgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctct 779

Query: 781 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcctggcagcagccataacccgcatgaagaa 840
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcccggcagcagccataacccgcatgaagaa 839

Query: 841 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 868
           ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 867

4) SeAg_B1791 in NC_011149


>X99945|1|G1|1526980|CAA68203.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|257..1123|ORF32|-|proline 
          Length = 867

 Score = 1667 bits (4302), Expect = 0.0
 Identities = 860/868 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60

Query: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcacggcggcccttct 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120

Query: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180

Query: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgccgacgcgtctttc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240

Query: 241 tggactattgcgcgttatctccgtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tggactattgcgcgttatctccgtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300

Query: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctggggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctggggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360

Query: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccagttcgccggccagtatcgccctg 420

Query: 421 tggcaacaggaagccatacggctctttaacgctctgacgccaatgtccgatgacgatatc 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tggcaacaggaagccatacggctctttaacgctctgacgccaatgtccgatgacgatatc 480

Query: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaaacgtcattatgcccgccgtcatttatcaaaacccaccggaacagctggtcgcttat 540

Query: 541 tatgccaggcacgtttataccctcgcggaagaagccgttcatgttcagcgatctaatgcg 600
           |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 541 tatgccagacacgtttatacc-tcgcggaagaagccgttcatgttcagcgctctaatgcg 599

Query: 601 cagttcgccgccgaccctacgggttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggca 660
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 cagttcgccgccgaccctacggtttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggca 659

Query: 661 aatggcaaacttgccgactgggatattacgccccatttgtgccagatacgctgtcctgtt 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 aatggcaaacttgccgactgggatattacgccccatttgtgccagatacgctgtcctgtt 719

Query: 721 ctggtactacgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgctgctctct 780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 720 ctggtactacgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctct 779

Query: 781 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcctggcagcagccataacccgcatgaagaa 840
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 cacatttcagactgccgcgcggtcactattcccggcagcagccataacccgcatgaagaa 839

Query: 841 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 868
           ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 aatatcgcgccctgcctcgcagcggtaa 867

5) STY1742 in NC_003198


>X99945|1|G1|1526980|CAA68203.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|257..1123|ORF32|-|proline 
          Length = 867

 Score = 765 bits (1975), Expect = e-221
 Identities = 394/398 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaatgatacttatctctatggcgaaatgttttctgaaaacatattgacaagctatcgg 60

Query: 61  atttatggcgacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  atttatggagacagaaaatcattactcacgccgctcattatccttcatggcggcccttct 120

Query: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggcggctttgattatttattaaattatcgccgtctggctgatgacgggcgcatggtaata 180

Query: 181 ttttacgatcaatatggttgcggtcgttcaacgcattttcctcatgccgacgcgtctttc 240
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 181 ttttacgatcaatatggctgcggtcgttcaacgcattttcctcatgctgacgcgtctttc 240

Query: 241 tggactattgcgcgttatctccgtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattggg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 241 tggactattgcgcgttatctccgtcaattaacccaattaattcatcacctgggtattgga 300

Query: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctggggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cacgggtattcgatactgggacattcctggggcggaatgcttgccgcagagcacgcctgc 360

Query: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccag 398
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttacagcctgccgggcttcgcgggacgatactggccag 398


 Score = 506 bits (1306), Expect = e-143
 Identities = 261/265 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 399 ttcgccgccgaccctacgggttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggcaaat 458
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 603 ttcgccgccgaccctacggtttatcacattttatggggaaccaatgaactggcggcaaat 662

Query: 459 ggcaaacttgccgactgggatattacgccccatttgtgccagatacgctgtcctgttctg 518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 663 ggcaaacttgccgactgggatattacgccccatttgtgccagatacgctgtcctgttctg 722

Query: 519 gtactacgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgctgctctctcac 578
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 723 gtactacgcggcgaaaacgatcaggcaaccgagcgcgtcgtctctccgcttctctctcac 782

Query: 579 atttcagactgccgcgcggtcactattcctggcagcagccataacccgcatgaagaaaat 638
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 783 atttcagactgccgcgcggtcactattcccggcagcagccataacccgcatgaagaaaat 842

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6) t1248 in NC_004631


>X99945|1|G1|1526980|CAA68203.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|257..1123|ORF32|-|proline 
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