Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SF2983 gene of NC_004337_P1

15

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) unnamed
( - )

-

NC_010473
(Escherichia coli K-12)

0.0

100

2) join
( - )

-

NC_003384
(Salmonella enterica CT18)

0.0

100

3) unnamed
( - )

-

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.9

4) unnamed
( - )

-

NC_010473
(Escherichia coli K-12)

0.0

99.5

5) unnamed
( - )

-

NC_010473
(Escherichia coli K-12)

0.0

99.2

6) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

7) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

8) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

9) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

10) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

11) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

12) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

13) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

14) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

15) unnamed
( - )

-

NC_006905
(Salmonella enterica SC-B67)

0.0

99.2

• Sequence Alignments

1) unnamed in NC_010473


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2356 bits (6079), Expect = 0.0
 Identities = 1209/1209 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 108  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 168  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 228  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 288  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 348  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 408  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 468  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 528  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 588  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 648  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 708  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 768  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 828  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 888  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 948  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1008 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1068 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1128 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1188 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1248 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1308 aaattatga 1316
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209

2) join in NC_003384


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2356 bits (6079), Expect = 0.0
 Identities = 1209/1209 (100%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 7    tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 66
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 67   cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 127  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 187  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 247  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 307  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 367  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 427  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 487  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 547  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 607  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 667  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 727  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 787  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 847  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 907  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 967  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1027 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1087 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1147 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1207 ttcgcacat 1215
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

3) unnamed in NC_004337


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2352 bits (6068), Expect = 0.0
 Identities = 1208/1209 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 108  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 168  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 228  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 288  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 348  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 408  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgatct 467
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 468  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 528  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 588  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 648  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 708  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 768  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 828  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 888  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 948  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1008 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1068 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1128 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1188 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1248 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1308 aaattatga 1316
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209

4) unnamed in NC_010473


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2338 bits (6034), Expect = 0.0
 Identities = 1203/1209 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 108  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 168  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 228  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 288  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 348  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 408  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 468  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 528  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 588  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 648  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 708  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 768  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 828  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 888  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 948  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1008 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1068 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1128 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1188 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1248 ttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttgggg 1307
            | |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1308 aaattatga 1316
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209

5) unnamed in NC_010473


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 108  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 168  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcact 227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 228  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 288  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 348  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 408  attcgtgagcaaaaacgacttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 467
            || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 468  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 528  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 588  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 648  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 708  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 768  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 828  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 888  gcaaaggagccatgggttctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 947
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 948  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1008 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1068 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1128 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1188 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1248 ttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttgggg 1307
            | |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1308 aaattatga 1316
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209

6) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 16   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 75
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 76   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 135
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 136  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 196  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 256  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 316  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 376  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 436  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 496  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 556  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 616  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 676  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 736  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 796  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 856  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 916  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 975
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 976  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1036 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1096 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1156 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1216 ttcgcacat 1224
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

7) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 16   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 75
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 76   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 135
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 136  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 196  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 256  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 316  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 376  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 436  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 496  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 556  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 616  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 676  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 736  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 796  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 856  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 916  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 975
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 976  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1036 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1096 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1156 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1216 ttcgcacat 1224
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

8) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 109  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 169  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcact 228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 229  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 289  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 349  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 409  attcgtgagcaaaaacgacttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 468
            || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 469  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 529  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 589  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 649  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 709  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 769  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 829  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 889  gcaaaggagccatgggttctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 948
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 949  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1009 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1069 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1129 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1189 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1249 ttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttgggg 1308
            | |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1309 aaattatga 1317
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209

9) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 108  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 168  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcact 227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 228  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 288  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 348  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 408  attcgtgagcaaaaacgacttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 467
            || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 468  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 528  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 588  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 648  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 708  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 768  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 828  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 888  gcaaaggagccatgggttctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 947
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 948  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1008 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1068 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1128 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1188 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1248 ttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttgggg 1307
            | |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1308 aaattatga 1316
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209

10) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 19   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 78
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 79   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 138
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 139  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 199  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 259  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 319  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 379  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 439  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 499  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 559  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 619  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 679  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 739  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 799  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 859  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 919  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 978
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 979  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1039 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1099 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1159 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1219 ttcgcacat 1227
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

11) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 15   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 74
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 75   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 134
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 135  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 195  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 255  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 315  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 375  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 435  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 495  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 555  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 615  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 675  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 735  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 795  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 855  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 915  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 974
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 975  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1035 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1095 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1155 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1215 ttcgcacat 1223
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

12) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 15   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 74
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 75   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 134
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 135  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 195  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 255  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 315  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 375  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 435  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 495  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 555  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 615  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 675  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 735  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 795  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 855  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 915  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 974
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 975  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1035 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1095 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1155 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1215 ttcgcacat 1223
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

13) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 17   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 76
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 77   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 136
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 137  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 197  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 257  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 317  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 377  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 437  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 497  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 557  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 617  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 677  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 737  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 797  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 857  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 917  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 976
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 977  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1037 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1097 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1157 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1217 ttcgcacat 1225
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

14) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 17   tcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagc 76
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||
Sbjct: 1209 tcataatttccccaaaacgtaaccatgtgtgaatagattttgagtaagcagggttgcagc 1150

Query: 77   cacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 136
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 cacgagtgagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaa 1090

Query: 137  gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtccca 1030

Query: 197  accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 accttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgat 970

Query: 257  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969  tagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctatggcgtaggcctagtcc 910

Query: 317  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909  gtaggcaggacttttcaagtctcggaaggtttcttcaatctgcattcgcttcgaatagat 850

Query: 377  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaacccatgg 436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 849  attaacaagttgtttgggtgttcgaatttcaacaggtaagttagttgctagaatccatgg 790

Query: 437  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789  ctcctttgccgacgctgagtagattttaggtgacgggtggtgacaatgagtccgtgtcga 730

Query: 497  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729  gcgctgattttttcggcctttagagcgagatttatacaatagaatttggcatgagattgg 670

Query: 557  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669  attgcttttagtcagcctcttatagcctaaagtctttgagtgactagatgacatatcatg 610

Query: 617  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609  taagttgctgataggtttccagttttccgctcctaggtctgcatattgtacttttcctct 550

Query: 677  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549  tactcgacttaaccagtaccaacccagcttctcaacggatttataccatggcactttaaa 490

Query: 737  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489  gccagcatcactgacaatgagcggtgtggtgttactcggtagaatgctcgcaaggtcggc 430

Query: 797  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429  tagaaattggtcatgagctttctttgaacattgctctgaaagcgggaacgctttctcata 370

Query: 857  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagtcgtttttg 916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 369  aagagtaacagaacgaccgtgtagtgcgactgaagctcgcaataccataagccgtttttg 310

Query: 917  ctcacgaatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 976
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309  ctcacggatatcagaccagtcaacaagtacaatgggcatcgtattgcccgaacagataaa 250

Query: 977  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249  gctagcatgccaacggtatacagcgagtcgctctttgtggaggtgacgattacctaacaa 190

Query: 1037 tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189  tcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaag 130

Query: 1097 ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgtt 1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129  ttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaaggcgtggcaagccaacgttaagctgtt 70

Query: 1157 gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69   gagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgag 10

Query: 1217 ttcgcacat 1225
            |||||||||
Sbjct: 9    ttcgcacat 1

15) unnamed in NC_006905


>NC_004337_P1|20|G16|24114247|NP_708757.1|Shigella_flexneri_2a_str._301|-|25255..26463|-|SF2983|iso-IS10R 
          Length = 1209

 Score = 2326 bits (6003), Expect = 0.0
 Identities = 1199/1209 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 110  atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacactta 60

Query: 170  aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcact 229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   aaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttacttgactgtaaaactctcact 120

Query: 230  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  cttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacga 180

Query: 290  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  atcgaccgattgttaggtaatcgtcacctccacaaagagcgactcgctgtataccgttgg 240

Query: 350  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  catgctagctttatctgttcgggcaatacgatgcccattgtacttgttgactggtctgat 300

Query: 410  attcgtgagcaaaaacgacttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 469
            || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  atccgtgagcaaaaacggcttatggtattgcgagcttcagtcgcactacacggtcgttct 360

Query: 470  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gttactctttatgagaaagcgttcccgctttcagagcaatgttcaaagaaagctcatgac 420

Query: 530  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  caatttctagccgaccttgcgagcattctaccgagtaacaccacaccgctcattgtcagt 480

Query: 590  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  gatgctggctttaaagtgccatggtataaatccgttgagaagctgggttggtactggtta 540

Query: 650  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  agtcgagtaagaggaaaagtacaatatgcagacctaggagcggaaaactggaaacctatc 600

Query: 710  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  agcaacttacatgatatgtcatctagtcactcaaagactttaggctataagaggctgact 660

Query: 770  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaaagcaatccaatctcatgccaaattctattgtataaatctcgctctaaaggccgaaaa 720

Query: 830  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  aatcagcgctcgacacggactcattgtcaccacccgtcacctaaaatctactcagcgtcg 780

Query: 890  gcaaaggagccatgggttctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 949
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  gcaaaggagccatggattctagcaactaacttacctgttgaaattcgaacacccaaacaa 840

Query: 950  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  cttgttaatatctattcgaagcgaatgcagattgaagaaaccttccgagacttgaaaagt 900

Query: 1010 cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  cctgcctacggactaggcctacgccatagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatc 960

Query: 1070 atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcag 1020

Query: 1130 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 aaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctca 1080

Query: 1190 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 acagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagac 1140

Query: 1250 ttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttgggg 1309
            | |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1141 tcactcgtggctgcaaccctgcttactcaaaatctattcacacatggttacgttttgggg 1200

Query: 1310 aaattatga 1318
            |||||||||
Sbjct: 1201 aaattatga 1209