Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of STY0292 gene of NC_003198_P1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SPA2498
( - )

NC_006511
(Salmonella enterica ATCC 9150)

0.0

98.8

2) SSPA2330a
( - )

NC_011147
(Salmonella enterica AKU12601)

0.0

98.8

3) SG0294
( - )

NC_011274
(Salmonella enterica 287/91)

0.0

98.7

4) SEEB0189_22950
( - )

NC_021844
(Salmonella enterica CFSAN000189)

0.0

98.7

5) SPAB_03312
( - )

NC_010102
(Salmonella enterica SGSC4150; SPB7)

0.0

98.7

• Sequence Alignments

1) SPA2498 in NC_006511


>NC_003198_P1|8|G7|16759257|NP_454874.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|-|5655..6557|STY0292|-|hypothetical 
          Length = 903

 Score = 1734 bits (4474), Expect = 0.0
 Identities = 892/903 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60

Query: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120

Query: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180

Query: 181 attgttaatcactctgatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attgttaatcactcggatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240

Query: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300

Query: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360

Query: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420

Query: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgtcctcttacaccggccatgaagcg 480
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgccctcttacaccggccatgaagcg 480

Query: 481 gatagcacgctacactagctttaccaagaatatcagcaggcattgcggccctccgggcag 540
           ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggccttgcggccctccgggcag 540

Query: 541 gaaaagcccctccgtgctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaagcccctccgtcctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600

Query: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgacaccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgataccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660

Query: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720

Query: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgatatcctgcaactgctctcaccggaactggcggggaaa 780
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||
Sbjct: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgatatcctacaactgctctcgccggaaatgggggggaaa 780

Query: 781 accgcacatagcgagatactgcccgatctgacccgccgcgagcatcgtattattggcatc 840
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 accgcacatagcgagatactgcccgatctgacccgccgcgagcatcgtattattggcatc 840

Query: 841 gatagccactaccgaatcactccgacacagaaaaatggaaataccgcccatgaaaaaaac 900
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gatagccactaccgaatcactccgacacagaaaaatggaaataccgcccatgaaaaaaac 900

Query: 901 tga 903
           |||
Sbjct: 901 tga 903

2) SSPA2330a in NC_011147


>NC_003198_P1|8|G7|16759257|NP_454874.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|-|5655..6557|STY0292|-|hypothetical 
          Length = 903

 Score = 1713 bits (4420), Expect = 0.0
 Identities = 881/892 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60

Query: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120

Query: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180

Query: 181 attgttaatcactctgatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attgttaatcactcggatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240

Query: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300

Query: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360

Query: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420

Query: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgtcctcttacaccggccatgaagcg 480
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgccctcttacaccggccatgaagcg 480

Query: 481 gatagcacgctacactagctttaccaagaatatcagcaggcattgcggccctccgggcag 540
           ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggccttgcggccctccgggcag 540

Query: 541 gaaaagcccctccgtgctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaagcccctccgtcctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600

Query: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgacaccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgataccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660

Query: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720

Query: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgatatcctgcaactgctctcaccggaactggcggggaaa 780
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||
Sbjct: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgatatcctacaactgctctcgccggaaatgggggggaaa 780

Query: 781 accgcacatagcgagatactgcccgatctgacccgccgcgagcatcgtattattggcatc 840
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 accgcacatagcgagatactgcccgatctgacccgccgcgagcatcgtattattggcatc 840

Query: 841 gatagccactaccgaatcactccgacacagaaaaatggaaataccgcccatg 892
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gatagccactaccgaatcactccgacacagaaaaatggaaataccgcccatg 892

3) SG0294 in NC_011274


>NC_003198_P1|8|G7|16759257|NP_454874.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|-|5655..6557|STY0292|-|hypothetical 
          Length = 903

 Score = 1428 bits (3686), Expect = 0.0
 Identities = 734/744 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60

Query: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120

Query: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180

Query: 181 attgttaatcactctgatgaactgtgttgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240
           |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attgttaatcactcggatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240

Query: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300

Query: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360

Query: 361 gaatctgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420

Query: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcatcctcttacactggccatgaagcg 480
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgccctcttacaccggccatgaagcg 480

Query: 481 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggcattgcggccctccgggcag 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggccttgcggccctccgggcag 540

Query: 541 gaaaagcccctccgtgctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaagcccctccgtcctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600

Query: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgacaccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgataccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660

Query: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgaaggtgaaatgcactgg 720
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720

Query: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgat 744
           ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgat 744

4) SEEB0189_22950 in NC_021844


>NC_003198_P1|8|G7|16759257|NP_454874.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|-|5655..6557|STY0292|-|hypothetical 
          Length = 903

 Score = 1419 bits (3662), Expect = 0.0
 Identities = 734/745 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60

Query: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgcc-ccccctacattccgcttttt 119
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120

Query: 120 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 179
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180

Query: 180 attgttaatcactctgatgaactgtgttgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 239
           |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attgttaatcactcggatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240

Query: 240 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300

Query: 300 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360

Query: 360 gaatctgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 419
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420

Query: 420 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcatcctcttacactggccatgaagcg 479
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgccctcttacaccggccatgaagcg 480

Query: 480 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggcattgcggccctccgggcag 539
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggccttgcggccctccgggcag 540

Query: 540 gaaaagcccctccgtgctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 599
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaagcccctccgtcctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600

Query: 600 acgtcgttatacgataaaaagggcgacaccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 659
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgataccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660

Query: 660 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgaaggtgaaatgcactgg 719
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720

Query: 720 ctggcgatggaatcaatgcccgata 744
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgata 745

5) SPAB_03312 in NC_010102


>NC_003198_P1|8|G7|16759257|NP_454874.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|-|5655..6557|STY0292|-|hypothetical 
          Length = 903

 Score = 1417 bits (3658), Expect = 0.0
 Identities = 733/744 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaacaagacatgtgggaattacggaaaatacagtcgcagggtataacggataacgca 60

Query: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgcc-ccccctacattccgcttttt 119
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagtatcccgcagggacatacatcgtatttactgccgccgccccctacattccgcttttt 120

Query: 120 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 179
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagcaacatgggaaagacgatatcgcgctcagtcttgttcgccacgaagaggcgtggtgg 180

Query: 180 attgttaatcactctgatgaactgtgttgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 239
           |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attgttaatcactcggatgaactgtgctgtgccgtcaatgagcaggtgatggaacctcat 240

Query: 240 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 caccgtatgcggctgaatgatggagatacgattgaatggggtctgtcatcctggtgcctt 300

Query: 300 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gcccgcaccaatgatgagtcccgtcccgatgtttcgtttcctcagttggttcagtcatct 360

Query: 360 gaatctgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 419
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatccgttgctgagtacctggatctggactggtttaaacaacaacagctcaatccgcag 420

Query: 420 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcatcctcttacactggccatgaagcg 479
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 aacccgttcgatattattcccgtccgggaaaccgcgccctcttacaccggccatgaagcg 480

Query: 480 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggcattgcggccctccgggcag 539
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gatagcacgctacaccagctttaccaggaatatcagcaggccttgcggccctccgggcag 540

Query: 540 gaaaagcccctccgtgctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 599
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaagcccctccgtcctaaaccgtttccccgaaatgaagacgctgtcacccaggatttg 600

Query: 600 acgtcgttatacgataaaaagggcgacaccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 659
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 acgtcgttatacgataaaaagggcgataccgacacgttacaggatatggtggcaggcgcg 660

Query: 660 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgaaggtgaaatgcactgg 719
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 661 cccggtattgatgccattctggatacgctggacacgaccggtgagggtgaaatgcactgg 720

Query: 720 ctggcgatggaatcaatgcccgat 743
           ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ctggcgatggaatcaatgcccgat 744