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Homologs of glcF gene of AJ617685

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) c3707
( - )

NC_004431
(Escherichia coli CFT073)

0.0

2) glcF
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

98.2

3) glcF
( - )

NC_011745
(Escherichia coli ED1a)

0.0

98.1

• Sequence Alignments

1) c3707 in NC_004431


>AJ617685|95|G93|47155044|CAE85243.1|Escherichia_coli_536|-|90883..92106|glcF|-|GlcF 
          Length = 1224

 Score = 2334 bits (6024), Expect = 0.0
 Identities = 1200/1224 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 115  atgcaaacccgattaacagaagagatgcggcagaacgcgcgcgcgctggaagccgacagc 174
            |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgcaaacccaattaaccgaagagatgcggcagaacgcgcgggcgctggaagccgacagc 60

Query: 175  atcctgcgcgcctgtgttcactgcggattttgtaccgcaacctgcccaacctatcagctt 234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 61   atcctgcgcgcctgtgttcactgcggattttgtaccgcaacctgcccaacctatcagctc 120

Query: 235  ctgggcgatgaactggacgggccgcgcgggcgcatctatctgattaaacaggtgctggaa 294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  ctgggcgatgaactggacgggccgcgcgggcgcatctatctgattaaacaggtgctggaa 180

Query: 295  ggtaacgaagtcacgcttaaaacacaggagcatctcgatcgctgtctcacttgccgcaat 354
            || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181  ggcaacgacgtcacgcttaaaacacaggagcatctcgatcgctgcctcacttgccgcaat 240

Query: 355  tgtgaaaccacctgtccttctggtgtgcgttatcacaatttgctggatatcgggcgtgat 414
            ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  tgtgaaaccacctgtccttctggtgtgcgctatcacaatttgctggatatcgggcgtgat 300

Query: 415  attgtcgagcagaaagtgaaacgcccactgccggagcgaatgctgcgcgaaggattgcgc 474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  attgtcgagcagaaagtgaaacgcccactgccggagcgaatgctgcgcgaaggattgcgc 360

Query: 475  caggtagtgccgcgtccggcggtcttccgtgcgctgacgcaggtagggctggtgctgcga 534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  caggtagtgccgcgtccggcggtcttccgtgcgctgacgcaggtagggctggtgctgcga 420

Query: 535  ccgtttttaccggaacaggtcagagcaaaactgcctgctgaaaccgtgaaagctaaaccg 594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  ccgtttttaccggaacaggtcagagcaaaactgcctgctgaaaccgtgaaagctaaaccg 480

Query: 595  cgtccaccactgcgccataagcgtcgggttttaatgctggaaggctgcgcccagcctacg 654
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  cgtccaccgctgcgccataagcgtcgggttttaatgctggaaggctgcgcccagcctacg 540

Query: 655  ctttcgcccaacaccaacgcggcaactgcgcgagtgctggatcgtctggggatcagcgtc 714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  ctttcgcccaacaccaacgcggcaactgcgcgagtgctggatcgtctggggatcagcgtc 600

Query: 715  atgccagctaacgaagcaggctgttgtggcgcggtggactatcatcttaatgcgcaagag 774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  atgccagctaacgaagcaggctgttgtggcgcggtggactatcatcttaatgcgcaagag 660

Query: 775  aaagggttagcgcgggcgcgcaataatattgatgcctggtggcccgcgattgaagcaggt 834
            |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaagggctggcgcgggcgcgaaataatattgatgcctggtggcccgcgattgaagcaggt 720

Query: 835  gccgaggcaattttgcaaaccgccagcggttgtggcgcgtttgtcaaagagtatgggcag 894
            |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  gccgaggctatattgcagactgccagcggctgcggcgcgtttgtcaaagagtatgggcag 780

Query: 895  atgctgaaaaacgatgcgttgtatgccgataaagcgcgtctggtcagtgaactggcggtc 954
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||
Sbjct: 781  atgctgaaaaacgatgcgttgtatgccgataaagcgcgtcaggttagtgagctggcggtc 840

Query: 955  gatttagtcgaacttctgcgcgaggaaccgctggaaaaactggcaattcgcggcgataaa 1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  gatttagtcgaacttctgcgcgaggaaccgctggaaaaactggcaattcgcggcgataaa 900

Query: 1015 aaactggccttccactgcccgtgtaccctacaacatgcgcaaaagctgaacggcgaagtg 1074
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 901  aaactggccttccactgcccgtgtaccctacaacatgcgcaaaagctgaatggcgaagtg 960

Query: 1075 gaaaaagtgttgcttcgtcttggatttaccttaacggacgttcccgacagccatctgtgc 1134
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  gaaaaagtgttacttcgtcttggatttaccttaacggacgttcccgacagccatctgtgc 1020

Query: 1135 tgcggttcagcgggaacatatgcgttaacgcatcccgatctggcacgccagctgcgggat 1194
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1021 tgcggttcagcgggaacatatgcgttaacgcatcccgatctggcgcgccagctgcgggat 1080

Query: 1195 aacaaaatgaatgcgctggaaagcggcaaaccggaaatgatcgtcaccgccaacattggt 1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 aacaaaatgaatgcgctggaaagcggcaaaccggaaatgatcgtcaccgccaacattggt 1140

Query: 1255 tgccagacgcatctggcgagcgccggtcgtacctctgtgcgtcactggattgaaattgta 1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tgccagacgcatctggcgagcgccggtcgtacctctgtgcgtcactggattgaaattgta 1200

Query: 1315 gaacaagcccttgaaaaggaataa 1338
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gaacaagcccttgaaaaggaataa 1224

2) glcF in NC_004337


>AJ617685|95|G93|47155044|CAE85243.1|Escherichia_coli_536|-|90883..92106|glcF|-|GlcF 
          Length = 1224

 Score = 2325 bits (5998), Expect = 0.0
 Identities = 1198/1224 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    atgcaaacccgattaaccgaagagatgcggcagaacgc----gcgctggaagccgacagc 56
            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgcaaacccaattaaccgaagagatgcggcagaacgcgcgggcgctggaagccgacagc 60

Query: 57   atcctgtgcgcctgtgttcactgcggattttgtaccgcaacctgcccaacctatcagctt 116
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 61   atcctgcgcgcctgtgttcactgcggattttgtaccgcaacctgcccaacctatcagctc 120

Query: 117  ctgggcgatgaactggacgggccgcgcgggcgcatctatctgattaaacaggtgctggaa 176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  ctgggcgatgaactggacgggccgcgcgggcgcatctatctgattaaacaggtgctggaa 180

Query: 177  ggcaacgaagtcacgcttaaaacacaggagcatctcgatcgctgcctcacttgccgcaat 236
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  ggcaacgacgtcacgcttaaaacacaggagcatctcgatcgctgcctcacttgccgcaat 240

Query: 237  tgtgaaaccacctgtccttctggtgtgcgctatcacaatttgctggatatcgggcgtgat 296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  tgtgaaaccacctgtccttctggtgtgcgctatcacaatttgctggatatcgggcgtgat 300

Query: 297  attgtcgagcagaaagtgaaacgcccactgccggagcgaatgctgcgcgaaggattgcgc 356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  attgtcgagcagaaagtgaaacgcccactgccggagcgaatgctgcgcgaaggattgcgc 360

Query: 357  caggtagtgccgcgtccggcggtcttccgtgcgctgacgcaggtagggctggtgctgcga 416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  caggtagtgccgcgtccggcggtcttccgtgcgctgacgcaggtagggctggtgctgcga 420

Query: 417  ccgtttttaccggaacaggtcagagcaaaactgcctgctgaaacggtgaaagctaaaccg 476
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 421  ccgtttttaccggaacaggtcagagcaaaactgcctgctgaaaccgtgaaagctaaaccg 480

Query: 477  cgtccgccgctgcgccataagcgtcgggttttaatgctggaaggctgcgcccagcctacg 536
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  cgtccaccgctgcgccataagcgtcgggttttaatgctggaaggctgcgcccagcctacg 540

Query: 537  ctttcgcccaacaccaacgcggcaactgcgcgagtgctggatcgtctggggatcagcgtc 596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  ctttcgcccaacaccaacgcggcaactgcgcgagtgctggatcgtctggggatcagcgtc 600

Query: 597  atgtcagctaacgaagcaggctgttgtggcgcggtggactatcatcttaatgcgcaggag 656
            ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 601  atgccagctaacgaagcaggctgttgtggcgcggtggactatcatcttaatgcgcaagag 660

Query: 657  aaagggttggcacgggcgcgcaataatattgatgcctggtggcccgcgattgaagcaggt 716
            |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  aaagggctggcgcgggcgcgaaataatattgatgcctggtggcccgcgattgaagcaggt 720

Query: 717  gccgaggcaattttgcaaaccgccagcggttgcggcgcgttcgtcaaagagtatgggcag 776
            |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 721  gccgaggctatattgcagactgccagcggctgcggcgcgtttgtcaaagagtatgggcag 780

Query: 777  atgctgaaaaacgatgcgttatatgccgataaagcgcgtcaggtcagtgaactggcggtc 836
            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 781  atgctgaaaaacgatgcgttgtatgccgataaagcgcgtcaggttagtgagctggcggtc 840

Query: 837  gatttagtcgaacttctgcgcgaggaaccgctggaaaaactggcaattcgcggcgataaa 896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  gatttagtcgaacttctgcgcgaggaaccgctggaaaaactggcaattcgcggcgataaa 900

Query: 897  aaactggccttccactgcccgtgtaccctacaacatgcgcaaaagctgaacggcgaagtg 956
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 901  aaactggccttccactgcccgtgtaccctacaacatgcgcaaaagctgaatggcgaagtg 960

Query: 957  gaaaaagtgttacttcgtcttggatttaccttaacggacgttcccgacagccatctgtgc 1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  gaaaaagtgttacttcgtcttggatttaccttaacggacgttcccgacagccatctgtgc 1020

Query: 1017 tgcggttcagcgggaacatatgcgttaacgcatcccgatctggcacgccagctgcgggat 1076
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1021 tgcggttcagcgggaacatatgcgttaacgcatcccgatctggcgcgccagctgcgggat 1080

Query: 1077 aacaaaatgaatgcgctggaaagcggcaaaccggaaatgatcgtcaccgccaacattggt 1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 aacaaaatgaatgcgctggaaagcggcaaaccggaaatgatcgtcaccgccaacattggt 1140

Query: 1137 tgccagacgcatctggcgagcgccggtcgtacctctgtgcgtcactggattgaaattgta 1196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tgccagacgcatctggcgagcgccggtcgtacctctgtgcgtcactggattgaaattgta 1200

Query: 1197 gaacaagcccttgaaaaggaataa 1220
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gaacaagcccttgaaaaggaataa 1224

3) glcF in NC_011745


>AJ617685|95|G93|47155044|CAE85243.1|Escherichia_coli_536|-|90883..92106|glcF|-|GlcF 
          Length = 1224

 Score = 1833 bits (4731), Expect = 0.0
 Identities = 942/960 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    gtgcgttatcacaatttgctggatatcgggcgtgatattgtcgagcagaaagtgaaacgc 60
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 265  gtgcgctatcacaatttgctggatatcgggcgtgatattgtcgagcagaaagtgaaacgc 324

Query: 61   ccactgccggagcgaatgctgcgcgaaggattgcgccaggtagtgccgcgtccggcggtc 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 325  ccactgccggagcgaatgctgcgcgaaggattgcgccaggtagtgccgcgtccggcggtc 384

Query: 121  ttccgtgcgctgacgcaggtagggctggtgctgcgaccgtttttaccggaacaggtcaga 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385  ttccgtgcgctgacgcaggtagggctggtgctgcgaccgtttttaccggaacaggtcaga 444

Query: 181  gcaaaactgcctgctgaaacggtgaaagctaaaccgcgtccgccgctgcgccataagcgt 240
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 445  gcaaaactgcctgctgaaaccgtgaaagctaaaccgcgtccaccgctgcgccataagcgt 504

Query: 241  cgggttttaatgctggaaggctgcgcccagcctacgctttcgcccaacaccaacgcggca 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505  cgggttttaatgctggaaggctgcgcccagcctacgctttcgcccaacaccaacgcggca 564

Query: 301  actgcgcgagtgctggatcgtctggggatcagcgtgacgccagctaacgaagcaggctgt 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 565  actgcgcgagtgctggatcgtctggggatcagcgtcatgccagctaacgaagcaggctgt 624

Query: 361  tgtggcgcggtggactatcatcttaatgcgcaagagaaagggctggcgcgggcgcgcaat 420
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 625  tgtggcgcggtggactatcatcttaatgcgcaagagaaagggctggcgcgggcgcgaaat 684

Query: 421  aatattgatgcctggtggcccgcgattgaagcaggtgtcgaggcaattttgcaaaccgcc 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||
Sbjct: 685  aatattgatgcctggtggcccgcgattgaagcaggtgccgaggctatattgcagactgcc 744

Query: 481  agcggttgcggcgcgttcgttaaagagtatgggcagatgctgaaaaacgatgcgttgtat 540
            ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 745  agcggctgcggcgcgtttgtcaaagagtatgggcagatgctgaaaaacgatgcgttgtat 804

Query: 541  gccgataaagcgcgtcaggtcagtgagctggcggtcgatttagtcgaacttctgcgcgag 600
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 805  gccgataaagcgcgtcaggttagtgagctggcggtcgatttagtcgaacttctgcgcgag 864

Query: 601  gaaccgctggaaaaactggcaattcgcggcgataaaaaactggccttccactgcccatgt 660
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 865  gaaccgctggaaaaactggcaattcgcggcgataaaaaactggccttccactgcccgtgt 924

Query: 661  accctacaacatgcgcaaaagctgaacggcgaagtggaaaaagtgttacttcgtcttgga 720
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 925  accctacaacatgcgcaaaagctgaatggcgaagtggaaaaagtgttacttcgtcttgga 984

Query: 721  tttaccttaacggacgttcccgacagccatctgtgctgcggttcagcgggaacatatgcg 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 985  tttaccttaacggacgttcccgacagccatctgtgctgcggttcagcgggaacatatgcg 1044

Query: 781  ttaacgcatcccgatctggcacgccagctgcgggataacaaaatgaatgcgctggaaagc 840
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1045 ttaacgcatcccgatctggcgcgccagctgcgggataacaaaatgaatgcgctggaaagc 1104

Query: 841  ggcaaaccggaaatgatcgtcaccgccaacattggttgccagacgcatctggcgagcgcc 900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1105 ggcaaaccggaaatgatcgtcaccgccaacattggttgccagacgcatctggcgagcgcc 1164

Query: 901  ggtcgtacctctgtgcgtcactggattgaaattgtagaacaagcccttgaaaaggaataa 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1165 ggtcgtacctctgtgcgtcactggattgaaattgtagaacaagcccttgaaaaggaataa 1224